洪憲垮臺，護國成功，梁啓超和蔡鍔這師生二人成爲當時衆望所歸之人。
黎元洪極渴望能獲得護國軍方面更多的支持。有人向黎建議，禮聘梁啓超爲總統府秘書長，這正和黎元洪意。
七月一日黎元洪致電梁啓超：“屢承來訓，慮遠思深，謀國之心，家居彌篤。泰山北斗，景仰爲勞。亦每知讀禮之時，不敢以閣員相浼，然萬端待理，棼如亂絲，辱以庸才，丁茲危局，設使舊鼎覆餗，淪胥以滅，既負人民望治之心，亦違先生救時之願，竊不自揣，欲以本府秘書長相屈，既無嫌乎奪情，且可資乎論道。先生模楷人倫，萬流仰鏡，倘肯垂念邦國，當不忍金玉爾音。敢布寸心，擁彗俟命。”
梁啓超是何等聰明之人。又何嘗不知道這是吃力不討好的差事，所以婉言謝辭。
黎元洪自是不肯放棄，隨後多次致書遣人邀樑入京，“贊襄一切”，並命公府收支處自七月份起月贈津貼二千元。
其中有一致樑函寫道：“自違塵教，裘葛載更。嶺樹江雲，迢迢千里，雖鱗鴻多便，郵電常通，而仰企之懷，未足罄其萬一也。徐君佛蘇到京，詢悉素履安和，旅祺清適，欣慰不可言喻。國家多故，禍變相尋，賴執事奔走提倡之功，與夫調護斡旋之力，幸得由剝而復，轉危爲安。元洪不才，亦獲隨諸君子後，共荷鉅艱，凡百措施，均資指導，嘉猷偉略，薄海同欽，此固民國無疆之休，非僅私幸已也！
“現在國會將開，人心粗定，而茫茫前途，來日大難，一切建設問題，非得宏才卓識如執事者，從容坐論，隨事諮商，長夜冥行，其何能淑？前曾奉上一電，敬迓高軒，適執事儼然在憂服之中，哀毀已甚，未便固請，然引佇足音，寸陰若歲，自夏徂秋，虛席以待者，亦既三閱月矣！屈指讀禮之期，行滿百日，爲國奪情，萬民所望，睹此危局，寧忍恝然。伏乞臺從北來，剋日命駕，慰我飢渴，示我周行，九頓以請，幸毋遐棄，鑑此微忱。”
足見黎元洪是心誠至極、求賢若渴；但梁啓超還是不爲所動。
民國五年雙十節，黎元洪以共和重建爲名，發表了一大批授勳令。
首授孫中山大勳位；蔡鍔、唐繼堯、陸榮廷、梁啓超、黃興、岑春煊六人以勳一位；段祺瑞、王士珍、馮國璋三人以一等大綬寶光嘉禾章。
勳章頒贈得很多，可謂陽光普照。既有西南護國起義的諸多將領，又有北洋派所有擁有兵權者，甚至遜清皇室之世續、載濤、紹英等也都榜上有名。有魚龍混雜和勳章如雨之嫌，但是，中山先生和護國元勳獲得高勳位，畢竟意義重大。
段祺瑞的國務院關於上層和地方的人事安排，也陸續出臺：
六月十三日令徐樹錚爲國務院秘書長，令王式通爲國務院參議。
三十日政.府人事大改組，批准原外交總長、交通總長曹汝霖，內務總長王揖唐、海軍總長劉冠雄、司法總長、農商總長章宗祥、教育總長張國淦辭職。
同時任命唐紹儀爲外交總長、許世英爲內務總長、陳錦.濤爲財政總長、程璧光爲海軍總長、張耀曾爲司法總長、孫洪伊爲教育總長、張國淦爲農商總長、汪大燮爲交通總長、段祺瑞自兼陸軍總長。
唐紹儀未到任以前陳錦.濤暫兼外交總長，張耀曾未到任前，以張國淦兼司法總長。
七月十二日再局部改組，以孫洪伊爲內務總長、範源濂爲教育總長、許世英爲交通總長。八月一日改派谷鍾秀爲農商總長，張國淦任總統府秘書長。
