1950年5月15日，馬來亞時間凌晨三點，馬來亞空軍二十架飛機突然出現在印尼首都雅加達機場上空，將印尼的三十多架破爛飛機盡皆摧毀在地面。凌晨四時，集結於新加坡的馬來亞國防軍以迅雷不及掩耳的閃電攻勢，向蘇門答臘的印尼軍發動了猛攻。戰鬥開始後，馬來亞空軍擁有了絕對的制空權，三百門大炮一起怒吼，把炮彈傾泄在印尼軍陣地上。由於馬來亞軍隊準備充分，又事先在加裡曼丹島增兵進行了迷惑行動，使得印尼軍對此次進攻措手不及。
早上七時，馬來亞軍隊突破了印尼軍的防線，以裝甲部隊爲核心，在飛機的掩護指引下，迅速向前推進。早上七時三十分，廖內省的獨立分子開始進行配合作戰，他們襲擊小股印尼軍，爲馬來亞飛機指示轟炸目標，造成了印尼軍極大的被動，影響了印尼軍向北幹阿魯集結組織新防線的計劃。早上九時，馬來亞軍隊攻取布阿旦，然後突然南下攻擊前進，在廖內省獨立分子的指引下，橫穿廖內省，向沙哇倫多前進，目的是切斷在北蘇門答臘的印尼軍隊的退路而一舉殲滅之。
與此同時，加裡曼丹島上的馬來亞軍隊也發起了猛烈的進攻，攻入印尼的西加裡曼丹省，並派飛機轟炸了西加裡曼丹省的首府坤甸。說打就打，迅如雷霆，馬來亞國防軍稟持着一貫的兇悍作風，一年多的時間使得馬來亞國防軍成爲了一支各兵種相對齊全，武器較爲先進地強軍。而印尼的戰亂頻繁。又與英美交惡，使得印尼軍的硬件水平遠遜於馬來亞軍隊，雖然印尼軍的總人數是馬來亞軍隊的四倍，但卻分散在各個省，戰鬥力也遠遜於馬來亞軍隊。相對於馬來亞的處心積慮，印尼軍明顯沒有預料到馬來亞軍隊會如此迅猛地攻入蘇門答臘。
5月16日。亞齊省的自由亞齊組織開始武裝暴動，猛烈攻擊省內已經所剩不多地印尼軍隊。
5月17日。馬來亞軍隊進行空降作戰，成立只一年的馬來亞空降旅突然出現在沙哇倫多，並擊潰了該地守軍，堵住了印尼軍南下的道路。
5月18日。馬來亞空降旅在空軍的配合下。擊退南下印尼軍地多次進攻，成功堅守至黃昏陸軍裝甲部隊地到來。林雷
5月19日、20日，後續部隊源源不斷趕到，留下阻擊部隊後，大舉南下，開始猛烈進攻南蘇門答臘地區。
印尼方面在經歷了短暫的震驚之後，於5月16日發佈了總動員令，並向蘇門答臘增兵，總統蘇加諾發表演說。號召印尼人民行動起來，英勇抵抗美帝國主義的走狗兼打手馬來亞的侵略。
由於戰爭的起因是由於印尼支持馬來亞分裂分子，所以印尼在國際上並未獲得廣泛的同情的支持，只有蘇聯、中國、澳大利亞等國表示了對印尼的支持，並呼籲雙方立即停火。用政治方式解決兩國的爭端。
英、美對馬來亞收復北加裡曼丹領土是支持地。但他們並沒有預料到馬來亞竟然會採取如此強悍、兇猛的軍事行動。在馬來亞國防軍攻入蘇門答臘的時候，紛紛給吳銘打來電話。對戰爭的擴大表示了擔憂。
然而就在蘇門答臘的亞齊省和廖內省於5月20日宣佈獨立後，英、美兩國地態度發生了明顯地改變，立即承認了亞齊省和廖內省獨立的現實，並對蘇門答臘人民地自主選擇表示了欽佩和支持。
“這就是國與國之間的關係，象小孩子變臉一樣容易。”吳銘揮舞着美國方面的電報冷笑着說道：“利益，都是爲了利益，亞齊省和廖內省有豐富的石油天然氣資源，扼守着馬六甲海峽的一端，地理位置非常重要。如今又是他們自己宣佈獨立的，美英兩國可以不擔負國際上的輿論壓力，便象兩條瘋狗一樣撲了上來。”
“他們不是還得經過我們這一關嗎？”趙笑眉笑道：“美國方面又提供了一批免費軍援，並派團來協商共同開發事宜，也算是給面子了，不象英國，死摳。”
“自從那個混蛋麥卡錫出來搗亂，美國國內形勢很壞，有成千上萬的華裔和亞裔被懷疑爲間諜。他們不僅被非法傳訊，不準寄錢給中國的親人，甚至被禁止公開談論自己的家鄉，還有不少人因被指責同情共產黨而受監禁、被驅逐甚至遭暗殺。”吳銘點着根香菸，在煙霧繚繞中緩緩說道：“很多在美國工作的華裔科學家也受到了聯邦調查局的傳訊，國家安全許可證被吊銷，已經不能繼續從事研究，甚至不能留在實驗室裡工作了。借這個機會，我們是否可以犧牲一些實際的利益，來幫助他們擺脫困境。”
