駐守在震方炮臺上的章軍103團一個營，再也經不起這樣的消耗，不得不放棄逆襲。而山口素臣則是不惜一切代價，向這個方向再次投入了大量兵力，他已經看出來了，5號地堡是撬動整個大東門防線的槓桿！
傍晚時分，日軍終於在5號地堡上站穩了腳跟。
5號地堡的丟失，使得震方炮臺的形勢急劇惡化。日軍得以在東、東南兩個方向繼續保持着強大攻勢的同時，以5號地堡爲跳板，從南方向震方炮臺發起抵近攻擊。
震方炮臺處於日軍三面合圍之中，岌岌可危。
10月16日凌晨，在奪取5號地堡三個小時後，日軍派出一個三百人的敢死隊，藉着黎明前的黑暗，從5號地堡出發，摸到了震方炮臺的胸牆下，而震方炮臺上，卻是毫無覺察。
敢死隊吶喊着衝上了炮臺，一聲驚天動地的巨響，三合土鑄就的堅固的震方炮臺，正如它的名字一樣，響起一聲驚天動地的驚雷，鎮方炮臺正如它的名字一樣，在一聲驚雷中煙消雲散。
震方炮臺驚天的爆炸，發出一道閃電，照亮了半個臺南城，轟鳴聲傳到大東門第一師師部，几案上的茶碗被震落在地，率了個粉碎，指揮部的幾個參謀也被震得踉踉蹌蹌。
第一師師長吳佩孚站在城垣的女牆下，望着震方炮臺方向，那裡已經歸於一片沉寂，爆炸引起的濃煙，遮掩了天上的星月，夜色愈發濃郁了。
渾身綁着繃帶的副營長站在他的身後，聲音裡帶着哭腔：“師長，營長命令我們向大東門突圍，他自己留在震方炮臺上，點燃了炸藥……”
就在入夜之前，日軍的一個分隊突到了震方炮臺的西側，也就是臺南城垣與震方炮臺之間，切斷了震方炮臺與城垣的聯絡，把震方炮臺徹底孤立了。營長施見濱眼見難逃被圍殲的結果，命令把所有的炸藥和炮彈堆積在炮臺上克虜伯加農炮旁，剩下的部隊在副營長的帶領下向城垣突圍，自己留了下來。
當日軍敢死隊衝上炮臺的時候，施見濱引燃了炸藥，把震方炮臺和三百日軍敢死隊一起，炸成了一片平地。
從此之後，臺南大東門前，就只有一座巽方炮臺，古蹟至今猶存。
“哭個屁！”吳佩孚喝道。
“師長，你要想哭，就哭出來吧！”副營長不僅沒停止哭腔，反倒勸說吳佩孚和他一起哭。
駐守震方炮臺的營長施見濱，自稱是施琅的後人，他原本是清軍仁字營的一個普通士兵，甲午戰爭前期，仁字營搭乘高升號前往朝鮮，在豐島海域遭到日軍截擊，高升號被擊沉，施見濱和吳佩孚一起，掉進大海里，漂了好幾天，最後漂到了仁川港，被周憲章救了。後來，施見濱跟着吳佩孚一起加入了章軍，從朝鮮打到臺灣，是吳佩孚的鐵桿兄弟。
施見濱經歷過無數次慘烈的大戰，都活了過來，今天卻死在了震方炮臺上，
吳佩孚一把擦掉了就要流出來的眼淚：“你帶回來了多少人？”
“三百五十人！”副營長說道：“一千弟兄就只剩這些了。”
吳佩孚點點頭：“下去吧，好好休息一下，我會向軍長爲你們請功。”
副營長立正說道：“師長，老子不要功！你讓老子到巽方炮臺上去！老子要親手奪回震方炮臺！”
“你他媽的敢在老子面前充老子！”吳佩孚喝道：“你和你的人，全部編入預備隊！”
師預備隊由第一師的師直屬營和由臺南青壯年組成的補充團組成，正在城內延平郡王祠集結。
“師長，我要去巽方炮臺……”
“滾！”
副營長只得退出。
“其他方向戰況如何？”吳佩孚問道。
師參謀長說道：“大東門方向，巽方炮臺頂住了日軍一個聯隊的攻擊，陣地全在我們手裡，但是，因爲震方炮臺失守，巽方炮臺失去了側翼，將遭到日軍三面圍攻，形勢不容樂觀。大南門方向，日軍近衛師團的一個聯隊在付出五百人傷亡的代價後，佔領了兩個外圍陣地，但主陣地仍然牢牢掌握在我們手裡，我已經命令他們向日軍發起逆襲。小西門方向，日軍一個支隊兩千人對我軍進行襲擾式攻擊，戰鬥不算激烈。”
“北面的情況如何？”
“北面曾文溪一線仍然十分平靜，沒有發現日軍。”參謀長說道：“我判斷，日軍的主攻方向，仍然是大東門，如今我們失去了震方炮臺，巽方炮臺被孤立，形勢嚴峻，大東門守軍只有一個團，並且傷亡較大。所以，我建議，將曾文溪一帶的守軍，調一個營加強大東門。”
