孫策部隊撤出餘汗城後，劉曄迅速派中郎將董襲帶領一萬招募步兵和五千初級步兵接管城池，騎兵和剩餘人員在餘水東岸紮營，作爲後援、接應。
秦關駐守在贛水西岸，與南昌城隔河相望，爲了長期圍困孫策，便就地修築一城池，命名爲新建城。
中郎將紀靈作爲南路的指揮官，駐守新淦縣，何曼佔領艾縣後迅速南下，駐守臨汝城，暫歸紀靈管轄。
廖化駐柴桑作爲接應，並保證西路和南路的物資補給。
秦關忙於建城，劉曄也在餘水河和昌水河之間規劃了幾座縣城，正在積極招募東部山區內的山越人；兩人知道，他們的主要敵人是董卓，沒有必要與孫策硬拼，所以沒有發起主動攻擊。
這讓孫策非常鬱悶，他本希望秦關來攻城，他可以憑藉南昌堅城給予敵人殺戮，待重創敵軍後好趁勢反擊；現在敵軍反倒據城而守了。
幸好城內存糧很多，足夠消耗一年的，衆人皆不擔心，只是官兵們看不到希望，士氣有些低迷，且那些被強制遷入城的百姓，每日分發的糧食不足果腹，民憤很大。
時間過的很快，三月很快過去；進入四月，豫章郡的天氣便非常炎熱了。
這邊的對峙，董卓最是高興，不管秦關和孫策誰贏了，他都是最大的贏家；最好是兩家勢均力敵，打個兩敗俱傷，他好坐收漁利。
孫策自恃武藝高強，城內安全，經常獨身在城內或者城牆上巡邏，並藉機思考問題，卻不知道危險正向他逼近。
原豫章郡太守許貢被孫策擊殺後，其門客四散而逃，大都躲在鄉下，卻時刻準備着爲許貢報仇；這次孫策遷移百姓，便有多人隱藏在百姓中，被一起遷移到城內，其中三人還有幸被徵召入伍，成爲孫策的官兵，協助守衛城池。
這三門客都是遊俠出身，素質較好，經過訓練、選拔，成爲弓弩手，這他們成功刺殺孫策提供了契機。
孫策給士兵的待遇較好，至少能吃飽，士兵對他也都很忠心，沒有懷疑到有人會暗殺他，感覺城內非常安全。
四月中旬，孫策依然經常上城牆巡邏，許貢三門口摸清了規律，並做好了準備，等待最佳的刺殺時機。
一天傍晚時分，許貢三門客在城牆值守；孫策又來巡邏，護衛遠遠的跟在他身後，怕打擾了孫策的思考。
三門客突然暴起，挽弓搭箭便射，孫策邊走便低頭思考，突然感覺有危險，擡頭觀察；事發突然，孫策在倉猝間，不及躲避，“啊”的一聲大喊，面頰中箭。
許貢三門客繼續射箭，必取孫策性命。
這時，後面的扈從聽到孫策呼喊，快速向前，將三個人亂箭射殺，救下受傷的孫策。
孫策身中多箭，面頰中箭頗重，身上其它部位因鎧甲的保護，未成致命傷害。
不過在那個年代，在炎熱的南昌，身受如此嚴重的外傷，神仙難醫。
當夜，孫策便渾身發燙，面部開始腫脹。
全力搶救，無果，五日後孫策在痛苦中死去。
臨死前，孫策安排了兩件事，第一，由弟弟孫權接管他的位置，第二，由黃蓋統領城內之人，迅速突圍，與孫權和朱治等人匯合，然後離開豫章郡，前往交州，此後要遠離中原，不再回來。
衆人含淚應下。
黃蓋跟隨孫堅多年，又跟隨孫策幾年，對孫家忠心耿耿，即便到了當前山窮水盡的局面，依然沒有影響他的忠心。
孫策遺命，令黃蓋率領部隊突圍，這讓他非常爲難，孫策之猛，尚且沒有突圍，何況是他黃蓋了。
