關於鍾南在蘇州之後的經歷，錦衣衛們早就有相關報告呈送案頭，所以朱翊鈞並不在意對方的充軍身份，他感興趣的是鍾南年少時的故事。鍾南又挑了些自己小時候的趣事說給皇帝聽，大多都是被母親和先生責罰的片段，皇帝聽完後，很是感慨，他問鍾南：“你對你的母親和先生，有過怨言嗎？”
“啓稟皇上，何止是怨言，當時我對他們簡直可以說是恨，”鍾南笑着說到，“可是後來我從軍後才明白，我娘和教書的先生都是爲了我好，要是我努力讀書，說不定能考個舉人甚至進士了！”
“你現在不是也當上了遊擊將軍嗎？”朱翊鈞問道，“現在這樣你覺得不好？”
“啓稟皇上，不是說現在不好，只是我要是聽我娘和先生的教誨，肯定會比現在更好，”鍾南斟酌着用詞，“到我從軍後才逐漸明白，不管是我娘還是教我的先生，他們纔是對我最關心的，雖然做法可能嚴厲了些，可那是‘恨鐵不成鋼’啊！”
“好一個‘恨鐵不成鋼’，”朱翊鈞沉思中不禁喃喃自語地說着，“很好，很好！”
鍾南看見皇帝是真的聽進去了他的“故事”，心裡的石頭才落了地，他之所以半真實半編撰地講這樣一個故事，除了拉近兩人的距離外，更是不想大明王朝被皇帝折騰——此時的朝廷裡，大太監馮保已經被萬曆扳倒，發配到了應天府；而且也有了清算張居正的苗頭，鍾南不希望才中興不久的王朝又快速地沉淪下去。
整個御書房裡一片安靜，不管是太監還是鍾南都沒有打擾朱翊鈞，太監沒出聲是因爲他知道這位萬歲爺的脾性，皇帝這個時候需要的是安靜；鍾南沒有說話卻是爲了讓萬曆皇帝自己體會，有效的心理疏導不是什麼都要全部說出來，更重要的是要讓他自己去領悟。
直到身後的太監重新端上熱過的飯菜，朱翊鈞纔回過神來，他見天色已經很晚了，便下旨讓鍾南在宮外就寢，明日一早再來御書房一趟。
鍾南很吃驚，原因一是沒想到朱翊鈞很節儉，熱過的飯菜還吃得津津有味，看來老朱家的節約基因很強大；二是皇帝居然還要召見自己，原本他以爲皇帝召見自己是圖個新鮮，內容無非就是勉勵幾句，隨意說幾句不痛不癢的話。由此看來，皇帝召見他是真的有事情，不過，會是什麼國事呢？
鍾南想了一陣，不過毫無頭緒，索性不再胡亂猜測，反正過了今晚就能知道，他何須自擾，不如安安心心地睡覺，於是沒多久便和周公約會去了。鍾南睡得是很香甜很愜意，哪裡知道當晚整個朝廷上下的大部分人，卻是睡不着了——皇帝是多久沒有和大臣共進晚餐了？皇帝又是多久沒有讓大臣在宮外就寢，方便次日二次進宮面聖了？誰成想一個小小的遊擊將軍，今晚卻把這兩樣全都佔齊了，這說明什麼還不清楚嗎？
在封建社會裡，君臣關係甚至會高於父子的血緣關係，古語有云“君叫臣死，臣不得不死”，由此可見帝王權勢何其滔天。雖然到了明朝，文官們的權利和地位比之前高上許多，可是除了個別時段，他們仍然是無法撼動皇權的。所以皇帝要是看好哪個人，就基本可以預見其前程似錦，同理，皇帝要是討厭你，那也就別想在仕途上能進步了。
第二日早朝過後，萬曆皇帝找了個間隙再次召見鍾南，這一次皇帝單刀直入，讓鍾南談談對倭國的看法，因爲他是這次抗倭戰爭的親身參與者，理應更有發言權。
“啓稟皇上，倭國人是那種不被打怕就不知道痛的民族，雖然此次答應和我們和談，微臣以爲這只是緩兵之計，說不定哪天又會捲土重來！”鍾南確實對倭人印象不怎樣。
“哦，你的意思是和倭國之間還會爆發戰爭？”朱翊鈞皺着眉頭，深深思慮着，“那你覺得大概時間會是？”
“三到五年！”鍾南語氣肯定，這是因爲他知道原本的第二次援朝戰爭發生在第一次之後的第五年，雖然如今第一次援朝戰爭推遲了一年，想來第二次的時間也不會相差很遠。
“這麼肯定？”皇帝沒想到鍾南的回答如此篤定，完全不像那些官場油子，他們只會說着模凌兩可的話，什麼都不敢確定。
