朱由崧拿下盛京之後，宣告了清政府的徹底滅亡。
這個由努爾哈赤奠基了幾十年，由皇太極定鼎建立的大清王朝，從，1636年算起，到目前的1650年，也即是弘光六年，前後只存在了14年，如果以統一王朝的時間來看，他在北京不到一年，又龜縮到了東北老家直到滅亡，李自成的大順王朝也強不到哪裡去，堪稱是曇花一現的統一政權。
由於朱由崧的穿越，徹底改變了大清的命運，這樣提前結束了他原本270多年的壽命。
這樣從朱由崧御駕親征率領遠征軍打出山海關之日算起，到現在整整3個月零幾天的時間，不足一百天，朱由崧的大明僅三個月滅了大清，堪稱歷史之傳，鑄造了遠征軍攻無不克，戰無不勝，所向披靡的神話。
朱由崧旨意下，20多萬遠征軍一部分進城，一部分仍留在城外。
朱由崧傳令，嚴肅軍紀，對城的百姓不管是漢人，還是滿洲人，還是蒙古人全都做到秋毫無犯，不得擅闖民宅，更不準殺戮，姦淫和搶劫。不論是誰違紀者，格殺勿論。
有的明軍看押俘虜，有的張榜安民，宣傳明軍的政策，那些對大明仍然懷有舊感情的老百姓街歡慶勝利，這主要是當地的遼人。
早有人把皇宮清理好了，朱由崧帶着衆臣僚及侍衛來到皇宮一看，大清的京師修建的真心不錯，這座古城歷經努爾哈赤和皇太極父子的修建，特別是後來多爾袞帶着順治帝和孝莊皇太后，被趕出北京之後，又回到了這裡定都，又對之進行了擴建。
現在這裡跟大明的皇城宮城規格佈局一般無二，規模也沒有多大區別。綠瓦紅牆，亭臺樓閣，裝點得金碧輝煌，以至於朱由崧君臣到了這裡跟到了家一樣，特別是小柳是，好幾次都把這裡當成了北京的紫禁城。
對努爾哈和赤皇太極的牌位，以及順治帝，還有孝莊皇太后，多爾袞等人起居用具，朱由崧沒有進行破壞，可能是他後世受過高等教育，把他們視爲物，以留作紀念。
出於這樣的目的，朱由崧把皇城的東北角的幾座閣殿騰了出來，按照原來的設計和位置，把這些東西擺放進去，讓後人觀展。
朱由崧在盛京城住了20多天，儘管現在是六月了，沒有空調，也沒有電扇，盛京城像春天一般溫暖舒適，不冷不熱的，估計又在十幾度左右，這真是難得避暑勝地啊。
這20多天，朱由崧在盛京內外遊覽了個遍，盛京古城遠非現在的瀋陽城所能想象。沒有瀋陽城高度發達的經濟和明，卻有着厚重歷史化的積澱。
還用了幾天的時間，朱由崧到盛京城外，遊山玩水。這裡有山地，有丘陵，還有平原，風光宜人，不管是當地的遼人，還是稍遠一些的女真人，蒙古人，現在全都成了大明的順民，朱由崧在投降將士的引領下了解當地的風土人情和民族化特色。
但是朱由崧不能在這多耽擱，大清雖然滅亡了，但是他的殘餘勢力還存在。像歷史崇禎吊，李自成進北京，明朝滅亡了，但是明朝的殘餘勢力在江南又延續了四帝一監國，至少四十年，如果算民間的反清復明勢力，以及後來吳三桂無恥的反清復明，那時間更長。
清朝的殘餘勢力當然是在東北，主要是蒙古邊境，吉林，黑龍江一帶，必須得儘快肅清。
朱由崧給漠北作戰的黃得功傳下一道旨意，一是褒獎他們作戰勇敢，行動迅速，二是告訴他大清已經完蛋了，三也是最重要的，要求他們在內蒙古邊境一帶繼續追殲大清殘餘，順我者昌，逆我者亡，把大明的疆域向北擴展。
下一步，他要進軍吉林和黑龍江一帶。
這裡本來隸屬於大明的奴兒干都司轄區範圍，包括遼寧在內，涵蓋黑吉遼三省，大明早期在東北的管轄範圍甚廣，永樂大帝設置的這一努兒幹都司幾乎涵蓋了黑龍江，松花江，烏蘇里江和嫩江等四江流域的廣大地區，建州女真居住地和庫頁島也全都包括在內。
只是近幾十年來努爾哈赤父子的崛起，這裡成了滿清韃子的搖籃，朱由崧現在通通要把它們收回來。
這一帶有很多少數民族，似乎對大明有一定的感情基礎，但是經過後金到大清，到大明這一個起伏，又是近半個世紀的時間，俗話說得好，窮山惡水出刁民。
大清滅了，難免會有刁民對大清懷舊，佔據偏遠，嘯聚山林，對抗大明，也未可知。
必須對一片廣大的地區進行梳理，清洗，徹底肅清滿清韃子的影響，將滅清戰爭進行到底。
另外滅掉大清只是他遠征的第一步。他要親自統領他的遠征軍，實現的偉大的目標:日光所照，皆爲朕土；人只所稱，皆爲朕臣。
這20多天，盛京之戰的戰後事宜處理完了。兵馬也得以休整，人馬的傷亡得到及時的補充，軍需糧草彈藥也得到了補給，另外，現在這個季節正是行軍打仗的好時節。
而且這20多天，北京的內閣首輔高弘圖在請示朱由崧之後，駐守盛京的首任知府已經定下來了，他帶領着地方三司衙門幕僚正在奉命往這裡趕。
朱由崧留下了一名總兵官帶幾千人馬駐守盛京，維持秩序，等待盛京知府和三司衙門等官員的到任。
然後朱由崧繼續統帥20多萬遠征軍，水陸並進，往東北方向深入。
仍然以李自成和張獻忠爲左路軍和右路軍大元帥，只是這次把遠征軍的馬軍和步軍都一分爲二，有李自成和張獻忠各自統領一部分遠征軍的步軍和馬軍。
2萬遠征軍的特戰兵，還有4000御營新軍，由朱由崧親自統領，作爲路軍。三路人馬離開盛京，向東北方向推進。5萬水師營則沿松花江，牡丹江，嫩江和黑龍江等四江的主流和幹流，配合岸的三路大軍向前推進。
四路大軍勢如破竹，所到之處當地的少數民族紛紛朝貢稱臣，有的一看到大明的軍隊還非常高興。