現在是八月下旬，朱由崧把登基大典定在了十月初一，給了高弘圖和王鐸一個多月的籌備時間，三十多天的時間看似漫長，但一國君王遷都之慶典，千頭萬緒，需要做工作太多了。
尤其是朱由崧從南京遷都北京，不是一般的遷都，這是一個後世穿越者三身一體的君王，光復大明之後的遷都，可以看做一次朝代的革故鼎新。
因此這次遷都是大動作。這三十多天朱由崧也沒閒着，白天和金皇后，嬋兒，馬金花，賀宣嬌，邢畹芳，歌舞昇平，看看小柳是的琴棋書畫和武藝，晚和幾個美女滾滾牀單。
除了這些宮的生活之外，朱由崧當然得着手處理朝政，雖然現在他還沒登基，但是百廢待舉。
一個月後的登基只是個形式，治國理政纔是最重要的，新遷北京介時當然得有新氣象新舉措，而不是隻是像其他帝王一樣，只是都城改變了，政策順延，坐在龍椅接受百官朝拜那麼簡單。
首先是舊都南京。南京那一套也是崇禎的舊制該改革的必須改革，但是朱由崧仍然讓南京作爲陪都。
因爲他知道現在雖然通過他一年多的努力，光復了大明，恢復了崇禎時代的大明版圖，只是把韃子趕出了原，但是內憂外患的局面並沒有徹底消除，而且又多出了兩個國之國。
那是大順政權和大西政權，不管歷史承認不承認，這兩個政權真實存在，而且是勢力佔去了好幾個省，他們兩家的軍隊加在一起不下百萬，能征慣戰的戰將數千員，這對根基不牢的大明朝是很大的威脅。
朱由崧想到過一鼓作氣剿滅他們，但是連年的征戰，民生凋碧，老百姓生活在火熱水深之，不說別的，糧餉這一塊是個大問題。
國庫如不敷出，各地天災人禍不斷，根本無力支撐戰爭的巨大開銷。
這一年多來，朱由崧對軍閥作戰對韃子作戰，靠的主要是查抄朝和軍隊的大老虎所得，還有打勝仗所得的戰利品，另外他又從內帑拿出了一部分，這樣即湊合才勉強讓戰爭支撐到現在。
如果再打下去軍糧供應這個問題。必須籌措糧餉，夏糧雖然下來了。但是除了養活朝廷和各級官僚，賑災的都不夠，從老百姓身增加賦稅糧餉，無疑是自取滅亡之道。
老百姓現在是苦不堪言，很多地方甚至出現了饑民相食的現象，再增加他們的負擔，無疑於官逼民反，李自成和張獻忠現在還沒擺平。
對老百姓必須減阻減賦，才能取得他們的支持，但還得增加收入，這是個矛盾，要解決這個矛盾，必須休養生息大力發展生產，另外，可以從大地主大商人身增加賦稅，但這無疑是一步險棋，必須得運籌好。
另外江南並不穩定，不說別人，海盜出身的鄭芝龍不是一個省油燈。
現在朱由崧要做的是，喘息一下，一方面休養生息，一方面加強練兵，等兵強馬壯，兵精糧足時，剿滅這些流賊不在話下，他還要開疆拓土。
日後他臨幸江南或者御駕親征時，南京可以作爲暫時的國都使用。
因而，朱由崧延續崇禎帝的做法，這也算是保持了明末的特色了，在南京保留了一班人馬，包括太監和錦衣衛在內，只是人員編制壓縮了七成，只留下三成。
讓年事已高的姜日廣、劉宗周和黃道周在南京從鎮經營陪都，軍事留下五萬大軍由閻應元等江陰三公負責南京的防守，他們在編制屬於京營兵的分支，即隸屬於北京的京營兵。
然後朱由崧傳旨，撤銷五軍都督府，成立京營殿帥，負責戍守京師，京營兵編制一共十五萬，其駐守北京的十萬，駐守南京的五萬，成立保護皇城和宮城的御林軍，員額也是五萬，設指揮使一人，指揮同知一人，指揮儉事一人，御林軍直接對朱由崧負責，兵部和內閣均無權調動。
仍然設六部，但政權和軍權分開，從此後內閣首輔不得再兼兵部尚書，地方官也不得再掛武銜，這意味着結束了長達二百多年官壓制武將的局面。
自洪武大帝朱元璋立國開始，大明朝官壓制武將的禍根種下了。
朱元璋自作聰明，在北方驅趕了蒙元，在南方消滅了南漢王陳友諒和蘇州王張士誠等，將各地的武裝割局勢力全部消滅了。
這些武將飛鳥盡，良弓藏。現在能幫他打聽一下，將來有可能推翻他的天下，因此，朱元璋設計把跟他一塊兒打天下的淮西二十四將幾乎全都收拾了。
但他仍然對武將不放心，於是讓官壓制武將，從此以後朝的權勢大臣全是官，有的甚至掛武銜，真正的武將戍守邊疆，但這些武將只是屯兵練兵養兵，真正打仗的時候，他們並沒有兵權，調不動一兵一卒。
這便是大明朝獨有特色的衛所制，戰爭起來的時候，皇另行委派武官拿着聖旨令箭從衛所裡調兵，打完仗以後再把這些部隊歸還原來的衛所。
這樣做武將們的實力被大大削弱，對他的央政權是沒有威脅了。但是有利必有弊，最大的弊端便是官壓制武將也便於拉攏武將而變得驕橫跋扈，結黨營私，甚至跟朝廷分庭抗禮，這便是後來的黨爭。
黨爭是大明朝滅亡的原因之一。
還有一個大的弊端是，衛所制下，軍紀廢弛，疏於訓練。導致兵員素質嚴重下降，以至於到明朝後期，積重難返。大明的正規軍打不贏山野流賊，更打不贏關外的韃子。每每開戰，只能憑大炮或者堅成被動防守，野戰根本是沒有勝算。
朱由崧作爲一個穿越人，當然知道明朝的這一弊端，要改變這些，必須從制度進行根治，因此他對這些進行了大刀闊斧的改革。
朱由崧這樣做的結果是，官和武將平起平坐，爲下一步練兵尚武做準備。
經過多日準備，一個皇權專斷的大帝國呼之欲出了。