8月下旬，葉飛由北戴河回到廈門前線。此時大、小金門蔣佔島嶼，包括金門唯一的港口料羅灣和海面，全部在我炮火射程之內，完全被我炮火封鎖，金門和臺灣的海上通道截斷了。爲了補給金門，臺灣從海上運輸，以海軍護航，我軍炮火即轉向攻擊其海上運輸線，專門打它的海上運輸船隻。蔣軍艦隻受到嚴重打擊，不斷被我海岸炮火擊沉擊傷，最後，金門海上運輸線完全被我截斷了。金門不但彈藥補給中斷了，糧食、燃料的補給也中斷了，儲備的炮彈也在半個月炮戰中消耗得差不多。儲備糧只有一個月，也消耗差不多了，於是頻頻向臺灣告急。蔣介石即請求美軍護航。以恢復金門的海上補給線。
9月7日，美蔣組成一支海上大編隊。美艦配置在海上編隊左、右兩側護航，把蔣軍艦隻運輸船隻夾在中間，美艦和蔣軍艦隻相距僅2海里，由臺灣向金門開來。美蔣聯合編隊從臺灣一出動，我軍在雷達上就看得一清二楚。情況複雜化了，美軍已經卷入，怎麼辦？打不打？如果一打，勢必會把美艦一起帶上，這就可能把美國拖下水，同美軍發生直接衝突。所以，打不打美蔣海軍聯合編隊，事關重大，不是一個單純的軍事行動，這不是前線指揮員有權可以作出決定的，只能由中央、最高統帥才能作出決定的，葉飛立即請示。
回答：“照打不誤。葉飛又請示：是不是連美艦一起打？回答：只打蔣艦，不打美艦。並且交代要等美蔣聯合編隊抵達金門料羅灣口才打，要葉飛每一小時報告一次美蔣聯合編隊的位置、編隊隊形、航行情況，到達金門料羅灣時，要等北京的命令才能開火。
葉飛爲了準確執行只打蔣艦、不打美艦的命令又請示：我們不打美艦，但如果美艦向我開火，我們是否還擊？明確回答：沒有命令不準還擊。
命令是由總參作戰部長王尚榮以直達軍用專線電話向葉飛轉達的。葉飛接到這個電話，極爲吃驚，恐怕電話傳達命令不準確，鑄成大錯，再問王尚榮：如果美艦向我開火，我是不是也不還擊？回答是命令不準還擊，清清楚楚。
這樣葉飛就說：明白了，我嚴格按照的命令執行。
這一下葉飛就極爲緊張了，因爲要嚴格執行的命令，只打蔣艦，不準打美艦，這很不好辦。美艦和蔣艦相距僅2海里，如果哪一個炮羣瞄不準確，稍有誤差，就會打到美艦。至於如美艦向我開炮，我不予還擊，這倒還比較好辦。
葉飛爲了準確執行的命令，就親自向31軍及各炮兵羣下達命令：待美蔣聯合編隊抵達金門料羅灣港口，北京下了命令後纔開炮；各炮羣只打蔣艦，不準打美艦；如美艦向我開火，我不予還擊！各炮羣接到葉飛這個命令，都吃驚了，紛紛追問。葉飛又把命令再複述一次，並問炮羣是否都聽清楚了，明白了？各炮羣回答聽清楚了，明白了，按的命令嚴格執行。
9月7日中午12時正，美蔣海軍聯合編隊抵達金門料羅灣港口，運輸船隻開始在料羅灣港口碼頭上卸下補給物資。情況直報北京，下令開火。全線所有炮羣接到命令，即以突然的密集火力攻擊蔣艦及其運輸船隻，集中攻擊料羅灣港口碼頭。沒想到我軍一開炮，美艦丟下蔣艦及運輸船隻不顧，立即掉頭向臺灣方向逃去。這時，金門蔣軍和在料羅灣的蔣艦紛紛向臺灣告急。臺灣問：“美國朋友？美艦呢？”蔣艦回答：“什麼朋友不朋友？美艦已經掉頭跑了！”他們大罵“美國人混蛋”，使用報話機通話，連密碼都不用，我軍的偵聽機聽得清清楚楚。蔣艦被我軍擊沉3艘、擊傷數艘。臺灣即下令蔣艦返航，這一場驚險的戰鬥就這樣戲劇性地宣告結束。