諸葛長民無論如何也料不到，劉裕已於夜晚輕舟疾進，不經新亭，神不知鬼不覺的進入了東府。次日清晨，諸葛長民遇使者來報“太尉有請諸葛刺史。”長民大驚，心知已殺不了劉裕，便要前往。
諸葛黎民阻止道“劉裕已經起了疑心，此行一定凶多吉少，不可前去。”長民道“我若不去，更增他的疑心，況且我並未造反，他未必會殺我。”“那我隨兄長一同前往。”來到東府後，長民與黎民待要入門，守衛交舉戟槍攔道“太尉有令，只請諸葛刺史一人”諸葛黎民無奈只得在外等候。
劉裕開門見山對諸葛長民說道“當年劉毅隨我共起義兵，我待之如同兄弟。這番使其做荊州刺史，對他不可謂不厚。無奈他想謀反作亂，其死乃是自取。長民兄弟，你我相識多年，我待你亦不薄。可是你所爲多不法，百姓視你如仇。我本想饒你，只是奈國法與百姓何!”長民乞道“太尉能否看我往日功勞，饒我一命。我願回丹徒做一步衣。”劉裕怒道“桓氏之亂你爲刁逵所擒，險些誤我大事。盧循進犯京師你竟想帶皇帝渡江避難，若依你晉朝早就完了。你何功之有？”說完又將諸葛長民寫給劉敬宣的信拿給他看，“你要殺我，我豈能再容你！”諸葛長民哭泣說道“狡兔死，良狗烹。我今日入地，祝你早日升天!”劉裕怒拍桌案，早就藏於帳中的壯士丁旿突出，一錘擊中諸葛長民之頭，長民當場斃命。
在外的諸葛黎民久等不見長民出來，感覺不妙，拔劍格殺四名衛士，闖了進去。看到躺在地上的哥哥，大怒罵道“劉寄奴，你如此狠心，日後定爲國賊。”黎民勇力不凡，丁旿此時又手持單錘，兩人格鬥良久，丁旿才一錘擊斷黎民之劍，又一重錘擊中其胸斷其心脈而死。
百姓得知長民死後紛紛慶賀，拍手稱快。而劉穆之卻責怪劉裕“諸葛長民犯法確實該死，可是如果將他交付廷尉，依法處置豈不是更好？用這等黑暗手段，怕有失公道啊。如今豪族大姓都相互警戒，民間甚至有了‘莫跋扈，付丁旿’之說！”劉裕改容稱謝道“是我思慮不周，殺他之心太急了。愛卿之言我將謹記在心。”
內亂都已平定，劉裕決定再次伐蜀，自說道“譙縱，你的好日子要到頭了。”平蜀選將，劉裕難得其人。劉穆之推薦朱齡石，劉裕與其相談，也覺其才幹不凡，見識過人，定能勝任。但諸將佐都認爲朱齡石年紀輕輕且資歷甚淺，難以服衆。劉裕斷言道“朱齡石祖輩數代爲將，必能辦成此事。諸君無須再言！”便令朱齡石爲益州刺史，使臧熹、蒯恩、劉鍾等爲副，領軍二萬餘前行。臧熹由於是劉裕妻弟，爲劉裕所眷顧，此時官已在朱齡石之上。但此番伐蜀，劉裕特意使之爲副，並囑咐道“齡石年輕，我恐諸將不服，因此以你爲副，你要爲齡石之命是聽，諸將絕不敢有貳。若有違節度，軍法從事！”
前番伐蜀，毛修之請行，劉裕不許。怕他因與譙縱和當地居民仇恨太深，多所誅殺。這次毛修之仍然固請不已，劉裕便答應了，讓他跟隨臧熹前往。
出發前，劉裕私下對朱齡石說道“往年伐蜀，劉敬宣從內水出發向黃虎進軍，無功而返。若依尋常而論，蜀人必認爲我再次行軍會從外水出發。但那譙縱頗有些見識，一定以爲我仍會從內水出發。因此他必然以重兵守涪城以防備內水之道路，成都防守一定空虛。所以這次我要你帶大軍從外水出發，進向成都，克之必矣。此乃極密軍機，不可泄露。我另有密函一封，到白帝城再打開。”朱齡石回道“謹受太尉之令”並接下了密函。
413年6月，朱齡石帶軍進至白帝城。發函一看，劉裕已在信中佈置好諸軍。齡石當即下令“太尉有密令：沈田子帶數百老弱之卒乘高艦十餘艘，從內水出發向黃虎，虛張聲勢吸引敵軍，爲佯攻。臧熹帶兵二千從中水出發進攻廣漢，作爲助攻。其餘將士全部隨我從外水出發，進攻成都。”
譙縱果然命譙道福將重兵三萬餘去守涪城。朱齡石帶軍來到平模，距成都有二百里。由外水之道進軍成都必須經過此地，而侯暉與譙詵仍率領着近一萬兵力夾岸築城於此地屯守。朱齡石看敵方城守堅固，眼下又值盛暑，酷熱難耐。朱齡石與劉鍾商議道“天氣如此，攻城難以得利。我們不妨先休兵養銳，慢慢伺敵之隙。日久敵衆心中必然不安，到時兵不血刃即可下城。”劉鍾回道“此乃自危之道，使不得。我們已派出虛兵去佯攻涪城，譙道福必不敢離開涪城前來。如今我大軍突至，出其不意，賊徒已經破膽。我們盡銳急攻，其勢必克。然後乘勝鼓行而前，可一舉拿下成都。若緩兵相守，徒老我師。日久敵方必然知我軍虛實，譙道福回軍來攻，敵衆人情安定，我軍二萬衆將盡爲蜀虜”。
朱齡石採納了劉鐘的建議，準備攻城。北城地險兵多，諸將都認爲應先攻南城。唯獨劉鍾說道“攻下南城，亦於北城無損，並且傷我兵力。不如合衆攻下北城，南城將不攻自破。”朱齡石讚道“劉將軍所言甚善。”於是朱齡石督諸軍急攻北城。劉鍾與蒯恩冒矢衝鋒，率衆先登。劉鍾手斬數員大將，不提防侯暉斜刺裡突來一刀斫中右臂。劉鍾大吼一聲，劍眉倒豎，刀交左手，勇戰侯暉。刃接數合後，劉鍾一刀砍斷侯暉持刀之手腕，將其一腳登翻在地，劉鍾舉刀彎腰，待要結果其性命。而此時不遠處的譙詵已張弓瞄準劉鍾，正欲發射，忽然倒地，射出的箭也已走偏。原來譙詵此舉被朱齡石看到，朱齡石趕忙抽箭急射，一箭射穿了他的頭部，箭貫雙耳。北城攻克後，旋師而南，南城之軍果然不戰自潰。大軍繼續往成都前進。