鄭蘋如沉思了一下，說道：“可以進行一下嘗試，勸說他們暫到馬來亞躲避，當然，這需要美國政府的允許，移民局和聯邦調查局鬆口才行。”
“那就這麼辦吧！”吳銘點了點頭，“如果事情順利，爲他們提供住所和研究環境，雖然他們不一定會定居馬來亞，但總是華人，同根同源，能幫他們就幫一些。”
戰爭還在繼續，印尼向南蘇門答臘不斷增兵，集結於哥拉布米，妄圖先阻止馬來亞軍隊的南進勢頭後，再力圖反攻。近十萬印尼軍與三萬馬來亞國防軍於五月二十三日在哥拉布米拉開架勢，形成了決戰的態勢。
五月二十四日，馬來亞海軍突然出現在南蘇門答臘與爪哇島之間，擊沉了三艘印尼船隻，隔絕了爪哇島與蘇門答臘島的聯繫，使得印尼在蘇門答臘的軍隊成爲了一支孤軍。
五月二十五日，印尼總統蘇加諾憤怒的對外宣稱，美國悍然出動軍艦，懸掛馬來亞國旗參與了封鎖蘇門答臘的軍事行動，要求全世界對美國進行譴責，並要求美國軍艦立刻退出該海域，否則將遭受印尼軍民的沉重打擊。
美國政府斷然否認了印尼的指控，重申在馬、印戰爭中嚴守中立，並對由於印尼支持馬來亞分裂分子而引起的這場戰爭表示遺憾。
五月二十六日，馬來亞軍隊在飛機、大炮、坦克的掩護下對印尼軍隊開始了猛攻，海軍艦隻炮轟蘇門答臘的丹戎加和爪哇島的雅加達，並由從加裡曼丹島抽調的五千部隊在丹戎加進行登陸作戰，開始合圍印尼軍隊。
五月三十日，彈盡援絕的印尼軍隊在馬來亞軍隊的兇狠打擊下，陸續放棄抵抗，舉旗投降，馬來亞軍隊開始與亞齊省和廖內省的獨立分子配合掃蕩蘇門答臘島上的印尼殘軍。
六月五日，重新調整完畢的馬來亞軍隊在加裡曼丹島再次發起了強大攻勢，分兵三路進攻印尼的東、西、中加裡曼丹省，而印尼鑑於馬來亞和美國的海軍，不敢增兵，以免重蹈蘇門答臘的悲劇。雖然叫囂的厲害，卻連戰連敗，損失慘重，不得已之下請求國際調停。
六月十五日，馬來亞軍隊已經佔領加裡曼丹島大部，在蘇聯、澳大利亞等國提議下，雙方停火，開始談判。
歷時一個月的馬、印戰爭，馬來亞大獲全勝，雖然這裡面有美國人的影子，但馬來亞國防軍的強大戰力還是讓全世界刮目相看。以不足八萬的兵力，縱橫馳騁，消滅了蘇門答臘島和加裡曼丹島的印尼軍隊近二十萬，將印尼打得毫無還手之力，不能不說是一場巨大的勝利。如果不是迫於國際壓力停火，馬來亞軍隊恐怕能登上爪哇島，攻下印尼的首都雅加達。
停火併不意味着戰爭的結束，馬來亞已經得到了巨大的利益，想要他輕易放棄，恐怕很困難。而且蘇門答臘對馬來亞來說非常重要，戰領此地不僅獨控馬六甲海峽，而且使新加坡這個科技文化教育中心成了一種非常安全的所在，再不用擔心印尼從蘇門答臘的進攻。而且亞齊和廖內獨立後，也非常希望馬來亞軍隊能守住南蘇門答臘，隔開印尼的威脅。
印尼戰敗的後果是非常嚴重的，國內反共的軍人集團和左翼勢力的矛盾日趨尖銳，一場反共、反蘇加諾的政變在印尼右派軍人集團內部暗暗地醞釀着。並且開始積極尋找外部支持，馬來亞和美國自然成了他們的首選。
“不做承諾，保持接觸。”吳銘對瀋陽指示道：“現在時機還不成熟，我們要儘快消化蘇門答臘，亞齊和廖內雖然獨立了，但南蘇門答臘的歸屬還懸而未決，如果沒有合適的理由，國際上必然會要求我們歸還給印尼，這是我們所不願意看到的，新加坡必須要有外部屏障。”
“居民置換的工作正在加緊進行，南蘇門答臘的居民要麼同意我們的提議，要麼遷移到亞齊和廖內，而亞齊和廖內的民衆已經開始向南蘇門答臘集中，支持我們也就是保護他們，這個道理他們還是清楚的。”瀋陽回答道：“但是，我們需要時間，至少要兩個月。”