楊文幹率領大軍企圖謀反，卻不想唐高祖李淵準備充分，快速地將他的野心消滅。數日後，唐高祖李淵率領李逍遙、李玄霸，在李靖的護衛下回到長安城。當天，李淵就召見文武大臣在紫宸殿，他要當着衆人的面宣佈太子李建成的罪責，直接廢黜他的太子之位，貶爲蜀王。
朝中文武大臣紛紛接到李淵的旨意，匆匆忙忙的趕到紫宸殿；唐高祖李淵一身龍袍，頭戴冠冕，龍行虎步的姍姍來遲。衆人見李淵凝重的神色，心中詫異不已，紛紛施禮；李淵淡淡地點點頭，然後笑道：“衆位大臣，你們留守在京師之中，可曾聽到什麼大事？”
面對着李淵的問話，衆人一陣疑惑，面面相覷，誰也不敢多言一句，又聽見李淵繼續說道：“六月的長安城酷暑難耐，朕前往仁智宮避暑納涼，將朝中大事全部交託於太子處理。衆位大人盡忠職守，卻不知近日內發生的重大事情。”
衆人更加的疑惑不解，唐高祖李淵冷笑一聲：“慶州都督楊文幹這個亂臣賊子，居然私藏軍械，意圖謀反。若非將士上下齊心，朕早就接到舉報，或許朕的性命將留在仁智宮。你們不知道的是楊文幹會與太子暗中勾結，欺上瞞下私自運送鎧甲、武器給楊文幹，才使得他膽大包天，敢犯上作亂。”
衆人膛目結舌地看着李淵，紛紛瞪大着眼睛，只見李淵面無表情地大喝一聲：“來人，將太子壓上來！”
太子李建成在衆目睽睽之下，被兩旁的士兵捆綁着押進了紫宸殿，他面無表情的大步向前，不顧朝中文武大臣驚訝的目光，他望着怒氣衝衝的父皇，恭敬地高呼道：“不孝之子李建成，參見吾皇萬歲萬歲萬萬歲！”
太子李建成自稱不孝之子，衆人方知李淵所言非虛；朝中大臣中有一部分效忠於太子李建成，他們紛紛低下頭，滿臉的無奈與焦急。然而，秦王李世民依舊風輕雲淡地看着被押進來的李建成；齊王李元吉心急如焚的看着大哥，他迫切地想要將自己的大哥救回來；李逍遙、李玄霸兩人屹然不動的看着一切，惋惜的望了一眼李建成。
“朕念你初犯，又爲大唐立下赫赫戰功，傳朕旨意：李建成身爲大唐太子縱容麾下將領，以致鑄成大錯，私藏軍械、犯上作亂；但念起功勳，免除死罪，活罪難逃，廢黜建成太子之位，即可搬離東宮，貶爲蜀王，攜帶家眷不日前往蜀地，靜思己過。”
李建成見唐高祖李淵心意已決，無法挽回，他只能接受，黯然神傷地說道：“兒臣謝主隆恩！”
“且慢！”
衆人見李建成都放棄抵抗，秦王李世民嘴角微微上揚，他的目的達到了，然而一切塵埃落定之時，一道高亢的聲音響徹大殿，衆人聞聲望去，只見齊王李元吉心急如焚地大喝道：“啓稟皇上，兒臣元吉有話要說。”
唐高祖李淵見李元吉當衆駁斥自己的旨意，他強壓心中的怒火，低沉地說道：“說！”
李元吉心知自己剛纔所言，有些莽撞，不顧自己父皇的顏面，直接阻止李淵的旨意。但是，李元吉寧願自己受到李淵的責罰，也不願意看見自己的大哥被流放在外，尤其是蜀地乃是貧瘠之地。若是真的貶往蜀地，那李建成想要再次回來，根本就渺無希望。
李元吉見李淵慍怒的身神色，目不轉睛地盯着自己，他心中泛起一陣寒意，事已至此，只能硬着頭皮高聲說道：“兒臣莽撞了，但是父皇剛纔所言大哥與楊文幹暗中勾結，私藏軍械，意圖不軌，兒臣在此可以用項上人頭擔保，大哥絕對不可能與楊文幹暗中勾結，大哥對此事也是一無所知。再說了，兒臣當日也是在場，大哥命人護送鎧甲前往慶州，兒臣也知道，大哥絕對不可能放縱楊文幹肆意妄爲。”