經過慎重考慮，黃蓋做出決定，令徐琨帶領衆人以及騎兵突圍，他率領步兵留守南昌城，爲衆人的突圍爭取時間。
徐琨思索一陣後反對道：“公覆，我們不能留下你而突圍，要走一起走。”
黃蓋怒道：“現在我是主帥，汝等必須聽從命令，且你們難道不希望主公早日入土爲安嗎？”
爲了穩定城內軍心，孫策死後，他們秘不發喪；黃蓋希望突圍，並與孫權等家族成員匯合後再安葬。
大家知道，此時誰留下都是死，步兵速度太慢，根本無法突圍。
黃蓋繼續說道：“早已打探好了消息，餘汗城和臨汝城皆無騎兵駐守，我們的騎兵可從城東南突圍，待他們騎兵部隊到來後，我們的騎兵已進入雩山之內了。”
雩山，後世叫于山，是豫章郡東部一座東北-西南走向的山脈，與武夷山平行；當時山內尚未開發，即便進入山內，能否安全到達廬陵或者贛縣尚未可知，衆人心中沒有底氣，不過總比在城內坐等要強。
從南昌城到雩山的北部，有二百多裡遠，步兵若是突圍，速度較慢，很容易被包圍；在野外被包圍，他們必敗無疑；周圍有秦關的近五萬兵馬，他們現在不足三萬人，騎兵不足萬人，絕非秦關對手。
步兵留守南昌，騎兵快速突圍，這是最好的策略。
徐琨建議道：“不若我們與秦關談判，我們主動撤離豫章郡，讓他放我們一馬。”
俞河大喜，支持道：“這個主意不錯，我們本與秦關沒有利益衝突，他定不會對我們大加殺戮，否則，當初也就不會放主公從富春離開的。”
黃蓋嘆了一口氣說道：“事易時移，事已異矣！當初主公身無一兵一卒，對秦關沒有任何威脅，所以他才任由主公離開；現在我們兵馬五萬，對他威脅很大，他絕不希望留下後患，豈能輕易放我們離開？”
俞河樂觀的說道：“公覆多慮了，據河看來，秦關此人野心勃勃，他最大的敵人應是國賊董卓，所以他們不願意強攻南昌城，就是爲了保存實力，並不過分暴露實力，引起董卓的猜疑；或許此後我們與秦關還有聯手對付國賊董卓的機會。”
徐琨支持道：“這倒是很有可能，秦關這人很虛僞，當初與笮融結盟，共同對付袁術，並一起討好朝廷，在打敗袁術後，卻順手將笮融除去，根本沒有在乎笮融纔是朝廷任命的新安郡太守，看來，他討好朝廷、討好董卓，都是表面現象，也是假的。”他心想，若是早注意到這點，早點勸孫策主動放棄豫章郡的話就不會有今日之禍了。
只是他不知道，孫策的計劃是逐漸撤退，拉長秦關的後勤補給線，節節抵抗，逐漸消耗秦關的實力，等給予重創後，他好反擊，趁勢佔領江東諸郡；當時即便想到這些問題，孫策雄心壯志，也不會採納他的建議的。
他們都不知道的是，秦關水運糧食非常便捷，一部分從廣陵郡和丹徒直接水運而來，一部分是魯肅暗中資助的；廬江郡與豫章郡一江之隔，便於水運，且魯肅現在糧食衆多。
黃蓋又道：“不妥，若是去談判，必會引起秦關的注意，萬一他爲此做出調整，此後再想突圍，難度就大了。”
徐琨道：“公覆，不試試怎麼知道？若是能保存下更多的官兵，則便於我們開拓在交州的事業，不負主公所託。”
黃蓋也不想死，他還想建功立業，若是談判成功，則有利於在交州的事業；思慮一陣，便同意了衆人的建議，派徐坤前去尋秦關談判。