1953年上半年，秦基偉回國後，到各地做報告，《人民日報》連續報道，還配社論《慶祝上甘嶺前線我軍的偉大勝利》。那時的《人民日報》社論，權威的很，當天的社論，全國人民當天都得學習的。套用如今的流行語言來說，秦基偉的“‘粉絲’多得一*遭”，人氣之足，比“超女”還“超女”呢！
這不，連都要接見秦基偉了。1953年6月16日10時許，秦基偉來到中南海豐澤園菊香書屋。此時，還在裡屋，秦基偉就坐下來等待接見。
落座不久，從內房走出來。秦基偉立即起立，敬禮。微笑着握着秦基偉的手，說：“啊，秦基偉同志，歡迎你啊！”
秦基偉說：“主席，我代表十五軍的指戰員，向主席彙報來了。”
說：“好哇，請坐下來談。”說完，自己坐進沙發裡，把秦基偉拉到另一隻沙發裡。
接着說：“上甘嶺打得很好。上甘嶺戰役是個奇蹟，它證明中國人民志願軍的骨頭比美利堅合衆國的鋼鐵還要硬。這個奇蹟是你們創造的。”
一邊說一邊拿起茶几上的煙盒。
秦基偉說：“是主席和軍委指揮得好，戰士們打得頑強。”
點點頭，笑了笑，說：“你們打得好，我要有表示。我這裡沒什麼好東西，那就請你吸菸吧！”
秦基偉的手下意識地伸向煙盒。但秦基偉沒有拿煙，而是將煙盒順勢向那邊稍稍推了推，“主席，我不會吸菸。”秦基偉破天荒說了一句謊言，而且是在主席面前說了謊言。事後，秦基偉說，“我覺得在面前吞雲吐霧不大合適。但是，說假話是要嘗苦頭的。當時，我一天沒有兩包煙解決不了問題，可是已經說過不抽了，再不敢翻案了。心裡暗暗叫苦啊！”
“哎呀呀，你這個當軍長的還不吸菸。不吸菸怎能坐指揮部啊，要是我，那可就是沒辦法囉。”說完，嗬嗬嗬地笑。
接着，開始問秦基偉是哪裡人，多少歲數了，志願軍官兵在前線的情況，等等。秦基偉都一一作了回答。
11時許，秦基偉起身告辭。將秦基偉送到門口，又說：“朝鮮戰爭是要停下來的，所以調你到雲南工作。雲南是我國西南大門，處於重要的戰略位置，邊防線長，還有殘匪在境外活動，鬥爭情況複雜。你年輕力壯，到任後要多下去，熟悉地形，瞭解部屬，把邊防建設好，把大門守好。”
秦基偉立正回答：“一定按主席要求去做，請主席放心。”
1953年7月，秦基偉到雲南軍區任副司令員。1955年4月，雲南軍區改稱昆明軍區，秦基偉改任昆明軍區副司令員。
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1955年9月，中國人民解放軍第一次授銜。軍隊有了10位元帥，10位大將，57位上將，177位中將和1359位少將。秦基偉被授予中將軍銜，成了“五五年的中將”。
同月，昆明軍區司令員謝富治調中央工作，秦基偉中將升任昆明軍區司令員。
秦基偉是177位中將中最早擔任大軍區司令員的。這是好事，也是壞事。好事是，當主官有了建大功立大業的平臺；壞事是，1966年那場席捲中國的史無前例的“文化大革命”，讓秦基偉成了大軍區一級的高級將領中最早下臺的人。
塞翁失馬，安知非福？1967年2月12日，周恩來派了一架飛機，把秦基偉接到北京，安排在京西賓館，沒了職務，也沒有任務。在周恩來的保護下，雖然秦基偉在“文化大革命”的第一個Lang頭下，成了沒有還手之力的“死老虎”，但在後來的“殘酷鬥爭，無情打擊”中卻躲掉了捱打、侮辱人身的事件發生。與不少老幹部受衝擊、折磨，甚至被整死的相比，秦基傳最早倒臺算是“因禍得福”！
