趙爾豐心想，僅靠自己手裡的幾萬新軍和巡防軍，根本無法抵抗二十幾萬同志軍的進攻，於是接連向清廷緊急求救。
總督府發給郵傳部的告急電報說：
“四川南路沿途，概系同志會匪把守關隘，雖有水路亦不能繞越，見人即搜；
遇有公文報件，登時撕碎，將人捆縛，刀傷棍擊無所不至。
……新津至邛崍，擱河坎線路九十餘里，又至眉州、觀音鋪線路四十五里，概被匪徒砍毀殆盡。
東路自龍泉驛起，直至臨江寺止，計線路一百六十餘里，概被砍毀。”
清廷得到趙爾豐的急報後，預感到將大禍臨頭，大臣們慌亂成一團，盛宣懷主張堅決鎮壓。
清廷急調湖北、雲南、湖南、廣東、貴州、陝西等六省的部分清軍，緊急入川鎮壓保路運動。
其實這些外省的軍隊，大都以各種理由爲藉口拖延，沒有真正派出軍隊入川。
僅有黔軍三個營衝過川黔邊境進入四川，但是被同志軍阻擋在敘州、瀘州和富順一帶，寸步難行。
清廷急電催促鐵路大臣端方，令他親自帶領鄂軍從漢陽啓程入川，去鎮壓四川的保路運動。
同時，清廷認爲岑春煊任四川總督時，成功地將四川轟轟烈烈的紅燈教鎮壓下去了，有豐富的剿匪經驗。
因此急調在上海休養的岑春煊去四川，會同趙爾豐和端方剿匪。
同時抽調廣東的陸軍第二十五鎮清軍兩千餘人，護衛岑春煊隨行。
可是，狡猾的岑春煊，深知四川的反清形勢比幾年前更加複雜，保路烈火無法撲滅。
他到武昌後停下來，詭稱“感受風熱，觸動咯血舊症，其勢萬難前行”。
向朝廷請假，回上海養病去了。
話說端方作爲川漢和粵漢鐵路大臣，一直待在武漢辦公。
湖廣總督瑞澄認爲，欽差大臣端方待在湖北不走，會對自己的總督寶座構成威脅。
他看到端方受命後繼續拖延，對他更是忌恨，巴不得快點把他打發走。
瑞澄親自登門拜訪，客氣地許諾端方，把第三十一標和第三十二標的鄂軍給他帶去四川。
這兩標是湖北新軍中的精銳部隊，配備有大量的西洋武器。
同時保證入川鄂軍的後勤供應，如果後續需要增加兵力時，還可以陸續加派鄂軍入川。
端方這纔有了底氣，高高興興地帶領兩標湖北新軍，約兩三千人的精銳部隊，經陸路趕到宜昌乘船。
從長江星夜兼程西上，浩浩蕩蕩，氣勢洶洶地從水路開赴四川，趕去成都戡亂滅火。
這次端方有了軍隊撐腰，心想奪取四川總督已不在話下。
他迫不及待地伸手要四川軍隊的指揮權，在宜昌就以“四川最高統治者”的口吻，向四川官兵發出《告示》。
要他們都聽自己的指揮，並將《告示》四處張貼。
聲稱：“朝廷派本大臣來宣佈德意，又派本大臣來管四川全省的兵……川省若仍舊亂鬧，滋出事來，只好照匪徒一樣重辦。”
可是，從長江坐船逆流而上，船行十分緩慢。
當運兵船進入長江三峽航段時，船行更加艱難。
端方也是走了黴運，因爲當年長江上游大旱，江面不斷退縮，河灘大部分已乾枯。
三峽航段本來就多礁石和險灘，現在哪裡還能行船？
面對朝廷接二連三下達的催促令，端方在船上急的團團轉。
他派人找來大量的縴夫，費了九牛二虎之力，每天拉行不過幾裡水路。
運氣好時，也不過上行十幾裡。
端方的湖北新軍遲遲不能入川，急煞了處於烈火炙烤中的趙爾豐。
有人給總督打小報告，說端方因畏懼保路同志軍，故意慢騰騰地拖時間，其實他不想進四川。
還聽說他一路上欣賞三峽風光，悠閒地在船上吟詩作畫，把入川鎮反當成了一次旅遊。
說實在的，端方也是有意在拖延時間。他在等趙爾豐徹底垮臺，朝廷正式任命他當四川總督那一天。
趙爾豐聽了報告後氣得吐血，他憤怒上奏朝廷，要參掉端方的鐵路大臣職務。
端方接到朝廷的嚴令斥責後，急得豆大的汗珠直往地下掉。
同時對趙爾豐反過來彈劾自己，恨得咬牙切齒。
端方決定分兵，以少部分軍隊作先鋒，令他們翻過巫山山脈，從旱路去成都。
可是入川的旱路都是崇山峻嶺，行軍難於上青天。
再說了，湖北新軍也不願意急急地趕去送死，他們寧願如蝸牛般在大山裡爬行。
趙爾豐眼見成都被保路同志軍圍困，外省的援軍久久不到。
決定派統制朱波瀾和提督田武魁，率領清軍精銳部隊打開南門，衝出同志軍的重圍。
企圖南下佔領戰略要地新津縣城，以便打開往南或往西的通道，爲自己和清軍拓展生存空間。