鍾南又把這次援朝戰爭中的一些事件講述給朱翊鈞，同時介紹了一下倭國的國內情況，並且“大膽分析和預測”了一些倭國軍政走向，朱翊鈞很是歎服，連道把鍾南放在東昌府太大材小用了。
隨後兩人又對如今大明王朝的周邊局勢做了簡單地探討，按理說鍾南是沒資格和皇帝討論此類話題的，只是看樣子，朱翊鈞對鍾南有些偏愛。原本只是打算利用早朝後的間隙時間和鍾南簡單聊聊的朱翊鈞，最後竟然談了近兩個小時，將之前安排召見的內閣大臣晾在一邊，直到太監通報了三次才結束了會談。
接下來的幾天是鍾南穿越後過得最開心的日子，由於山東使團的計劃是在京師留到元宵節後，所以他帶着秋香，逛遍了京師有名的大街小巷，只要是秋香想逛的場所，想吃的食物，想買的東西，鍾南是毫不吝嗇。
因爲即將過春節，整個京師熱鬧非凡，17世紀的東方大國，可以說是整個世界的中心，天朝上國的經濟之繁榮、文化之瑰麗、生活之富饒都是令異邦他國嚮往的，所以此時的京師匯聚了來自****的人，他們身份各異，諸如商人、傳教士、官員、藝妓等等，讓此時的中國人民足不出戶就能感受到異域風情和別樣的文明。
鍾南和秋香此刻就在京師的天橋附近觀看着各種表演：左前方伴隨着音樂，一羣來自波斯灣的幾個小姑娘跳着明朝人從未見過的舞蹈；另外一邊，幾個藍眼睛大鼻子的北歐壯漢，拿着水晶球正在變魔術……整個天橋彷彿變成了後世的“歡樂谷樂園”，無論中國人還是外國人，都可以在這段特殊的日子裡，暫時忘卻煩惱，徜徉在這片歡樂的海洋裡。
秋香的興奮之情感染了鍾南，原本他對這些表演是不太感冒的，原因無他——在原本時空中已看得太多。只是看到秋香高興得像個小孩子一般，他的心情也跟着明亮了起來。
除了天橋一帶的各種表演，春節期間，京師還舉辦了各種大型的燈會。中國自古就有賞花燈的習俗，傳說這起源於漢武帝時期，當時有一宮女，正月裡甚是想念家中父母，無奈後宮禁嚴無法外出，怎麼辦呢？後來東方朔出了個主意，他先散佈謠言，說火神君將派員火燒長安城，宮裡一片恐慌。漢武帝知曉後，允諾宮女們在元宵節這天可以與家人相會，於是衆人鬧了一夜，不過長安城安然無恙，並沒有被火燒。
之後，漢武帝便下令，每年正月十五都要放燈，此後逐漸形成了賞花燈的習俗。不過據文獻記載，早在南朝伊始，國都南京城內就舉辦過元宵燈會，是中國最早記載的燈會。爲了祈求風調雨順、家庭美滿和天下太平，這種張燈結綵的盛況況，逐漸從深宮禁苑、宗教場所走向民間大衆，慢慢形成了各地規模不一的燈會，或官方或民間不一而足，都在正月初一至十五這段時間裡。
明朝的燈會相比之前的朝代，更多了些商業意味，燈會期間，全國各地的商家和能工巧匠們都會雲集京師，將自己製作的花燈拿到東安門外的北大街售賣。在這短短的數天裡，不僅是花燈製作工藝的比拼，也是經商實力的比拼。他們帶來的花燈不僅僅是供大衆觀賞，還會出售給王公貴族或達官顯貴，有時價格高的燈，一盞就要賣出上千兩銀子。這些燈的式樣和工藝也是新穎繁多，有鑲嵌珍玩珠寶的燈，也有從鄰國或海外販回來的燈，引來的觀賞者絡繹不絕。當時的工部還徵召了大量的民間工匠，爲皇家制作各種美輪美奐的燈具，琉璃燈就是從燈會上發現的。
在京期間，鍾南還參加了皇帝在正月舉行的盛大慶典，全國各地的重要官員、各藩屬國的特使、部分歐亞各國的代表使節等等齊聚紫禁城。當山呼海嘯般的歡呼聲響起時，鍾南感受到了自己作爲一箇中國人的自豪之情，也由衷地希望大明王朝能更加繁榮昌盛，“天下興亡匹，夫有責”的使命感第一次在他的內心深處蔓延開來。
京師的美好時光讓人無比享受，哪知還沒過正月十五，山東就傳來了白蓮教死灰復燃的消息，驚得巡撫大人伍修凱召集了所屬山東官員連夜返回濟南府，鍾南也不得不結束了他和秋香的京師之旅。