蒙哥爭得汗位
公元1246年，在乃馬真後的操縱下，宗王貴族們召開會議，背棄了窩闊臺遺命，推舉貴由當了大蒙古國第三任大汗。拔都十分不滿，拒絕參加會議。
貴由本來就與拔都有着尖銳矛盾，如今更是氣憤，他登基不久，就整頓兵馬，準備攻打拔都的欽察汗國。
公元1248年，貴由以西巡爲名，帶領軍隊向西進發，意圖征伐拔都。不料，行至半途，貴由突然患病，很快死去，時年四十三歲。也有人說，貴由是拔都派人刺殺的。貴由突然離世，避免了大蒙古國一場內戰，但使得汗位之爭變得更加複雜和激烈。
貴由死得突然，沒有指定繼承人，按照慣例，由貴由的皇后海迷失後攝政。海迷失後比不上乃馬真後，她沒有才能，又好巫術，不能控制局勢，朝廷一片混亂。
貴由死後，不少人主張，仍然遵照窩闊臺的遺命，立孫子失烈門爲繼承人，由海迷失後攝政。可是，貴由的兩個成年兒子不服，認爲應該父死子繼，於是另建府邸，與其對抗。三方都擅發文書，頒降令旨，形成了一國三主，朝廷處於混亂之中。當時又遇大旱，水泉盡涸，野草自燃，牛馬十死八九，民不聊生。
成吉思汗有四個嫡子，其中三子窩闊臺繼承了汗位，如今窩闊臺家族發生內訌，爲爭汗位鬧得不可開交。次子察合臺歷來與窩闊臺家族關係密切，沒有爭權野心。長子朮赤家族卻與窩闊臺家族長期不合，而與四子拖雷家族關係較好。因而，成吉思汗的四個嫡子，就分成了兩派。
拖雷雖然早逝，卻生了幾個優秀的兒子，其中蒙哥、忽必烈、旭烈兀、阿里不哥四人，都是胸懷大志、有勇有謀，而且久經沙場，屢立戰功，聲望很高。他們見窩闊臺家族發生內亂，便想趁機謀取大汗之位。他們的計劃，得到了朮赤兒子拔都的支持。
公元1250年，拔都以長支宗王的身份，在他的封地欽察汗國召開了宗王貴族會議，推舉大汗繼承人。按照制度，宗王貴族會議應該由攝政的海迷失後召集和主持，因而窩闊臺系、察合臺系和許多宗王貴族拒絕參加。不過，前來參加會議的人仍然不少。
會議展開了激烈的爭論。傾向窩闊臺的畏兀兒貴族慷慨激昂地說：“皇孫失烈門，是先汗窩闊臺欽定的繼承人，先汗遺命不可違，繼承人非失烈門莫屬。”
有人質問他：“你說得很對，可是，當初乃馬真後違背先汗遺命，讓貴由做大汗的時候，你怎麼不說這話呢？”畏兀兒貴族面紅耳赤，無言以對。
最後，拔都發言，振振有詞地說：“先汗窩闊臺的遺命，固然應該遵守，可是，遺命已經被他們自己人破壞了，因而不宜再做爲推舉大汗的依據。我們推舉大汗，目的是讓新大汗帶領我們走向更加強盛。諸位想一下，蒙哥年富力強，智勇雙全，功勳卓著，名望甚高，還有誰比他更合適嗎？何況，蒙哥是先汗窩闊臺的養子，繼承汗位，先汗也一定會高興的。”窩闊臺確實很喜歡蒙哥，收爲養子，從小把他養大。
拔都的話合情合理，他又有着很高的威望，於是，大部分人都同意蒙哥爲汗位繼承人。蒙哥的聲望進一步提高。
海迷失後和窩闊臺家族的人聽說以後，又驚又怒，向各地傳詔，說推舉汗位繼承人是大事，歷來的宗王貴族會議都在聖地斡難河召開，拔都卻在他的封地欽察汗國召開，不具備合法性，因而不能承認。
面對這種情況，蒙哥沒有貿然登基，而是做了大量收服人心的工作。拔都家族和蒙哥家族聯合起來，四處遊說，廣泛拉拔宗王貴族和朝中大臣。蒙哥在各方面確實十分優秀，被人們廣泛認可，推舉蒙哥爲大汗的呼聲越來越高，逐漸形成了共識。後來，連窩闊臺和察合臺家族的一些人，也轉變立場，擁戴蒙哥爲大汗繼承人。
公元1251年，蒙哥他們做好了充分準備，再次在聖地斡難河召開了宗王貴族會議，絕大多數宗王貴族都應邀前來，包括窩闊臺系和察合臺系的部分成員。窩闊臺家族的失烈門等人仍然拒絕參加，但大勢已去，無法阻止了。
宗王貴族會議開得毫無懸念，一致推舉蒙哥爲大蒙古國第四任大汗。從此以後，汗位繼承由窩闊臺家族轉向了拖雷家族。窩闊臺系和察合臺系部分成員不服，由此埋下了大蒙古國分裂的種子。
蒙哥時年四十三歲，他閱歷豐富，剛強堅毅，即位後採取一系列措施，鞏固了自己的統治。海迷失後和失烈門等人拒不承認蒙哥的汗位，企圖發動政變。蒙哥早有防備，一舉粉碎了政變陰謀，處死了海迷失後，囚禁了失烈門等人。蒙哥借平息政變之機，將窩闊臺、察合臺系中的反對勢力一網打盡，共誅殺七十七人。
爲了削弱窩闊臺系的勢力，蒙哥將窩闊臺的封地一分爲五，使其分散弱化，形不成統一的力量，同時對察合臺汗國的勢力，也進行了限制弱化。窩闊臺系和察合臺系的力量遭到沉重打擊，對蒙哥的統治構不成威脅了。
與此同時，蒙哥擴大拖雷系和朮赤系的領地和勢力，朝中重要職位多數由這兩系的人員擔任。當時在大蒙古國統治區域，漠南漢地最爲富裕和重要，蒙哥將這一地區交給弟弟忽必烈統治。忽必烈大喜，精心治理此地，爲日後爭奪汗位、建立元朝奠定了基礎。
蒙哥胸有謀略，手段強硬，在不長的時間內，就鎮壓了反對派，鞏固了自己的統治，加強了中央集權，牢牢控制了局勢，大蒙古國繼續興旺強盛。
蒙哥鞏固了自己的統治之後，依然走軍事立國之路，開始對外用兵了。