三天之後，清廷果然任命袁世凱爲欽差大臣，代表朝廷赴山東表彰嘉獎海外華人。
不過收到聖旨之後，袁世凱卻是頭大如鬥。清廷的官員中，和華東政府接觸最多，私交最好的官員，首推自然是李鴻章，而第二個就是袁世凱。因爲海外華人入主山東時，袁世凱是當時的山東巡撫，是他和海外華人辦理交接手續，後來袁世凱出任直隸總督，駐地就在天津，和華東政府的天津新區比鄰，幾乎天天都有接觸，而袁世凱也刻意的和海外華人交結示好，因此雙方一直相安無事，並且經常會面，算是建立了不錯的私交。
但這一次的輿論風波，袁世凱是知道的，朝廷確實是做得不大地道，海外華人這回確實是給中華長了臉，而朝廷只到現在纔想到嘉獎他們，實在是太不應該了，而且袁世凱清楚，如果是別的官員或許還會給朝廷一個臺階下，而海外華人本來對朝廷就不怎麼恭敬，甚致有不少人公然出言不遜，現在自然是更不會買朝廷的帳了。那麼朝廷派給自己的這個欽差，可不是那麼好當的。
由其是袁世凱得知是李鴻章像朝廷推薦的自己，甚至懷疑李鴻章是不是在給自己挖坑。不過袁世凱冷靜下來一想，認爲李鴻章應該不是這樣的人，這樣做肯定是另有緣故。於是袁世凱趕忙寫了一封信，派心腹人連夜騎快馬送到北京給李鴻章，像他請教。
李鴻章的回信只有八個字“忍辱負重，從長計議”。老袁雖然讀書不多，但頭腦絕對好使，立刻就茅塞頓開了。因爲朝廷必須要有一個和海外華人有私交，能夠說得上話的人，雖然現在有李鴻章在，但李鴻章畢竟已經是８０歲的人了，還能再支撐幾天，而等李鴻章之後，能夠用得的就只有袁世凱了。李鴻章向朝廷推薦袁世凱，其實就是告訴朝廷，除了他之外，只有袁世凱是能和海外華人說得上話，同時也是讓袁世凱多和海外華人溝通，以後袁世凱就憑這個關係，可以在朝廷中立於不敗之地。這也就是從長計議的意思。
而忍辱負重就更好理解了，無非就是叫袁世凱裝孫子。其實李鴻章心裡十分清楚，海外華人是肯定不會忠於清廷的，但李鴻章估計，至少在１０年之內海外華人是不會和朝廷翻臉，除非是朝廷首先發難，因此這一次海外華人也不會真的就反了，他們這樣鬧騰，不過是要把自己打扮成中華的正統代表，爭取民心，而鬧到現在這一步，其實也差不多達到了目地。而袁世凱和海外華人有些交情，如果朝廷再放低身段，海外華人也就會順梯下牆，多半不會爲難袁世凱。
想通了這一層道理，袁世凱就立刻來了精神，趕忙和天津的李鬆晨聯絡，通告華東政府，自己出任欽差，要到青島去嘉獎他們，同時又以個人名議，給秦錚發了一份電報，首先對華東政府的護僑行動大嘉讚揚一番，並且也說了幾句朝廷不對，然後又說自已是受朝廷委派，身不由己，懇求海外華人不要爲難自已，言辭十分謙卑。然後才從天津出發。
到達青島之後，袁世凱也十分低調，處處謙恭，絲毫也沒有擺欽差大臣的架子，而華東政府到也沒有爲難袁世凱，畢竟現在華東政府下一步的主要目標是日俄戰爭，因此還不想正式和清廷撕破臉，而且爪哇護僑所需要達到的效果也基本都實現了，正好可以借這個臺階下來。
不過這次清廷對穿越者的嘉獎也確實是出了血本，首先是正式給山東建藩，穿越者可以開府理事，委任省內的各級官員，這也就是正式承認了山東的割據地位，而夏博海、秦錚、肖建軍、王雲鵬、徐濟超五人全部都被封爲一等公爵。清廷入關立國２６０餘年，除了王朝初立時設過三藩之外，外姓功臣被封爲一等公爵的一共也只有４個人。曾國藩、左宗棠、李鴻章都算是爲清廷盡心盡責，勞苦功高，並且位及人臣，但生前的爵位也只是一等伯爵，死後才追封一等候爵。因此確實可以算是特別的殊榮。
除此之外，清廷還封出了2個二等公爵，4個三等公爵；候爵１6個，伯爵35個，彷彿爵位像不要錢一樣批發着賣。另外還賞下了黃馬掛166件，賜號驃勇巴圖魯67個，共計受封的超過了300人，其中還包括62名女穿越者或本土的女歸化民，都是被封爲誥命，這還是由於穿越者結婚的不多。而且還賞給受封的每個人不少禮物，另外還額外賞給華東政府100萬兩白銀，還有光緒、慈禧親筆賜字６幅。
