殿試的時候，他又遇見了申時行，覺得兩個人棋逢對手，也許可以好好地比上一比。申時行考了第一，他卻成了第二。
民間傳說，他在殿試的時候輸給申時行，還是有原因的：長的不夠帥，說話也不夠圓滑。至於到底是什麼原因，誰也不知道，但是有一點可以肯定，這位仁兄的相貌也許比較小衆化，說話也不太招人喜歡。不過這並不能成爲足夠的理由。
自從進了朝廷，王錫爵把他那種執拗頑固的倔脾氣是表達的淋漓盡致：萬曆五年張居正被奪情的時候，大家只不過是上書鬧罷了，他覺得不夠，非要跑到人家裡去鬧。張居正沒了法，拿了把刀架在自己脖子上：與其如此羞辱與我，不如你把我殺了吧！王錫爵這下傻了眼，慌慌張張地跑出了門。吳中行被打得奄奄一息，大家不過在家裡吵架怒罵罷了，他卻非要跑到朝堂之上大哭不已。
萬曆六年，張居正無法給自己老孃守孝，不得不回朝辦公，大家都爲此慶賀不已：看看張大人多麼地敬職敬業！他卻偏偏要在這個時候請假：我家老父老母還活着，我得回去看看他們，萬一出了什麼事情，以後再也無法盡孝。這個事情一出，大家都有些納悶，你這不純屬跟首輔大人過不去麼？張居正恨得牙根癢，卻一點辦法沒有，人家要回家看自己老孃，合情合理合法，自己能說什麼？
萬曆九年，張居正已經病入膏肓，很多人都去探望，並且拉着他一起，他卻堅決不幹：他是死是活關我什麼事？他病了我就不辦公了？這不是扯淡麼？不去，堅決不去！很多人都不理解，你說你非要和一個半死的人爭這口氣幹嘛？
萬曆十年，張居正終於死了。在萬曆的英明領導下，全面地展開了對匪首張居正的口誅筆伐和全面否定。大家都積極地參與對他的批鬥活動，堅決地擁護新內閣對於張居正時期被錯判誤判冤死的官員進行平反，同時一致地表達出對張居正時期政策的強烈不滿！有人拉着王錫爵一起：這樣的政治活動一定要參加，新班子上了臺，千萬不要站錯隊！他卻站出來，對着所有**聲吼道：張居正做的事情全部都是錯的嗎？他也許爲人不咋地，可他一心爲了大明，對大明還是有功的！全面否定他就等於全面否定皇上！場下頓時一片寂靜。
萬曆十三年，他的學生李智想找藉口把申時行給弄下來，讓他上位：自己的老師當了首輔，自己還能差到哪裡去？可萬萬沒有想到，王錫爵的臉色當時就黑了下來：你的老師豈是那種卑鄙小人？上位的辦法有很多種，但我絕對不用如此下賤的辦法！二話不說，向皇上申請辭職。
沒過多久，他的兒子參加鄉試得了第一，有人在私下裡懷疑，肯定是作了弊！不然會這麼巧，鄉試也和他老子一樣得第一？就爲了給自己正名，王錫爵堅決地阻止了自己兒子去參加會試，而且言辭警告說，這輩子你就不用想着當官了！就是當了官別人也看你不起！
萬曆聽着狼羣仔仔細細的彙報，不禁在心裡感嘆着，這樣的人才是現在自己最需要的人吶！能夠經受住時間的如此考驗，對自己如此的苛刻，如若不是大賢，定然是大奸之徒！再無任何考慮，立刻遣狼羣去請人，而且要求必須恭恭敬敬，是請而不是綁架！他可是對狼羣的作風太清楚了，生怕把這最後一根救命稻草也給丟了。
王錫爵確實是名不虛傳，在京師各地轉悠了幾天，就把官聲民情給摸了個底朝天，心裡立刻就有了數。這件事情，關鍵還是在皇上自己的身上。他隨即給皇上呈了封密信，在信裡，他言辭極爲懇切，也極爲急迫：眼下的情形不是一般地危急，皇上您必須在明年冊立太子，現在就得發聖旨正式表明立太子的時間表，不然立刻就無法控制了，臣再也無能爲力！
朱一刀這會兒卻呆在京師右所駐地，百無聊賴地聽江飛給他講着大明朝歷代的皇族規矩和祖訓。當江飛講到，一般情況下，皇子繼位的之前必須要冊立太子，而冊立太子的規矩卻是立嫡不立長，也就是說，只能立皇上的正室皇后生的第一個兒子，而不是以皇子的長幼爲順序來立。但是如果實在是沒有嫡子，那也只能變通着立長子，而不能隨意而爲。