“雖說楊文幹之前是大哥的宿衛，早已前往慶州，兩人之間根本就沒有任何的聯繫，就算有也是政務之上的交流，大哥絕對不會私下與他聯繫。欲加之罪何患無辭，兒臣相信大哥絕對不會有犯上作亂的意思，絕對不會有，懇請父皇明察秋毫，還大哥一個清白。”
李淵淡然地望着啼哭不止的李元吉，淡淡地笑道：“依你的意思，是朕錯了，是不是？”
李元吉見父皇強壓着心中的憤怒，目光灼灼的盯着自己，他感覺全身猶如墜入冰窖一樣寒冷，支支吾吾道：“兒臣不敢！”
“你不敢？”唐高祖李淵冷笑一聲，道：“看樣子是朕太寵愛你們這些親王了，以致連朕都不放在眼裡。”
衆人見李元吉的大聲反駁皇上，使得李淵更加的憤怒，他們都知道李淵動了真怒，沒想到李元吉好心辦壞事，使得唐高祖李淵更加的憤怒無比。衆人全部都顫顫驚驚的望着怒氣衝衝的李淵，秦王李世民則是風輕雲淡的看着自己的父皇，他沒想到自己的計劃，居然收穫到意想不到的結果，看到這種情形，李世民肯定的認爲李淵不僅僅廢除李建成的太子之位，就連李元吉都要受到嚴懲。
秦王李世民暗中竊喜不已，就在他竊喜之時，屹然不動的李逍遙終於出面了，他微微向前一步，躬身喊道：“父皇乃是天子，大唐還需要父皇指點江山，還請父皇保重龍體。”唐高祖李淵見李逍遙出面，他微微一愣，又見李逍遙讓自己保重身體，李淵知道李逍遙讓自己不要大動肝火，他心中的怒氣消散了不少，和藹的看着李逍遙，只見李逍遙沉聲道：“父皇，兒臣有事啓奏。”
李淵愣了半晌，微笑道：“准奏！”
衆人見李淵和藹可親的望着李逍遙，就知道李淵對李逍遙的態度與李元吉、李建成實在是相差太遠。之前還是怒氣衝衝的模樣，轉眼間變得和藹可親，差距實在是太大了。只見李逍遙恭敬的說道：“兒臣自仁智宮隨父皇一起回到京師，一路上都在思索大哥這個件事，兒臣也覺得事有蹊蹺，懇請父皇將事情查的一清二楚後，再做定奪。”
李淵見李逍遙也說事有蹊蹺，不想表面上那樣，實際上他也是有苦難言，一方面想要留住太子的清白，另外一方面他想借這個機會將李建成的太子之位除去，到時候秦王李世民、李逍遙都有機會成爲太子。身爲父親的李淵知道李建成的性子，他也相信以李建成的脾性不可能真的暗中與楊文幹籌劃，想要謀反，實在是楊文幹一無是處，根本就不堪大用，李建成就算是再笨，他也知道事情的嚴重性。
縱然想要謀反，李建成也絕不會選擇與楊文幹勾結在一起，只不過欺上瞞下護送鎧甲卻是真實存在的。只不過李淵自己也沒有想到李逍遙身爲皇位競爭者，居然會爲太子李建成說話，而秦王李世民從一開始就一直冷眼旁觀，李淵就心中有數了，只不過礙於情面以及大唐的未來着想，他不得不廢除李建成的太子之位，他心中甚是欣慰，李逍遙的出面證明他不是無情無義之人，心胸寬廣，是一位很好的繼承者，但是事已至此不得不繼續下去。
李淵詫異地說道：“既然逍遙王覺得事有蹊蹺，不知有何憑據？”