七月六日，決定對於各省軍政首長的名稱加以修改，在官制未定以前，各省督理軍務長官改稱督軍，民政長官改稱省長。
陸續任命張作霖爲奉天督軍，孟恩遠吉林督軍，張懷芝山東督軍，趙倜河南督軍，閻錫山山西督軍，馮國璋江蘇督軍，張勳安徽督軍，李純江西督軍，李厚基福建督軍，呂公望浙江督軍，王佔元湖北督軍，陳宦湖南督軍，陳樹藩陝西督軍，蔡鍔四川督軍，陸榮廷廣東督軍，陳炳焜廣西督軍，唐繼堯雲南督軍，劉顯世貴州督軍。
朱家寶爲直隸省長，郭宗熙吉林省長，畢桂芳黑龍江省長，田文烈河南省長，沈銘昌山西省長，齊耀琳江蘇省長，倪嗣沖安徽省長，戚揚江西省長，範守佑湖北省長，張廣建甘肅省長，楊增新新疆省長，朱慶瀾廣東省長，羅佩金廣西省長，任可澄雲南省長，戴戡貴州省長，胡瑞霖署福建省長，孫發緒署山東省長，張作霖兼署奉天省長，呂公望兼署浙江省長，陳宦兼署湖南省長，陳樹藩兼署陝西省長，蔡鍔兼署四川省長。
朱家寶兼署直隸督軍，畢桂芳兼署黑龍江督軍，張廣建兼署甘肅督軍，楊增新兼署新疆督軍。
湖南督軍陳宦未到任前以陸榮廷暫署，廣東督軍陸榮廷未到任前以龍濟光暫署。令湯薌銘爲廣東查辦使，李烈鈞爲陸軍中將加上將銜。
上層和各省軍政首長名單，是煞費若心的。一方面要促進南北統一，兼顧方方面面，特別是北洋系和護國軍方面。另一方面也面對實際。
這次人事安排，無論帝制與反袁派，在位和不在位的，都給予一定的位置，在安排上算是盡了最大努力。
這應該是總統府與國務院方面協商和妥協的結果。
從黎元洪方面要傾向護國軍一些，而段祺瑞則要努力鞏固北洋勢力。但是，肯定地說，主導意見是來自段祺瑞。
新政.府本意想在各省實現軍民分治，所以只有少數省份是以督軍而兼署省長的，署是臨時性質。
四川、湖南、廣東、廣西這四個省人事是老大難。新政.府不管動機如何，如此安排不但不能平衡各方面矛盾，簡直是播下了戰爭種子，成了製造了紛亂的根源，尤其是對湖南。
爲什麼不維持湯薌銘的湖南督軍而改派使他爲廣東查辦呢？原來就在發表各省督軍名單的前兩天，湖南出了事。
湖南宣佈護國獨立時，北洋軍第六師在湘西，安武軍倪毓棻部在嶽州。湯薌銘能指揮的，只有北洋軍一個混成旅。由旅長車震率領，駐紮在長沙附近。
這時候，廣西軍已有一部分到達衡陽和寶慶。陸榮廷以護國軍湘、粵、桂聯軍總司令身份，於六月初由廣東開到湖南，進駐衡州。
在湖南內部，趙恆惕等已組成了湘軍兩師，湘西一部分民軍也開到長沙附近成立了一個師。這是個劍拔弩張的局面，北洋軍與護國軍無法和平相處，隨時可能發生衝突。
湯薌銘的處境和陳宦在成都差不多，既不能指揮駐紮在湘西、湘北的北洋軍，又不能指揮湖南的民軍和桂、粵的客軍。
最糟的是湖南人恨透了這個殺人如麻的湯屠戶，各路民軍要圍攻長沙，以及國民黨人要用手槍和炸.彈對付湯的風聲傳遍了長沙城。七月四日深夜，湯薌銘在惶惶不可終日中離開了長沙。
湯薌銘走後，湘軍已成立了三個師，師長是陳復初、趙恆惕、陳忠洵。曾繼梧以湘軍第一軍長暫代湖南都督，龍璋暫代湖南民政長。隨後程潛以湖南護國軍總司令名義由雲南到了湖南，他的部隊改爲湘軍第四師。
