義憤填膺的官軍，包圍了餘杭城，用步槍爲前陣，飛雷炮和手榴彈爲主要火力，向城中發動了密集的進攻，步槍子彈將叛軍打得擡不起頭來，飛雷炮轟擊得最爲猛烈，主要是步槍的遠程壓制，將叛軍完全打壓了，叛軍的炮兵雖然也不少，可是，基本上成爲步**殺的對象，死傷慘重，其炮兵根本沒有發揮出應有的作用。
突破首先在城北，那是正面進攻陣地，官兵將大炮推進到了城牆下，呼呼呼一個個的炸藥包騰空而起，砸到了城牆上，炸得磚石亂飛，硝煙四起。叛軍完全被炸懵了，四處逃竄，無法成軍。
餘杭的城門被炸開了，憤怒的官軍蜂擁而入，又是劈頭蓋腦的轟擊，將叛軍完全擊潰。
戰鬥迅速進展，叛軍土崩瓦解，不到半個時辰，城內的戰鬥就結束了。
“立刻抓到馬士英，爲馮將軍報仇！”
“抓到魯王，爲馮將軍報仇啊！”
官兵在餘杭城內，囂張地呼喊着，向着每一個可能隱藏敵人的街道和院落挺進，搜查，將大量的逃難隱藏的叛軍士兵揪了出來。
戰鬥結束了，張由鬆等人帶領`部隊到了城中，等待着結果，可惜，竟然沒有發現馬士英，逮捕的戰俘一審訊才知道，他在襲擊了皇帝的隊伍以後，根本就沒有回城，繞道逃脫了。
“這個狡猾的傢伙，”張由鬆只能嘆息一番。“那魯王在沒有？”
“皇上，也沒有見到魯王，據叛軍說，魯王其實沒有來，只是拿了旗幟來振奮軍心，他自己在杭州呢。”
非常遺憾地結束了戰鬥，張由鬆發現，其實，餘杭之戰的成果，還是非常巨大的。叛軍三萬餘人，只有少數逃脫，其餘被殲滅，被擊斃者千餘人，三萬人被俘獲，一大批戰略物資被繳獲，魯王在杭州城北面的最後一道防線被撕裂，杭州門戶洞開。
對於繳獲的物資，迅速充爲軍用，至於戰俘，則關押起來，進行鑑別，凡是普通的百姓的，都釋放了，而軍官，或者魯王招安的匪徒之了，都關押起來等候進一步處理，至於將領，更是關押審查，一絲不苟。
稍加整頓，張由鬆軍就向杭州挺進，絕對不想再給敵人一點兒機會，騎兵先行，因爲在城中殲滅了敵人的大量騎兵，使自己的部隊一下子增加了四百多名騎兵，大部隊火速前進，並且對先鋒部隊，偵察部隊等都做了嚴密的安排，惟恐遭到馬士英軍的襲擊搗亂，爲了保證逮捕馬士英和魯王，張由鬆和陳子龍，顧炎武等商量，派遣了一支騎兵，穿上戰俘們的衣服，僞裝成叛軍的模樣，攜帶足夠的武器，秘密出發，晝夜兼程，從西面迂迴，繞道杭州城的背後，而大隊的步兵則繼續前進。
一天時間，部隊趕到了杭州城下，合圍杭州，迅速突破，居然發現，杭州是一座空城！魯王和馬士英已經逃之夭夭了。
審訊了幾個看守城池的叛軍士兵，其實他們是官差，杭州府的，因爲魯王大軍戰敗，他們知道大勢已去，就聰明地留了下來。
“可能逃亡紹興府？追！立刻追趕，務必將叛亂諸賊統統緝拿歸案，一個不須放走|！”張由鬆喝道。他要親自帶領騎兵追擊敵人，被大家苦苦勸慰，於是，陳子龍帶領騎兵一千人，攜帶足夠的手榴彈，步槍和彈藥，東下了。
紹興城，傍晚的暮色稀疏但是寂寞，仲春時節，天氣已經相當溫暖，紹興府衙門裡，一大羣正慌作一團：“王爺，王爺？請進鄙衙休息一晚再說吧。”知府黃某人，和魯王有極爲深切的關係，這時候，明知道魯王敗勢已定，還是不肯拒絕，大開了城門，將其引到了衙前。
“哎，患難見人心啊。”魯王肥壯的豬臉上，滿是因爲劇烈運動帶來的油膩光芒，王爺的帽子，已經歪斜了。他想感謝，可是，嗓子眼兒裡幾裡古魯了一陣，居然是苦笑。
“王爺，何必生氣呢？想必連次戰鬥不順吧？沒關係，勝敗乃兵家常事嘛，以王爺的聰明才智，想要東山再起，不在話下。”黃知府深深一鞠躬，讓開了道路。
