八月下旬，朱由檢對大明朝廷進行了一次大規模的官員調整。
南京朝最重要的兩個部門就是戶部和兵部，這也是兩個最讓朱由檢比較放心的部門，因爲自從朱由檢南渡之後，對這兩個部門的人員安插一直都在進行。
一年之後，這兩個部門下屬的各司各衙門已經基本上都是朱由檢的人了。其中有一大半，都是朱由檢從京城帶着一起南下的那些忠誠度最高的京城官員。
兵和錢，永遠都要掌握在自己的手中方纔睡得着覺，這是當好一個管家首先要做的事。所以，陳子龍直接去了戶部，做了方岳貢手下的左侍郎；而史可法手上根本就沒有兵權，純粹就是朱由檢安插在兵部裡面一個補漏洞的。
黃道周升任禮部左侍郎，掌翰林院和國子監，另外負責文教事物，禮部下設的四個清吏司（儀制、祀祭、主客、精膳）等，也都換了人，原來的官員全部外調至兩廣，當了地方官，算是補了實缺。朱由檢這樣做，等於是把錢謙益架空了，實際上錢謙益當禮部尚書也沒多久，培植的黨羽還不算很多。
馬士英任吏部尚書，從進士科中選拔的人才充任各司各衙門，基本上算是穩定了吏部的正常運作。
呂大器調任雲貴川三省總督，姜曰廣任刑部尚書；工部在南京朝地位最低，高弘圖任工部尚書；朱聿鍵直接正式接管了宗人府。顧炎武帶着幾個人直接去了都察院，接受了整個都察院的工作，其中有四分之一的明法生被他帶了進去。
在這場人事調整中，最大的意外是黃宗羲接替了陳子龍的的位置，擔任通政使兼皇帝辦公室主任，掌管內外章疏敷奏封駁之事。正式進入了朱由檢隨身的幕僚團隊。並且和左懋第一起，組成了朱由檢身邊最重要的文武雙編。
袁繼鹹升任南直隸總督；張同敞任大理卿；張國維任都察院左都御史。
由此，南京六部等主要衙門經過一年的調整之後，算是配置齊全了。之所以沒有對朝製作更改，一是朱由檢沒有這個水平，二是大明的朝局還不穩定，還有大量的朱由檢摸不清底細的人充斥着整個朝野。
經過了一年的努力，朱由檢總算是鬆了一口氣，這大明朝局的攤子算是鋪開了。
錢謙益和劉宗周感到非常頭疼，因爲新的朝局也讓他們捉摸不定。從表面上看，新升上來的人都帶有東林或者是復社的背景，重要的是這些人都沒有明確的支持東林黨的心思。一個特別明顯的現象是，皇帝朱由檢正在拼命的培養自己的人手，比如陳子龍。短短兩年時間，就從一個普通的讀書人直接升到了戶部左侍郎的位置，這是準備接手戶部的節奏。
劉宗周心裡暗暗盤算了一遍，他發現現在的朝局有點像天啓朝，東林在朝中並非一家獨大，他們爲了擴張開始打壓異己，最終導致齊黨、楚黨的人投靠了閹黨，真正掌權的卻是魏忠賢。因爲魏忠賢掌管內外章疏敷奏封駁之事。
現在的朝局裡，東林雖然佔優，可是其他新勢力也控制了重要部門，而且劉宗周的那個掃地出門的弟子掌了管內外章疏敷奏封駁之事。
劉宗周後悔啊！早知道這小子會這麼有用，就不該把他掃出去的。控制了奏章，就等於控制了皇帝啊。想想魏忠賢，東林人會直接流口水。
“念臺兄，您再去找黃宗羲說說，畢竟是師徒一場。”錢謙益恨死這個豬隊友了，關鍵時候掉鏈子。
“我怎麼去？朱由檢現在直接接管了朝政，太子又沒有監國了。那個臭小子直接住到了將軍山，我還能見得着他?”
“那就先從太子哪下手，我就不信朱由檢不離開南京。”
“怎麼下手？太子那個監國也就是個樣子貨，根本就做不了主。”
“那也不一定。機會總是會有的，先把太子拉到我們這邊來再說。”
“我聽人說太子對史可法家的那個丫頭有點意思，太子今年已經十七了，該是選太子妃的時候了，要不......”
