蒙古諸王叛亂
忽必烈在爭奪汗位、與阿里不哥內戰的時候，蒙古貴族支持他的不多。忽必烈建立元朝、實行中央集權制度，又觸犯了蒙古貴族的利益。因此，蒙古諸王不斷髮生叛亂，其中海都叛亂長達三十餘年。
海都是窩闊臺的孫子，聰明能幹而又狡詐。成吉思汗把窩闊臺指定爲繼承人，並且說，只要窩闊臺家族有一個吃奶的後代，就比其他人有優先繼承權。可是，拖雷家族的蒙哥卻奪走了汗位，窩闊臺家族對此十分怨恨，海都更是憤憤不平，發誓報復。
蒙哥死後，他的弟弟忽必烈和阿里不哥發生內戰。海都幸災樂禍，他支持阿里不哥，希望戰爭打得越大越好。忽必烈打敗阿里不哥以後，寬大爲懷，沒有追究海都，還封他爲王。可是，海都依然對忽必烈懷恨在心，他暗地裡聯絡一些宗王貴族，積蓄力量，準備對抗忽必烈。
公元1268年，海都聯絡欽察汗國、察合臺汗國和一些宗王貴族，召開聯盟大會，指責忽必烈被漢族同化，背叛了蒙古，宣佈出征討伐。海都在會上被推舉爲盟主。
宗王聯合出兵，勢力也不少，曾經一度攻佔了都城和林。忽必烈先後派兒子那木罕、大臣伯顏爲統帥，率軍討伐海都。海都的聯軍人心不齊，難以協調一致，被元軍打敗。海都便帶領自己的部隊，與元軍開展了多年的游擊戰，最終被消滅。
在平定海都叛亂的過程中，忽必烈派侄子昔裡吉率軍參加平叛。昔裡吉是蒙哥的第四子，在兩個叔叔內戰的時候，蒙哥的兒子們全都支持小叔阿里不哥，昔裡吉也不例外。不料，阿里不哥卻失敗了，昔裡吉只好表示歸順忽必烈，忽必烈封他爲河平王。
可是，昔裡吉仍然對忽必烈心懷不滿，趁此出兵之際，突然發難，拘捕了忽必烈的兩個兒子那木罕、闊闊出以及右丞相安童等人，也舉兵叛亂了。昔裡吉叛亂震驚了朝廷，兩個皇子被拘，平叛元軍面臨崩散的危險。
忽必烈聞訊大驚，急忙派出他最得力的大將伯顏主持平叛。伯顏有勇有謀，在軍中有着崇高威信，很快穩定了軍心，擊潰了昔裡吉叛軍。之後，元軍通過數年征戰，平定了昔裡吉叛亂，解救了皇子那木罕、闊闊出和安童等人。昔裡吉被擒後，流放致死。
在海都、昔裡吉叛亂不久，第三任大汗貴由的兒子也發動叛亂，叛軍控制了河西走廊，嚴重影響了元朝對西北地區的統治。忽必烈從南方調來軍隊，攻打河西，最終平定了貴由兒子的叛亂。
西北諸王紛紛叛亂，北方的宗王也不甘落後，遼東的乃顏公開舉兵，反對忽必烈，元朝北部也燃起了戰火。
乃顏是成吉思汗的幼弟鐵木哥的玄孫，他繼承了祖上的爵位和封地，在遼東爲王，稱霸一方。忽必烈建立元朝以後，實行中央集權，限制地方權力，引起一些宗王不滿。乃顏野心勃勃，又急躁輕率，於是產生了反心。
忽必烈得到密報，與大臣伯顏商議。因爲乃顏謀反的證據不足，伯顏自請前去觀察動向，並進行安撫。伯顏臨行時，帶了許多上好的皮衣，沿途送給驛站的官員，驛站官員無不感激稱謝。
伯顏到了乃顏營地後，見乃顏態度傲慢，反心十分明顯。伯顏以好言相勸，根本無濟於事，而且感到殺機四伏。伯顏察覺到危險，當機立斷，不辭而別，乘快馬連夜潛逃，乃顏立即派兵追殺。伯顏每到一處驛站，驛站官員總是拿出最好的馬給他換騎，所以追兵始終沒有追上。
乃顏追殺朝廷大臣，反心已經完全暴露。乃顏乾脆一不做二不休，聯合一批北方宗王，舉兵十萬，公開叛亂，準備南下攻打忽必烈。可是，忽必烈早就有了準備，做好了部署，並決定御駕出征，一舉擊垮北方諸王的勢力。
忽必烈調集大軍，兵分兩路，一路由蒙將玉昔帖木兒率領，一路由漢將李庭率領。兩路大軍從上都出發，日夜兼程，直撲遼東。乃顏沒想到忽必烈已有準備，更沒想到元軍來得這麼快，倉促應戰，屢戰屢敗，不到半年，就被消滅了。乃顏被擒，忽必烈下令將其處死。此戰以後，北方宗王的勢力大爲削弱，只得接受朝廷設置的行省節制。
忽必烈具有非凡的軍事才能，面對諸王叛亂，他沉着應對，指揮有方，將叛亂一一平定，維護了元朝的穩固和統一。可是，忽必烈對海外用兵，卻屢遭失敗，損失了大量兵力。
這其實不是忽必烈的失誤，而是有貓膩的。究竟是怎麼一回事呢？