湯薌銘的離去，並未減輕湖南的矛盾和衝突，而七月六日北京政.府又發表陳宦爲湖南督軍兼署省長，陳宦未到任前，派陸榮廷署理督軍和省長，這個命令使湖南更加複雜了。
在段祺瑞看來，無論袁世凱有千錯萬錯，陳宦都不應該做出與袁絕交的事，太不夠意思了。天下人都可這樣做，唯有你陳宦不行。或許段祺瑞對陳宦原來就沒有好印象，現在則惡劣至極。那麼段又爲什麼同意派陳爲湖南督軍兼署省長呢？這是由於黎元洪堅決主張必須給陳一個督軍職務。
當湯薌銘逃離湖南後，段打算迅速派遣一支北洋軍進駐湖南，又苦於無兵可調。恰好這時陳宦由四川撤出時，手上還有兩旅兵力，派他就近入湘，既可敷衍黎，也算是給陳一個落腳之地。
這道命令立刻引起了湖南人民的激烈反對。湖南人好容易趕走了一個北洋軍閥，怎能接受再來一個北洋軍閥。爲抵制北京政.府的任命，湖南各界推舉年已七旬的劉人熙爲湖南都督。爲什麼推劉呢？因爲劉人熙以前做過廣西藩臺，與桂軍陸榮廷頗有淵源，想通過劉的關係取得桂軍協助抗拒北洋軍。
陸榮廷支持湖南人民這個行動，因爲桂軍也不希望北洋軍大舉進駐湖南。北洋軍入湘不但遭到湖南人民和滇軍、桂軍的抵制，其他黨派人士如熊希齡、範源濂等也很反感，這些人很希望調蔡鍔回到湖南，國民黨人士則希望以由美返國的黃興來擔任湘督。可是蔡、黃兩人均無意於此職。黃興推薦譚延闓，譚在各方都有很好的人緣，只不過和北洋系的關係不夠深。
這時候的陳宦可謂是四面楚歌。世界上的事有時是很不公平，竊國大盜袁世凱幹了那麼大的壞事，還能風風光光地的下葬，但陳宦這個上了袁世凱賊船的人，卻不能被反袁派們所諒解。而袁系的人又因他的背叛而不待見他。
識時務的陳宦知道自己不合適幹到湖南任職，主動表示辭去湘督。而段祺瑞也清楚，如果硬性派北洋軍人入湘，必會引起戰爭。因此他於七月十六日改派劉人熙爲湖南督軍，並下令把第六師由湘西調回江西，第七師由四川調往洛陽，第三師也由四川調回嶽州。
段祺瑞本來預定的計劃是派第三師師長曹錕繼陳宦以後的湖南督軍，可是，段自己覺得他在北京的基礎尚未穩定，必須有一個可靠的北洋大將在自己身邊，以加強自己的地位，因此選中了曹錕。曹一直給人印象是“老實人”，所以段調曹爲直系督軍，同時把七月間開回嶽州的第三師分批調回北方。
這並不等於段完全放棄湖南，因爲他又安了一個棋子在湖南，即派他的內親吳光新率領北軍第三旅接防嶽州。這當然是埋伏吳做爲將來湘督的打算。正所謂天下事如要人莫知，除非已莫爲。段內定吳爲湘督的消息，立刻傳遍了湖南，當然又引起湖南全省激烈的反對，甚至公開宣稱爲了抗阻北洋軍，不惜一戰。
段祺瑞總算領教了湖南的強硬，大概也知道了即便是他這樣的大權在握，也不能爲所欲爲。於是在八月三日下令改派譚延闓爲湖南省長兼署督軍。
譚延闓是反袁的，他在湖南很得人望。癸丑二次革命失敗後，他承當一切湖南的責任。袁世凱調他和趙恆惕赴京，趙被囚，他亦形同軟禁，有這段經過，更使他在湖南受人愛戴。