1969年3月至8月，中蘇邊境接連爆發了幾起衝突事件，中央發出通知，在北京的中央黨政軍主要領導人及一些老同志，於10月20日以前全部戰備疏散。10月上旬，秦基偉帶着女兒畹江，“疏散”到了湖南省漢壽縣的一個軍墾農場。從此，秦基偉開始體力勞動。
1971年9月13日，乘“三叉戟”飛機出逃，斃命蒙古溫都爾漢。中國的形勢稍有變化。1972年3月，秦基偉被允許到長沙治療在農場落下的肩周炎。
1973年4月下旬，廣州軍區一位政治部副主任受中央軍委的委派，來到湖南某療養院，把秦基偉等人叫到會議室，傳達了軍委指示，宣佈秦基偉和李成芳、王蘊瑞等3人去北京，其他人去昆明。這位副主任傳達完後，又集合了療養院的工作人員和那些監督的人，宣佈：“從現在開始，你們不準喊老秦老李了，要喊首長，要服務好，務必做好保衛工作。”
幾天後，廣州軍區派車來接秦基偉、李成芳和王蘊瑞等3人，並組織他們到韶山參觀了故居，然後從長沙上火車。4月28日，秦基偉到達北京火車站，解放軍總政治部派人把他接到北京海運倉招待所。
4月29日，秦基偉接到通知，“五一”勞動節，黨和國家領導人陪同外賓遊園，要他參加。5月2日，秦基偉的名字見了報，老戰友知道秦基偉被解放了，紛紛前來看望。久別重逢，各歷其險，彼此之間都爲能活着相見而感慨萬千。
5月28日，中央在京西賓館召開一個工作會議，通知秦基偉和李成芳參加。在小組會上，周恩來說，國務院人手缺，部長亟需補充；問秦、李倆人願不願到國務院工作。李成芳說“願意服從分配”；秦基偉除了說“願意服從分配”外，加了一句“我的文化程度不高，到國家部門工作有困難”。周恩來笑了笑對秦基偉說：“你是文化人中的沒文化人，沒文化人中的文化人。”這個評價不低。當然，秦、李倆人的工作問題，周恩來沒有做最後決定。
7月初，秦基偉被任命爲成都軍區司令員。至此，秦基偉結束了靠邊流放生活。
1975年10月，在成都軍區當司令員兩年有餘的秦基偉，調北京軍區任第二政治委員。1980年1月，秦基偉改任北京軍區司令員。
1984年10月1日，爲隆重慶祝中華人民共和國成立三十五週年，人民解放軍在北京***廣場舉行了盛大的閱兵儀式。閱兵總指揮、北京軍區司令員秦基偉陪同中央軍委主席鄧小平，乘坐敞篷檢閱車檢閱了陸海空三軍部隊。
1987年11月，秦基偉由北京軍區司令員升任國防部部長，當選爲中央軍委委員。
1988年9月，中國人民解放軍恢復了軍銜制。9月14日，中央軍委舉行了恢復軍銜制後的第一次授上將儀式。中央軍委委員洪學智、***、秦基偉，中央軍委委員、總參謀長***，中央軍委委員、總政治部主任楊白冰，中央軍委委員、總後勤部部長起，副總參謀長徐信，中央軍委紀委書記、總政治部副主任郭林祥，中央軍委紀委第二書記尤太忠，軍事科學院政治委員王誠漢，國防大學校長張震、政治委員李德生，北京軍區政治委員劉振華，南京軍區司令員向守志，成都軍區政治委員萬海峰，海軍政治委員李耀文，空軍司令員王海等17位高級將領被授予上將軍銜。
秦基偉又成了“八八年的上將”。
1993年3月，秦基偉當選爲第八屆全國人民代表大會常務委員會副委員長。1997年2月2日１時58分，秦基偉因病醫治無效，在北京逝世，終年82歲。
一顆將星的沉睡，留給人們的是無盡的遐思。