自從趙繼統提出使用***轟炸日本的提議之後，美國航空軍的指揮部發出了將“試驗性”***空襲提到了優先位置的新命令。
45年1月柯蒂斯·李梅(Curtis LeMay)少將被任命爲第21轟炸機部隊司令，2月23日至24日首次對東京採取大規模***攻勢，當晚174架B-29轟炸機在東京拋下大量凝固***(Napalm)，把東京約2.56平方千米的地方焚燬。這更堅定了美國實施大規模夜間火攻的決心。
李梅重新評估局勢，想出了一個重大的戰術變化。他決定在下次的任務中，拆除轟炸機上所有的槍炮炮塔以及彈藥 (只留下尾機槍手)，以減輕 B-29 的重量，以攜帶更多的***，並在五千到六千尺的低高度間展開夜間轟炸。引發大火來震撼日本國民，破壞散佈在居民區的生產零部件和預製件的小作坊，達到徹底癱瘓日本軍事工業的目的。
爲避免不必要的傷亡，空襲時各轟炸機單獨轟炸而不進行編隊。由前面的轟炸引導機首先投彈, 引入目標區。該計劃使已經習慣了安全的高空投彈方式的轟炸機組人員疑慮重重。李梅發現日軍夜戰裝備不足，而且李梅決定延後將計劃呈送華盛頓的時間，由自己承擔這次作戰任務的全部責任。
隨後在3月9日至10日，美軍再派出334架B-29轟炸機從馬利亞納羣島出發，再次使用凝固***對東京進行持續2小時的地毯式轟炸，每架飛機攜帶六至八噸***，燃燒面積可達6500平方米。爲避免不必要的傷亡，空襲時各轟炸機單獨轟炸而不進行編隊。
當晚東京出現火災旋風，334架B-29共投下了超過2千噸***，產生的高溫足以使區內所有可燃物(包括人體)燒着，造成近10萬人死亡，近41平方千米的地方被焚燬，主要是皇居以東的地區，東京約有四分之一被夷爲平地，其中18%是工業區，63%是商業區，其餘是住宅區。
計劃中的22個工業目標全部摧毀，26萬7千多幢建築付之一炬，上百萬人無家可歸，83793人被燒死，超過1923年9月1日東京大地震的死亡數(7.3萬人)，10萬被燒成重傷。
空襲中有9架B-29被擊落，5架負重傷並在海面迫降，42架受傷其餘飛機返回了基地。大火之後的清理工作進行了25天。
3月9日的轟炸可能是人類歷史上最具破壞性的非核武空襲，這比二次大戰中任何一次軍事行動都造成了更多的傷亡，破壞力可以和後來的原爆相比。火攻東京後不到30小時，317架B-29轟炸機又夜襲名古屋，使該市的飛機制造中心化成一團火焰。
13日，日本第二大城市大阪也遭到了300架B-29的轟炸，使用了1700噸***，約20.7平方千米的市區在3小時內焚燬。
16日，美軍又轟炸神戶，使其造船中心被摧毀。美軍於四、五、六月又大舉空襲日本各大中小城市。
4月13日，皇宮與宮殿一部分被焚燒，明治神宮化爲烏有。其後美軍在5月26日再一次派出470架飛機轟炸東京，造成7415人死傷，22萬間房屋被焚燬。連月來轟炸使東京有一半的建築物被摧毀。
到7月4日時美軍宣佈當時日本已遭受10萬噸**的轟炸。美軍轟炸過程中許多東京市民逃離出城。策劃轟炸行動的柯蒂斯·李梅派美機投下警告傳單，通知下一步轟炸的目標，使他們更加恐懼。僅東京就有上百萬人逃往農村，工廠工人的出勤率不到從前的一半。
轟炸東京及其他城市使日本戰時經濟陷入癱瘓。空襲東京的同時，美軍也開始空襲九州、四國和臺灣。同時，第十集團軍各突擊梯隊進行海上航渡。
3月23日起，艦載機和艦炮對暴露的防禦設施開火，並伺機消滅日軍近海攻擊艇隊。一連串的失利令內困外焦的小磯內閣於4月5日總辭職，樞密院議長鈴木貫太郎海軍大將受命組閣。他下令拆分本土防衛軍，組成第1總軍和第2總軍。杉山元被任命爲第1總軍司令官。
司令部設在東京市谷臺的舊預科士官學校本部。主要負責津輕海峽以南包括石川、歧阜、愛知、三重縣在內的本州東部地區。第1總軍下轄第2方面軍、第11方面軍和第13方面軍，共30個步兵師團，2個坦克師團，2個高炮師團等，約有兵力70萬。
畑俊六元帥爲第二總軍司令官，其司令部設在廣島，負責日本西部地區即名古屋以西至九州的防禦作戰任務，下轄第十五方面軍（司令官內山英太郎大將，駐大阪）的9個師團又3個旅團；第十六方面軍（司令官橫山勇中將，駐福岡）的15個師團又11個旅團。
杉山元還搞了一個“一億玉碎”的計劃（當時全日本人口在一億人上下），意思就是全民皆兵，爲日本戰死。全民參戰是事實，但是全民玉碎有點誇張，定此計劃的人，是真的是打算玉碎的，他們認爲小孩子不但在戰爭時幫不上忙，而且還會拖累日本，計劃將十五歲以下的小孩處死···
天皇爲此還特別召見了趙繼統，他很明確的表示不同意這個計劃。姑且不論戰爭的勝與敗，作爲百姓老百姓擁戴的天皇、**，首先要確保其生命、財產的安全，然後是保證其種族能夠千萬帶延續下去。
“一億玉碎”計劃聽着很悲壯，卻也將和平解決之路徹底堵死。照此執行的話，大和民族會徹底成爲歷史的印記，日出之國的名字也將遺失在歷史長河之中···
杉山元聞之，痛罵趙繼統是個養不熟的“狼崽子”，要脫了他的軍服，將他再次送進監獄！可是沒想到趙繼統的支持者也不少，其中就包括新任的首相鈴木貫太郎大將以及他的頂頭上司——參謀本部的參謀總長梅津美治郎大將，所以杉山元雖然是元帥，暫時還奈何不了趙繼統。