“此計甚好！就怕左憲之部同意。”
“無妨，左憲之歷來誰都不願意得罪。這本就是一件和和美美的好事，他怎會不樂意？”
......
一個月的第一天和最後一天，夜裡是最黑的，整整一個夜晚都沒有一點月光。
秋日裡總歸是有一些風的，夜裡的風不大，卻吹得樹梢一陣陣的響。有一些葉子被風一吹，大片的樹葉飄落，帶着一股喳喳的響聲。
朱由檢聽到外面似乎有人小聲說話，一場好夢就此被打斷，有些生氣的走到門口，想看一下是誰在門外。
“皇上已經睡下了，不能明天再說嘛？”這是朱由檢身邊小太監的聲音。
“這是好事，必須要告訴皇上。我也是高興，等不到天亮。”朱由檢一聽，知道這是畢向東的聲音。
“什麼事啊？”朱由檢打開了門，披上一件外衣。
“啓稟皇上，畢先生在外求見，說是有要事稟告。”小太監不敢隱瞞，只好回話。
“皇上，事成了。你要的東西做成了。”畢向東衝着院子裡就大喊大叫。
“哎喲我的畢先生，這兒可不能亂喊。”小太監趕緊要堵畢向東的嘴，這院子裡住的可是皇上和楊妃娘娘。
朱由檢一聽，連褲子都沒穿就跑到院子門口，一把抓住畢向東的胳膊緊張地問：“是不是那個成了？”
“嗯！是的。已經聯繫一個時辰了，沒有出毛病。”畢向東很激動，不停的點頭。
“快帶我去看看。”
“皇上，您還……”小太監指了指朱由檢光溜溜的腿。
“哦哦，你們趕緊備車。”朱由檢說完，連忙進屋找褲子。找了半天，終於在楊靜的身子底下找到了。
“三更半夜的，出了什麼事啊？”楊靜睜開睡眼朦朧的眼皮，有點不滿意。
“你先睡，我去外面看看，等會就回來。”朱由檢顧不得看牀上的美人圖，扭頭就走。可憐的楊靜，只能扭動了幾下大腿，幽怨的看了一眼門外。
將軍山一處隱蔽的作坊，一大羣人正死死的盯着一個巨大的轉動的輪子看着，衆人像看金子一般，目光隨着輪子的轉動而轉動。彷彿進入一場夢。
“皇上來了，快讓一讓。”門口有人高喊一聲，衆人這才醒了過來。
“轉了多久了？”朱由檢看了看眼前的東西，它似乎跟想象的不太一樣。
“已經轉了有一個多時辰了，沒有出問題。”領頭的一人小心的看了一下沙漏。
“一直勻速?”朱由檢最關心的是這個。
“一直勻速，調速器工作正常。”
實際上蒸汽機的原理並不複雜，蒸汽機的樣機早就做出來了，但是並不能正常使用。之前最早的一個樣機能連續轉一炷香時間就不錯了，停下就得大修。
除了密封問題，還有鍋爐承受過大壓力，動力輸出不均勻等。蒸汽泄露和鍋爐爆炸都死過人，到現在還有一個人渾身皮膚都沒一處完整的。
整整一年了，這大明的第一臺實用型的蒸汽機終於算是造出來了。
“你們一共造了多少臺樣機了？”朱由檢知道搞技術有多麼不容易。
“總共造了三十多臺，現在剩餘不到五臺。”項目負責人叫程星耀，二十八歲的年輕工匠。當初拿到原理圖紙的時候還挺帥的，現在他的臉上已經扭曲和醜陋不堪，身上到處都是燙傷的傷疤。
“朕給你們一個月時間休假，項目組額外獎勵一萬塊銀元。”
回到小院的朱由檢更是興奮的睡不着，頭枕着手掌在思考着將要到來的變革。
大明的各項事業都有進步，就像蒸汽機一樣，終於已經開始平穩運轉了。
“你剛剛去哪了？”楊靜用一雙大眼睛好奇地盯着朱由檢。
“我剛剛去看了半天的活塞運動。”
“什麼是活塞運動?”
“來，朕親自教你。”