故事的主角是十七歲高中生小實，從他遇見怪人方鴻卿說起。 方鴻卿是南大文物保護專業研究生，在南京博物院實習的他，無意中在夜半的博物館中遇見種種怪事：夜半謎樣的水跡、辛追屍身的變化、嗚咽不止的簫聲…千年之後重見天日的六孔簫，竟引來秦朝焚書坑儒時的一段悲慘往事，讓方鴻卿下定決心，將文物還回秦朝女子的墓中。 方鴻卿結識了好友秦秋，與販賣文物的趙老闆及一干盜墓賊鬥智鬥勇。之後又與小實一起，三個人經歷了一系列的奇異事件： 一塊破舊玉璧，拉開南宋黃天蕩一役，韓世忠與梁紅玉的生死戰局； 北宋定窯白瓷嬰兒枕，帶來父子骨肉親情與約定承諾的抉擇，天倫夢斷，令人垂淚； 更令人意想不到的是，恆山嶽陽廟的吳道子壁畫天宮圖，竟然影射出打開武則天乾陵的方法…