衆人見李逍遙出聲爲太子李建成說話，又聽見李淵反問李逍遙，紛紛都瞪大着眼睛準備看好戲。然而，李逍遙在衆目睽睽之下，風輕雲淡地笑了笑，擲地有聲地回道：“回稟父皇，兒臣早前就命人着手調查，發現的確事有蹊蹺，還請父皇過目！”
李淵見李逍遙寵辱不驚地從袖口中取出一道奏章，他急忙命令身邊的太監呈交上來，李淵攤開李逍遙所奏的事情，上面密密麻麻的全部都是他調查出來的結果。李淵越看心中越是憤怒不已，深深地在朝中大臣身上流轉，就連秦王李世民也不例外，衆人心驚膽戰的看着憤怒無比的李淵，又見他頃刻間將所有的憤怒隱藏起來，彷彿什麼事都沒有發生一樣，他讚賞地點點頭道：“逍遙王所奏之事，朕準了！但是建成的太子之位已然廢黜，金口玉言無法收回，依然是蜀王，只不過不用前往蜀地，而是留在京師。”
衆人疑惑不解的看了一眼，他們根本就不知道李淵與李逍遙兩人到底買什麼關子；秦王李世民想要出聲詢問，卻被唐高祖李淵狠戾的眼神瞪了回去，然後又聽見唐高祖李淵沉聲道：“建成之事，暫且揭過，待朕查明真相再做定奪，但是太子府上的王硅、韋挺兩人，你們身爲建成的近臣，明知建成有錯卻不及時制止，以致鑄成大錯，你們二人可知罪？”
王硅、韋挺兩人懵懂不知，轉念一想，他們知道是李淵想要有一個臺階下來，好讓李建成留在京師，只有將他們兩人代替李建成受罰，才能揭過李建成所犯之罪，最重要的是他們兩人是太子府上權力最大的官員，只有這樣才能真正的將一切事情都化解開來。
他們兩人明知是李淵欲加之罪，卻不願辯護，只能接受，沉聲道：“臣知罪，請皇上責罰！”
唐高祖李淵讚賞的點點頭，他們兩人不愧是呆在李建成身邊的老人，居然一語擊中要害，而且也證明他們兩人的忠心耿耿。李淵沉聲道：“念你們二人對大唐立下的功勞，死罪可免，活罪難逃，朕命你們前往邊關爲官，沒有朕的命令，不得入京！”
王硅、韋挺兩人異口同聲道：“謝皇上不殺之恩！”
朝中大臣皆是膛目結舌地看着王硅、韋挺兩人，就連李建成都驚詫萬分，他不知道王硅、韋挺被自己的父皇流放。但是，他們兩人自己知道原因。如果李建成遠離京師，想要東山再起，那根本就不可能，只有留在京師之中，纔可有機會翻身，他們兩人與李淵唱雙簧，將所有的罪責全部擔下來，這樣李淵纔有藉口免除李建成的流放之刑。
李淵見王硅、韋挺兩人毫不猶豫地承擔起所有的罪責，他心中甚是寬慰，接着他的目光又看向了秦王府的杜淹，對於杜淹李淵絲毫不客氣，猛地大喝一聲：“杜淹，你可知自己的罪過？”
杜淹根本就不知道自己所犯何罪，他毫不退縮地昂起頭，恭敬地回道：“臣不知！”
“既然你不知自己所犯何罪，朕就讓你知道你自己的罪行！”唐高祖李淵命人將李逍遙所奏之事，折成一部分交予杜淹看了一遍。霎時間，杜淹整個人都愣住了，他沒有想到自己所做的事情居然被李逍遙調查的一清二楚，李淵見杜淹目瞪口呆的模樣，心知他知道了，再次出聲問道：“你可知罪！”
“臣知罪！”杜淹萎靡不振，兩眼無神的呆滯回道。
“知罪就好！”唐高祖李淵大喝一聲，道：“汝身爲秦王府的幕僚，又是文學館學士，寒窗苦讀這麼多年，聖賢之道都被你遺忘了嗎？你居然沒有絲毫的阻攔，反而推波助瀾，其心可誅。朕念你年事已高，且爲大唐立下不少功績，死罪可免，活罪難逃，逐出京師，發回原籍，永世不得入京！”
