相對於北京朝廷來說，南京六部實乃清閒衙門，除了管理兵事的兵部以外，其他各部門平素裡沒有多少事情，原爲官員們養老所在，所以部門官吏缺額嚴重。
而要把整個朝廷搭建起來，像北京朝廷那樣，給各個部門配置相應官吏，實乃一項複雜的工程，並非一日之功。
對於如何組建朝廷，崇禎自然心中有了主意，這些天來，他日思夜慮考慮的就是這些事情。
崇禎當朝下旨，加兵部尚書史可法爲東閣大學士，加原淮揚巡撫路振飛爲武英殿大學士，加原禮部侍郎王鐸爲東閣大學士組建內閣。
在這三人中，史可法原本就官位最高，又經受住了福王之亂的考驗深得崇禎信任，自然是內閣首輔。
路振飛原來只是右僉都御史銜，四品官。但其接駕有功治理淮安有方，更兼抵擋住了闖賊的進攻，其能力很受崇禎信賴，特升其爲左副都御使，入閣輔政。
王鐸原本就是崇禎朝翰林學士、禮部侍郎，崇禎十四年因父喪辭官，是崇禎朝的老人，入閣也是理所當然。
錢謙益雖然在福王之亂中起到了推波助瀾的作用，但因其迷途知返，在平南軍攻城時運籌獻出內外城門，立下了大功，陳越也在奏章中爲其說了話，崇禎對他以前的行爲既往不咎，封其禮部尚書，以黃道周爲禮部左侍郎，右侍郎暫時空缺。
在福王登基時，南京大部分官員最終都攝於兵威選擇了屈服，若是按照崇禎心意，這些人一個都不用，可是若這樣的話，南京大半官員都得驅逐出朝，將陷於無人可用之境地。爲了迅速穩定局勢，崇禎只能忍下這口氣，既往不咎。
以張慎言爲吏部尚書，侍郎由楊廷麟擔任。
高宏圖爲戶部尚書，侍郎王寅。王寅雖然深受崇禎心中，到底只有舉人的身份，沒有什麼資歷可言，一下子把拔爲正三品戶部侍郎已經是破格再破格了。
以何應瑞爲工部尚書，高倬爲工部侍郎。
以姜曰廣爲詹事府詹事，李青爲大理寺卿，老臣葛寅亮爲太常寺卿。
以劉宗周爲左都御史，李沾爲右都御使。
如此，算是把朝廷六部初步組建起來，至於其他官員的任命，則按照慣例三品以下有內閣提議經吏部覈准，報由皇帝下旨。三品以上官員則由廷推產生。
在朝堂上，陳越只是以平南侯討逆大將軍的身份臨朝，朝政大事，官員的任免沒有他插嘴的餘地。陳越也不願多管，只是站在班列中閉目養神，對衆臣的爭執充耳不聞。
早朝一直持續到中午方纔結束，六部九卿之正副官員人選都有了結果。當退朝之後，陳越長嘆口氣，感覺腿都站麻了，也不知道那些看起來老態龍鍾搖搖欲墜的文官們爲何精力能如此旺盛，一個個還一副意猶未盡的模樣。
下朝之後，羣臣按照官職魚貫退出，陳越正要離開皇宮時，秉筆太監韓贊周叫住了他，說是皇上宣他陪吃午膳。崇禎請吃午飯啊？陳越點點頭，摸了摸飢腸轆轆的肚子，跟着韓贊周往後宮而去。
衆大臣看着陳越離去的背影，各個臉色不同，大都是一副豔羨之色，也有臉色複雜者，多半是親朋好友被陳越以附逆的罪名抓捕了起來。
“呵呵呵，平南侯少年英雄，屢立殊功，深受陛下信重也是理所當然。”錢謙益捋着鬍鬚，對身邊的史可法道。
“就怕其恃寵而驕，飛揚跋扈起來，實非朝廷之福。”史可法搖頭道。
“呵呵，哪個少年不張狂？平南侯年剛弱冠，正是意氣風發的時候，你能指望他像你我一樣事事都三思嗎？若不是這種性格，又豈能於萬軍之中救出陛下，又豈能屢破強敵平定福王之亂！”錢謙益笑呵呵，話音裡滿是對陳越的欣賞。
史可法深深的看了錢謙益一眼，不再多言。對錢謙益，史可法現在有一肚子的意見，卻限於對方是東林黨巨擎的身份不好多言。
“厚顏無恥之徒，眼看着陳越得寵，巴巴的上前巴結，吾往日怎麼沒有看出錢牧齋竟是個陰險小人！”呂大器快走幾步，緊跟在史可法之後，小聲道。
史可法回過頭來，看着被一堆官員圍着的錢謙益，深深的嘆了口氣，一言不發的轉身就走。呂大器等官員緊跟在史可法之後，離開了皇宮。
“牧齋公，我那內兄真是冤枉啊，還請牧齋公能在平南侯面前美言幾句，早日把他放出來。”一個身穿四品服飾的官員滿臉堆笑的對錢謙益道。
“牧齋公，兵部何主事也沒有參與謀逆，也被平南侯抓了起來，您能不能幫他說句話？”另一個官員道。
一堆圍着錢謙益的官員竟然大半都是爲親朋求情。
“呵呵，剛纔平南侯在時，汝等爲何不直接對他說？”錢謙益笑眯眯道。
“我等哪敢啊？平南侯要是再以附逆的罪名抄了我的家，那該如何是好！”一個官員尷尬的笑道。
錢謙益深陷福王之事，現在因爲陳越爲其說話竟然平安無事，還當上了禮部尚書，禮部尚書就沒有不入閣的，下一步肯定是內閣大學士！這讓一衆官員認爲其和陳越交情莫逆，竟然打起了讓其求情的主意。
“諸位，這裡可不是談話的地方，等咱們下值之後再聊如何？”錢謙益笑呵呵道。
“牧齋公所言極是，等下值後我當親自上門拜訪！”衆官員聞言大喜，紛紛說道。
......
陳越對殿門外發生的事情一無所知，更不知道很多人已經把他和錢謙益歸爲一黨。他爲錢謙益說話不過是因爲錢謙益獻城使得他省了事減少了平南軍的傷亡，沒想到竟然引起了這樣的誤會。
現在陳越只想着趕緊見到崇禎，弄點御膳吃吃，好填飽飢腸轆轆的五臟廟。
跟在太監韓贊周的身後，想着一會兒單獨見到崇禎時該如何奏對，陳越向着崇禎居住的乾清宮行去。