加西亞作爲戰爭失敗的直接負責人處境艱難，而坐在巴西帝國位子上面的佩德羅二世日子同樣不好過。
戰爭失敗，原本隱藏起來的矛盾全都浮出水面。
國家經濟方面，佩德羅即位前期積累的家底在巴拉圭戰爭中消耗一空，幾十萬青壯年男子從事與戰爭相關的行業，促進了巴西軍事工業的發展，但是對於國家宏觀經濟發展造成重大損失，戰爭前夕正在進行的工業化建設被迫中止，大量的鐵路、工廠建設成了爛尾工程，前期投入的巨大財政資金短時間內看不到盈利的希望。
農業、輕工業發展減緩甚至倒退，在戰爭開始一年後，巴西帝國就開始從英法等國那裡進口日常生活所需的糧食藥品和輕重工業產品，政府和民間積攢的財富迅速流向英法等國，直接促進英法等國工業的發展。
巴西帝國發動戰爭不僅沒有得到一塊土地和一個英鎊的賠款，連最南部的南里奧格蘭州也被華人獨立軍奪去。
偷雞不成蝕把米，佩德羅二世心情十分複雜，即爲當初輕易挑起和巴拉圭的戰爭後悔，也埋怨加西亞作戰失利，讓華人獨立軍鑽了空子致使主力部隊全軍覆沒，假使沒有華人獨立軍橫插一腳，巴拉圭戰事也不會敗的如此難看。
後悔、怨恨，佩德羅二世的心情難以用語言描述清楚，不過即使心裡如何不甘，結局也不能改變，佩德羅二世眼下要做的就是處理戰爭失敗帶來的一系列不利影響。
首先，加西亞作爲保皇派的核心人物，佩德羅二世不能扔下不管，否則不僅會令保皇派寒心，同時也會增加共和派的氣勢，削弱巴西皇室的影響力和皇帝對巴西的控制力。
其次，巴拉圭戰爭失敗後，玻利維亞、秘魯蠢蠢欲動，秘魯向巴西政府遞交了商議兩國有爭議地區的歸屬問題，而玻利維亞總統阿道弗則公開宣佈前總統與巴西所簽訂的一切協議無效，督促巴西軍隊退出佔領的玻利維亞土地，否則玻利維亞軍隊將進攻侵略的巴西軍隊。
一石激起千層浪，巴西軍隊不過失敗過一次，周圍國家就恨不得衝上來從巴西身上撕下一塊肉，佩德羅二世不認爲玻利維亞、秘魯有這樣的實力，因爲在這之前，進攻巴西馬託格羅索州的巴拉圭軍隊已經被巴西軍隊驅逐出國境，如果不是巴拉圭戰事導致巴西軍隊主力損失慘重，進攻馬託格羅索州的巴拉圭軍隊將會付出巨大的代價。
秘魯、玻利維亞的實力不放在佩德羅二世的眼中，不過秘魯、玻利維亞、巴拉圭、華人獨立軍四個勢力範圍帶來的威脅也不容小視。
如果四個勢力暗中結成同盟對付巴西，巴西帝國就危險了。
佩德羅二世的擔心有些多餘，且不說華人獨立軍和秘魯、玻利維亞都發生過沖突，就是四大勢力結成同盟，因爲地理環境的阻隔，也不能對巴西造成根本性的傷害。
秘魯、玻利維亞對巴西提出要求有趁火打劫的味道，同時他們這樣做也有各自特殊的國情驅使。
秘魯、玻利維亞甚至巴拉圭主政領袖都是國內勢力深厚的考迪羅，他們的上位不是依靠國內百姓的民主選舉，而是手下將領和軍官用步槍大炮把他們推上總統寶座，
因此，三個國家的總統們對巴西發出戰爭威脅不是基於國家實力的客觀考量，而是爲了自己的利益做出的一致選擇。
軍閥勢力往往是狂熱和非理性的，和華人獨立軍的作戰使秘魯和玻利維亞軍閥勢力損失了大量的利益，而損失最爲嚴重的屬於部隊核心的中下層軍官，他們的財物、糧食被華人獨立軍掃蕩一空，損失巨大的他們需要從其他地方獲得補償。
秘魯、玻利維亞軍隊不是華人獨立軍的對手，讓他們向華人獨立軍報復不大可能，國內的印第安和普通農民的財富早已被軍閥勢力剝削一空，再次搶掠普通百姓獲得的財物土地也有限，而且過於壓迫國內的底層百姓又會激起類似華人獨立軍起義的事件，吃過一次大虧的兩國執政者也不敢把事情做的太絕，給底層百姓留下了最基本的生活物資便停止了搜刮行動。
底層百姓生活困苦，軍隊士兵心懷不滿，就在新任的玻利維亞總統阿道弗感到焦頭爛額之際，傳來了巴西軍隊在華人獨立軍和巴拉圭軍隊前後夾擊下全軍覆沒，五萬巴西主力逃回國內的只有五千人，阿根廷和烏拉圭部隊也全縮回了國內，華人獨立軍搶佔了南里奧格蘭州並且打算作爲根據地一直盤踞下去。
巴西軍隊主力喪失，華人獨立軍和巴拉圭在巴西旁邊虎視眈眈，阿道弗原本擔憂的收復國土問題看到了解決的曙光，同時利用巴西主力喪失的機會奪下盛產橡膠的阿克里地區，也可以獲得經濟上面的補償，安撫住國內軍隊的情緒。
1867年梅爾加雷霍和巴西私下籤訂條約規定，巴西以邊界地區領土換取阿克里地區，承諾修建連結兩國的madeira--mamoré鐵路，以解決玻外運產品通往大西洋出海口通道問題。另外，玻利維亞還將阿克里南部與北部巴西移民居住的地區讓與巴西。這樣，巴西從玻利維亞總共獲得的領土面積爲19.1萬平方公里。而巴西方面付出的代價不過幾百萬巴西貨幣和一批軍火，同時因爲巴拉圭戰爭影響，巴西方面承諾修建的鐵路一直沒有修建。
因爲一紙沒有法律效應的條約和一些金錢武器巴西拓土19.1萬平方公里。
19.1萬平方公里佔據玻利維亞國土總面積的十分之一，阿道弗上臺後一直苦惱於如何收復國土，而巴拉圭戰爭的結果讓他看到了機會。
帝國沒有神聖的，同時也可以說國家沒有善良無害的，巴西從正式成爲殖民地開始，面積只有現在面積的三分之一，然後經過一系列擴張，到了十九世紀初期面積便擴張一倍，然後巴西先後呑並烏拉圭、法屬圭亞那，利用強取豪奪的手段不斷從周圍國家獲取領土。
巴西帝國領土不斷擴張，同時周圍的國家也被他得罪了遍，烏拉圭被巴西呑並過，跟巴西結爲盟友是不得已的選擇，阿根廷同樣遭受過巴西的侵略，只不過阿根廷實力還算不錯沒有被巴西呑並，而玻利維亞、秘魯則不斷被割肉，阿克里地區原本分別屬於秘魯和玻利維亞，但是現在阿克里地區卻被巴西強行佔領。
阿克里面積廣大、戰略地位重要，失去這片地區無論是玻利維亞還是秘魯都不甘心，也因爲面臨巴西這個共同的敵人，秘魯和玻利維亞走在一起，成爲關係較好的盟友，因此，阿道弗得到消息後沒有急於做出反應，先聯繫了秘魯總統佩德羅.迭斯，兩家商量好對策後再發表對巴西的聲明。