那天，田武魁和朱波瀾各帶一萬五千精兵，做好了出城準備。
趙爾豐一聲令下，安裝在南門城樓上的數十門火炮齊聲轟鳴。
清軍突然打開南門，三萬精銳部隊從南門衝出去，快速向南郊突圍。
川南同志軍統領侯寶齋，早已在南門外佈置了三道防線：
侯寶齋親率南路同志軍組成第一道防線；
劉自強率領原紅燈教人員組成第二道防線；
雙流及鄰縣同志軍組成第三道防線。
各路同志軍在南門外死守阻擊陣地，清軍發起數十次衝鋒，同志軍的陣地多次失而復得，雙方形成了拉鋸戰。
現在，在省城周圍作戰的同志軍，儘管多達二十幾萬人。
但是，由於同志軍都是自發地來自各州縣，沒有統一的指揮官，羣龍無首，而且大都各自爲陣。
武器裝備又比清軍落後，多數還是傳統的冷兵器。
因此，川南同志軍與清軍在南郊相持半個多月，終因民軍的武器落後，後勤供給跟不上，人員傷亡較大等原因，三道防線最終都被清軍突破。
侯寶齋不得不下令川南同志軍撤出南郊，退回到雙流和新津縣城一帶佈防。
各位看官，新津縣城是成都西南的門戶，三面環水，外來兵馬要兩次渡河，才能到達城下。
其地理位置非常優越，歷來是兵家必爭之地。
清軍如果佔領了新津城，往南可以從水路南下重慶，與端方的湖北新軍會合。
往西可以打通川藏通道，去川西大山與邊防軍將領傅榮華會合。
往北則可以進入成都，堅守在省會周圍。
因此，新津縣城的得失，是雙方戰略爭奪的焦點。
川南同志軍撤回新津縣城時，受到新津東門外的清軍巡防軍的阻擊。
同志軍冒着槍林彈雨衝鋒，鼓角聲、呼號聲、槍聲、炮聲如雷霆震怒，使巡防軍聞風喪膽。
同志軍衝破巡防軍的阻擊陣地後，放火焚燒了軍營，巡防清軍最後全部繳械投降。
佔領新津縣城後，侯寶齋與劉自強商量，決定以新津三渡水爲界，在河西岸邊隔江防守，依靠西河、金馬河構築起三道防禦工事。
在西岸寶資山上設置炮臺陣地，集中沿河所有船隻到西岸，不讓東岸的清軍渡河。
在各道防線和城牆上堆積大量石灰包和紅條石，以防備清軍的進攻。
爲了阻斷趙爾豐與清軍的通訊聯絡，劉自強下令將雅安到成都的電線剪斷，電線杆全部砍倒。
同時，侯寶齋通知邛崍、大邑、蒲江等鄰縣的同志軍趕到新津縣城來會合。
雙流縣位於成都去新津的要道中間，清軍要打通運兵和武器去新津的南大路，必須首先拿下被同志軍佔領的雙流縣城。
田武魁集中了強大的優勢兵力，馬步炮兵並進，去攻打雙流縣城。
雙流縣作爲護衛新津的屏障，當時縣城裡僅有幾千名同志軍駐守。
爲此，坐鎮新津指揮的侯寶齋，派劉自強帶領五千同志軍去雙流增援。
秦載賡率領的東路同志軍，在成都東門外激戰十幾天後，將大軍主力轉向華陽中和場一帶，與新津遙相呼應，形成四十里連營。
同時派其弟秦省三帶領三千同志軍，配合雙流縣的友軍阻擊清軍。
劉自強見雙流縣城無險可守，便令城內的同志軍主動撤出來，分三路南移至地形複雜的黃水河及板橋梓一帶防守。
清軍到縣城撲了空，追擊至黃水河邊與同志軍激戰。
同志軍將清軍引誘到地勢低矮的辜家碾附近，突然打開碾閘，大水咆哮着衝向清軍。
同志軍趁清軍遭遇水淹，驚慌之際，用土槍和箭弩瘋狂射擊。
大部分巡防軍被擊斃，河裡、水田裡到處泡起清軍的死屍。
劉自強指揮同志軍出沒無定，四處設伏，引誘巡防軍至林盤深處、河邊或田地裡將其殲滅。
爲了瓦解巡防軍的軍心，同志軍高喊歌謠：
“巡防軍，回頭好，不早回頭命難保。勸你們，把戈倒，協力推翻清王朝。興中華，建民國，爲國富強立功勞。”
受此歌謠影響，一些巡防軍倒戈參加了同志軍。
巡防軍在雙流受到重創，趙爾豐不服輸，派朱波瀾親率陸軍四個營，另有馬隊和炮隊配合，再來進攻同志軍的黃水河防線。
這裡地勢平坦，無險可憑，在清軍優勢兵力攻擊下，同志軍要堅守下去已經十分困難。
恰在這時，周洪勳在邛州宣佈起義，帶領他的“武字營”，趕到黃水河防線。
與同志軍一起頑強抵抗，最終擊潰了進攻黃水河的清軍。
“武字營”乘勝追擊十餘里，至成都紅牌樓後，才率武字營回雙流扼守。
數日後，清軍再次大舉反攻，燒燬雙流城外的房屋，周鴻勳乃率部退至黃水河一帶佈防。