可現在皇上沒有嫡子啊，老朱突然想起了這一點，皇后至今都沒有生育，皇長子也不過是個妃子生的，就連三皇子也不過是妃子生的，而且鄭貴妃也是在生了三皇子之後，才被封爲貴妃。這皇后一個兒子都沒有，這事情可不好辦吶！
但這卻是一個機會！一個大好的機會！朱一刀一下子想到了什麼，頓時一蹦三尺高！
萬曆這回學精了，不再讓那些不靠譜的內侍們送信了，而是改成了狼羣，深夜喬裝給王錫爵送去了回信。可當王錫爵打開密信一看，頓時石化在那：
“朕深爲汝之忠誠所感動，然朕說過，明年才行冊立之事，此事既出朕口，當爲聖旨不再變動。但朕昨晚讀祖訓，太祖有訓曰：立嫡不立長。今皇后年紀尚輕，若將來誕了皇子，爲之奈何？封太子否？封王否？若封王，則有違祖訓，於禮制大不合；若封太子，豈非有兩個太子乎？朕深感爲難，尋思一宿，不若將三位皇子皆封爲王，數年後，若皇后實在無子，則立長子未遲也。如此般，既不違祖制，又能將此事了結，善莫大焉！汝不妨如此辦即可。”
這……王錫爵覺得有些頭暈，可情況確實如此啊，皇后現在不能生，不代表以後不能生嘛！萬一以後生了皇子，現在早早的就把太子給立了，那將來豈不是更加地麻煩？不過也不能完全按皇上的意思辦，他左思右想，拿出了自己的一套方案：不如讓皇長子拜皇后爲母，這樣既是長子也是嫡子了，這下事情就解決了；實在是不行了，再把三個皇子都封爲王——萬曆其實已經這麼幹了，他把三皇子封爲了福王，只是僅僅是名稱上，並沒有給封地和府邸等，僅限於在皇宮內稱呼而已。目的也就是爲了讓大臣們放心。可就是這樣，才讓大臣們感覺惶惶不可終日，現在再不立太子，恐怕就晚了！
這下正和萬曆的意。王錫爵英明瞭一輩子，這下卻徹底地被皇上給繞暈了，中了萬曆的圈套。經過一段時間的謀劃，萬曆突然對天下下了聖旨：“朕有三子，長幼有序。太祖訓曰，立嫡不立長。然現今無嫡子，皇后年紀尚輕，日後若誕嫡子，也未可知。不若將三子皆封爲王，將來若有嫡子，則立嫡子爲太子；若無，則立長子。此事朕已定，將昭告天下，汝等皆按此照辦便是。”
這聖旨一發到禮部，立馬就引起了滔天巨Lang！這是怎麼回事？這麼大的事情，怎麼事先一點動靜也沒有？那三皇子確實是被稱爲福王，可大家都以爲，正是因爲皇上沒有立他的打算，纔在稱呼上早早地把他稱爲王爺。可現在這算什麼事？居然連皇長子也要封爲王！這太不正常了！內閣怎麼會通過這麼一個餿主意？
於是禮部爲首的幾個人一合計，乾脆就直接跑到了內閣去質問，到底是怎麼回事？
結果到了內閣，看到這樣一封聖旨，趙志高和張衛也傻了眼。什麼聖旨，什麼三王並封，自己是一點都不知道哇！王錫爵大人睡着了麼？他怎麼能繞過內閣的其他人，擅自就把這聖旨給發下去了？禮部的大人們一看這場面，敢情內閣的另外兩個人也不知道，那就肯定是王錫爵幹得了！
這不是扯淡麼？萬曆臨幸皇后的次數，五個手指頭都數的過來！再者皇后本來就不能生育，雖然並沒有確認，可這的確是後宮的一大丑聞！至於生兒子更是不可能的事情！那個什麼三王並封，壓根就是扯淡的事情，是皇上不願意立太子而故意乾的，王錫爵你好歹也在朝廷混了這麼多年，怎麼連這也看不出來？
滿朝再一次被震動了。這下不僅僅是言官們，連內閣六部六科甚至地方大員，都緊張兮兮地等着，下一場暴風驟雨的到來！皇帝居然想出這麼個餿主意，還拿祖訓說事，什麼立嫡不立長，祖訓也沒說，三皇子並封爲王啊！天下哪有這樣的道理，皇帝拖着不立太子，這不是要天下大亂麼？