杜淹聽到唐高祖李淵對自己的懲罰，他心急如焚地看向了李世民，卻見他給自己使了一個眼神。頓時，杜淹就明白了李世民的意思，他無奈地暗歎一聲，然後恭敬地回道：“謝皇上不殺之恩！”
隨着李淵突如其來的旨意，朝中大臣根本就不知道到底發生什麼事情，唯有當事人知道事情的真相。秦王李世民也在顫顫驚驚的，他看見杜淹的責罰比王硅、韋挺的要嚴厲許多。雖然同是流放，但是李淵對待王硅、韋挺留有餘地，對於杜淹直接斷了他的前程，李世民擔心李淵知道這一切的黑手是自己暗中佈局的，沒想到朝會結束後，李淵將李世民單獨留了下來。
秦王李世民心中更是擔心不已，他顫顫驚驚的來到了李淵面前。頓時，李淵直接拿起手中的奏章丟在李世民的臉上，怒氣衝衝的大喝一聲道：“你這個逆子，居然真的能夠狠下心，你看看上面寫的到底是什麼？”
秦王李世民強忍着臉上的疼痛，將奏章撿了起來，越看心中越是驚訝，上面詳細地記載着他李世民在廢除太子的這件事的種種事情，就連杜淹與他暗中使計唆使寧州刺史前去玉華山仁智宮舉報等事情，還有他將那些人全部斬殺等等全部一一記錄在案，使得黑暗中的一面全部都暴露在李淵的面前，無處躲藏，也無法爭辯。
李淵大罵道：“朕在朝堂上沒有將此事公佈出來，就是給你留了顏面。若不是逍遙的功勞，朕到現在一直都會矇在鼓裡，你這個逆子，居然栽贓陷害自己的兄長。朕給了你們公平競爭的機會，不是讓你爲達目的不擇手段，殘害自己的手足。這件事，朕不打算再追究，要是再有下次，休怪朕不念父子之情；你就給朕安心的在府中閉門思過，沒有朕的旨意，任何人都不允許接見。若是發現有人前去秦王府，或者你與他人還有聯繫，到時候一併清算，給朕滾出去！”
李世民忐忑不安地回道：“兒臣告退！”
“慢着！”李淵見李世民離去，他猛地出聲制止，嚇得李世民整個人都傻了，他以爲李淵改變主意了，想要將自己治罪。沒想到，李淵猛地大喝一聲：“將這個也帶走，朕不想對着它！”
李世民匆忙的將奏章整理出來，快速地離開了此地，他在朝堂上就發現李淵看自己的目光與之前的大不相同，彷彿心中的怒火一直壓抑着。如今，他被李淵劈頭蓋臉的責罵一番。如果不是李淵不願意將此事再次腦大，人盡皆知的話，那他皇家的顏面何在，只能強壓心中的怒火，使得李世民逃過一劫。
李世民暗中佈局陷害李建成的事情，東窗事發被李逍遙知曉，而且上奏給李淵，他將一切的過錯全部歸於李逍遙的身上。若是沒有李逍遙橫插一腳，李建成必定會被遣送出京，送往蜀地成爲蜀王，到時候他的計劃就會圓滿成功，沒想到到頭來一場空，功虧一簣，使得他自己賠了夫人又折兵。
李世民陰冷的笑了笑，暗暗地發誓道：“逍遙，本王與你勢不兩立，你給我等着，本王必定會捲土重來！”
於是，楊文幹事件牽扯出來的事情就這麼結束了，而李世民東窗事發後直接被李淵下了禁足令，沒有他的聖旨，不得出府半步，就連他麾下的將領全部都不允許踏入秦王府半步，違令者殺無赦，使得李世民只能留在府中，不敢再與外界之人取得聯繫，只能在府中修生養性。