雖然封出去的都是虛街，而且清廷也不打算支付奉祿，但畢竟是有正式的委任詔書，不要說是在清朝，歷代都沒有這樣大封爵位的事情。
當然袁世凱也不敢讓穿越者跪迎聖旨，連當衆宣讀的程序都免了，直接把聖旨及所有委任書交給秦錚了事，而受封的穿越者也沒有上折謝恩，就這樣對付過去。
而袁世凱也終於鬆了一口氣，不管怎麼說，自己可以回去有交待了，而且自己畢竟是完成朝廷的任務，應該算是立了一功。另外也坐實了自己能和海外華人交流的地位，以後肯定是前途廣闊，但也多虧了李鴻章，看來薑還是老的辣，自己還是要對李鴻章尊敬一樣。
應該說清廷的這一手還是有一定作用的，這一批不計成本的嘉獎，也讓輿論消停了不少，儘管還有人指責清廷的封賞太慢，而且全是虛職，但聲勢巳經小得多了，而還有一些清廷的死忠，或者對清廷還有一定感情的人甚致同情起清廷，海外華人這也太不講理了，就算是立了天大的功勞，但逼得朝廷一下子發出了60多個爵位，還讓山東正式建藩，這不是要造反嗎？因此指責海外華人的聲音又漸漸有了擡頭之勢。不過這樣撕逼畢竟是進入了尾聲，再也不能造成大影響。
這一次再次顯示了李鴻章的作用，而且由於榮祿己死，因此清廷也對軍機處進行了一次大調整，慶親王奕劻仍然擔任軍機領班，而李鴻章升到第二位，滿軍機中，又增補世續進入軍機，漢軍機則調整較大，免除了王文韶、趙舒翹兩人的軍機大臣之職，而補鹿傳霖、瞿鴻禨兩人進入軍機，這樣仍然保持４滿４漢的平衡局面。
榮祿的死使滿軍機少了最有份量的一個，雖然補了一個世續進來，但無論是資歷、能力、威信都遠不如漢軍機，儘管人數相同，但天秤卻是倒向了漢軍機的一邊，因此必須對漢軍機進行調整，李鴻章是首先不能動的，張之洞不僅是朝廷重臣，而且還有牽制李鴻章的作用，也不能動，只好拿下王文韶、趙舒翹，而補進鹿傳霖、瞿鴻禨這兩個資歷較淺的人，免強還可以維持平衡。
可以說慈禧的這一番動作確實是用心良苦，而李鴻章也苦笑不語，反正這時張佩綸夫婦己經在盛宣懷的幫助下，在青島正式投資了50萬白銀，成立一座紡織廠，算是綁上了海外華人，而在清廷這邊，還有袁世凱，因此自己只要再熬過幾年，一閉眼就不管事了。
淸廷算是免強挺過去了這一次，但爪哇護僑行動所影響的決不是隻有清廷，對遠東地區的各國也都紛紛評估這次事件所造成的後果，以及本國的行動。
首先是俄國認爲華東政府的護僑行動對自己有利，因爲在這次事件中，英國顯然是站在荷蘭一邊，和華東政府對立，而從結果來看，是以荷蘭讓步結束，英國的干涉似手並沒有起到什麼作用，而俄國卻從中看到了機會，認爲這正是分化華東政府、日本、英國這個反俄合作的大好時機。
於是俄國立刻向華東政府頻頻釋放善意，通過青島領事館，向華東政府表示，在爪哇問題上，俄國支持華東政府的立場，可以幫助華東政府對抗英國，並且希望和華東政府、清廷重新談判解決東北的撤軍問題；還一再強調，俄國對中國的領土沒有野心，只是需要解決一些撤軍的細節，還有在東北的俄國商人安全利益問題，只要是解決了這些問題，俄國會立刻從東北撤軍。
俄國的盤算是，只要談判一開始，就可以分化華東政府和日本、英國的合作關係，而且就算華東政府、日本、英國的合作關係不破裂，但這一談起來少則6、7個月，多則年餘，這段時間內華東政府是不會參與日本的軍事行動，這就給俄國贏得了足夠的準備時間。
不過華東政府的迴應是：爪哇問題己經圓滿解決，華東政府和英國政府沒有矛盾，雙方之間仍然保持良好的合作關係，並且一口回絕了俄國重新談判的要求，堅持要求俄國尊守【東三省交割條約】的規定，無條件從中國東北地區撤軍，絕不會重新和俄國展開談判。但華東政府卻要求和俄國進行旅順的商業談判。