“不行！”吳佩孚說道：“曾文溪雖然不是臺南的門戶，但是，我軍在這個方向上不能掉以輕心，一旦日軍從曾文溪發起攻擊，雖然不能直接威脅臺南城垣，但卻可以攻擊大東門的後方！日本人豈能看不到這一點？”
參謀長嘆道：“師長，以第一師的兵力，戰線拉得太長了。日軍今天的攻擊，僅僅是一個開頭，明天日軍肯定會投入更多的兵力，猛攻大東門。要想穩固防線，要麼放棄部分外圍陣地，收縮防線。要麼，請軍長下令，調軍直屬旅助陣，否則……”
“你這兩條都行不通！”吳佩孚斷然說道：“張勳這個狗東西，人不咋地，可的確能打仗，媽的，上次他在胎裡峰用一個團頂住了日軍一個旅團的攻擊，要是換了我，還真不知道能不能頂得住。軍長這是要他再打一個擡裡峰出來。我們的任務，是延緩日軍的攻擊，爲下一階段的作戰做準備，軍長給我們的時間，是把日軍阻攔在臺南城外五天，難道我們五天都頂不住嗎？”
參謀長嘆道：“日軍總共有兩個師團，總兵力達到了五萬，我第一師只有一萬人，敵人可以在任何方向上投入優勢兵力，我們堅守三天有把握，至於五天……”參謀長沉吟不語。
一陣急促的槍聲，打破了黑夜的寧靜。
巽方炮臺下，火光四起，槍聲如炒豆。
與此同時，小西門、大南門方向，也響起了密集的槍聲和令人心寒的喊殺聲。
日軍發起了夜襲。
還有等到天亮，乃木希典就坐不住了。
吳佩孚說道：“從現在開始，今後五天，我們將沒有白天和黑夜，我們有的，只有戰鬥！”
……
10月16日，日軍的攻擊較15日增強了一倍。
吳佩孚的判斷沒錯。15日平靜了一天的曾文溪，終於爆發了激烈的戰鬥。日軍第二師團下屬第五旅團的一個聯隊，經過一天的急行軍，繞過章軍防禦正面，抵達曾文溪一帶，經過一夜的部署，在早上六時，開始強渡曾文溪。曾文溪一帶駐守的102團奮起抵抗，雙方在狹窄的河灘上反覆衝殺。曾文溪並不是什麼天險，僅僅是一條小溪流，攻守雙方都是在開闊地上短兵相接。
經過一天的戰鬥，日軍突破曾文溪防線，102團且戰且退，在曾文溪以南的永吉一帶穩定了防線，暫時阻擋了日軍的攻擊。
攻擊小西門的日軍，一改昨日的襲擾戰術，兩千日軍在騎兵的配合下，冒着章軍的炮火，向小西門發起了猛攻，他們很快攻佔了小西門外圍的一線戰壕，並奪取了兩個較大的地堡，日軍敢死隊一度突擊到城垣下，但被守軍的反擊部隊消滅。
大南門，日軍在昨日進攻的基礎上，再次投入了八百人，試圖擴大戰果，但遭到守軍的頑強抵抗，堅守在大南門的章軍部隊，向進犯日軍發起了反突擊，位於勘斗山上的章軍炮兵旅，爲反攻部隊提供了強大的火力支援，戰至黃昏，章軍炮火摧毀了日軍佈設在大南門外的一個炮兵陣地，日軍火力猛然減弱。守軍趁機反擊，奪回了昨日失守的陣地。
最爲激烈的戰鬥，仍然是在大東門。
失去了震方炮臺後，巽方炮臺完全暴露在日軍的三面合圍中，儘管，來自大東門城垣的炮火支援仍然十分猛烈，但是，失去了震方炮臺後，巽方炮臺防禦正面立刻變得非常寬大，日軍得以在寬闊的突擊正面上從容展開兵力，向炮臺發起了一輪又一輪進攻。巽方炮臺也成了日軍炮火轟擊的焦點，一整天，炮臺上烈火熊熊，彈落如雨，但是，堅固的巽方炮臺承受住了日軍的炮擊，始終屹立不倒。
巽方炮臺下的前沿工事，大多已經坍塌，駐守在工事裡的章軍不得不向後收縮，日軍突入了章軍陣地，攻站了五個外圍堡壘，巽方炮臺的外圍陣地，幾乎全部被日軍佔領。
但是，兵力收縮後的守軍，如同一隻握緊了的鐵拳，向進攻日軍發起了猛烈的反擊，以連、排爲單位的戰術反擊，精準而有力，每一次反擊，都會給日軍造成極大的傷亡。巽方炮臺上的三門15釐米加農炮，更是火力強勁，每一發炮彈，都能給日軍造成極大的混亂。
戰至黃昏，巽方炮臺下，佈滿了日軍的屍體，層層疊疊，慘不忍睹。擔任主攻巽方炮臺的一個聯隊日軍，因爲兵力消耗太大，而不得不撤出戰鬥，由近衛師團的一個聯隊接替攻擊任務。
接下來的兩天，章軍第一師陣地被大大壓縮，兵力損耗過大，臺南外圍防禦顯得捉襟見肘。日軍從曾文溪方向進一步南犯，兩天推進了十里地，而章軍102團因爲兵力損耗過大，越來越顯得力不從心。