“哎，你呀你！患難見忠誠，”魯王再一次發出了感慨，卻聽到自己的肚子裡几几古古地發出了抗議之聲，再也忍耐不住。
惶惶如喪家之犬，帶着所有的家眷人等，匆匆忙忙進駐了紹興的知府衙門，草草吃了一點兒飯菜以後，魯王就召集了所有的隨從官員，商討大事兒。
“說吧，諸位大人，本王落魄如此，該往哪裡走向？”魯王說到這裡，忽然想哭。可是，又哭不出聲來，難受尷尬，只好咳嗽幾聲。
十幾名官員，有的是王府的親信隨從，有的是地方官員，有的是魯王招徠的所謂賢良人士，和現代的公知專家差不多調調兒。大家的臉色都很不好看，一個個失魂落魄。
“說啊，怎麼都不吭聲了？難道，本王的大米白麪，都餵了豬狗不成？”魯王惱羞成怒。
作爲王爺，他還算是很稱職的，既沒有給皇帝添加什麼麻煩，也沒有過多地擴張自己的皇莊，對待普通的地方官員，還能夠以禮相待，要不是馬士英和阮大鋮的煽動，要不是唐王和桂王的呼應，他很難出這個頭兒。當初，這幫人都爭先恐後地勸告自己，要抓住機遇，煽動自己起兵，現在，這些人居然都不吭聲了。
“王爺，要不，我們往東走？”他的王府大管家說：“繼續東走，反正，皇上的大軍實在厲害，我們不是敵手，只有逃了，往東再往東，一直到海邊。”
“海邊？到海邊幹嗎？”魯王還沒有說，其他人就質疑起來：“如果皇上派遣追兵，我們斷然無法求全，莫非，要下海不成？”
“這，嘿嘿，王爺，諸位先生，卑職就是這個意思！”
“嗯？”
“王爺，我等反了朝廷，已經大逆不道，皇上親自來討，自然不會善罷甘休，我等不趕緊逃脫，難道要等着找死不成？”王府大管家還是很有主見的。
黃知府道：“爲什麼要東去？下海？海上風波險惡，能夠支持幾天？難道，你真的要王爺去作海匪？”
“哼，黃大人，你什麼意思，說出來大家聽聽。”大管家也不是好惹的，平時，他就是王爺之下的頭號人物了，這些天的魯王舉旗，更多的將領官員圍繞這他轉悠，讓他脾氣見長。
黃知府雖然迎接了魯王，心裡卻極爲不願，更不想追隨他們放棄一切到海上喝風，“既然我軍單獨力戰不勝，可南下福建，請唐王和桂王諸位北伐啊。總不能讓魯王爺出如此死力，他們坐在後面看笑話，魯王爺要是南下，他們不會不厚待的，無論如何，總比東逃入海強！”
強不強誰知道，每一個人的心裡都有一本帳，東逃海上，是絕路，總不能一直在海上漂浮吧？最後到哪裡？南下？人家唐王和桂王能夠厚待？去！還不趁機把你滅了就不錯了。
“本王不能東下，也不能南下。”魯王思考了半天，果斷說道：“那都是絕路啊。”說到這裡，他忍不住熱淚盈眶：“本王想不到，皇上如此厲害，北掃滿清靼子，南下又一路勢如破竹，早知如此，就該把馬士英和阮大鋮那兩方面個奸賊捆綁起來，送皇上治罪！”
王府的大管家道：“王爺別說這個，後悔藥是沒有的，王爺，東下不是絕路啊，要麼，坐船轉道福建，要麼，我們揚帆出海，東逃倭國，暫時躲避風頭，或者，就趁着亂世，在沿海一帶待着，憑着王府的數百精銳，其他大人的親信隨從，還真沒有誰敢動咱一根汗毛！”
黃知府則大搖其頭：“管家大人，海上風波險惡啊。”
正在大家陰沉着臉兒，不知所措的時候，一個面目清瘦的人站了起來，好幾個人都不認識他，還以爲他要更衣呢。
“王爺，臣張煌言有奏，臣願意西回杭州，代表王爺向皇上納款投降，以爭取皇上的寬宏大量，王爺，煌言以爲，現今皇上，聰明才智，仁慈友愛，乃是少見的仁君明君，若是我王能夠坦然認罪，則皇上一定會心念慈祥，放王爺一馬的！”