俄國艦隊從金蘭灣出發，意味着暫停了約2個多月的戰爭又將展開，而且由於這次有了華東政府的介入，使得戰局也變化更爲複雜。
華東政府和俄國都充份的利用這段暫停的時間，爲下一步的戰爭做好了充份的準備，而做爲日俄戰爭的另一個當事國日本，也同樣沒有閒着。
早早收兵回國的聯合艦隊首先經過了3個月的修整，軍艦都進行維修保養，恢復正常的性能，而水兵輪流休假以養精蓄銳。在2月份的時候，聯合艦隊全軍集結，以俄國第二太平洋艦隊爲目標，展開了緊張的訓練演習，重點在於炮術的訓練，因爲在第一階段的戰鬥中，聯合艦隊暴露出來的最大問題是命中率太低，在炮戰中僅僅只擊沉了一艘裝甲巡洋艦，因此炮術訓練變得愈發嚴酷。
東鄉平八郎提出了一個著名的練兵宗旨——“百發百中的一門大炮要勝過一百門百發一中的大炮”。並且在聯合艦隊中實行月月火水木金金訓練。原來在日語裡從星期日到星期日六分別稱爲日耀日、月曜日、火曜日、水曜日、木曜日、金曜日、土曜日。日耀日和土曜日就是星期日和星期六，而月月火水木金金，就是沒有日耀日和土曜日，也就是沒有了星期日和星期六，一週七天沒有休息，全都進行訓練。而每天的炮術訓練達5個小時，僅實彈演習就安排了八次，而這樣瘋狂的訓練，使得所消耗的炮彈已經超過了日本國內炮彈儲備的半數。
而在陸軍方面，日本在遼東半島投入的兵力超過50萬，其中作戰部隊達3 5萬左右，佈置在瀋陽一線與俄軍對持的軍隊達2 0萬，佈置在遼河東岸防備人民軍進攻的兵力約爲7萬，旅順的守軍爲3萬餘人，其餘的兵力則分佈在遼陽、鐵嶺等幾個關建節點上，而在朝鮮半島上還有約10軍隊做爲後備兵力。因此盡從兵力上說，日本投入的兵力絲毫也不弱於俄國和華東政府，不過由於地理位置的劣勢，使得日本有些被動，在北西兩線均只能選擇守勢。
不過就在俄國艦隊離開金蘭灣的第二天，明治天皇招集元老伊藤博文、井上馨，首相桂太郎、外相小村壽太郎、藏相鬆方正義、陸軍大臣寺內正義、陸軍部參謀總長山縣有朋、海軍大臣山本權兵衛、海軍軍令部長伊東佑亨等文武大臣聚議，討論下一階段戰爭的策略。
而這樣的軍政陣容，只有在日俄戰爭開戰之前的御前會議纔有過。打到這個時候，日俄戰爭開戰己有15個月了，儘管日本不斷在戰場上取勝，但俄國卻是始終打不死，而且還在向遠東地區不斷的集結軍隊、艦隊，而戰爭進行到這一步，日本的戰爭潛力己經被耗得差不多了，因此從表面上日本的形式雖然是一片大好，但內囊裡卻是己經空了，只要是稍有閃失，日本必然是兵敗如山倒，全面的崩盤。
明治天皇對日本的情況自然是十分清楚，因此日本越是在戰場上取勝，明治天皇反而心裡越是沒有底，由其是日本和華東政府惡交，人民軍進駐遼西，明治天皇就更是越想越沒把握，心裡也越慌，生怕聽到日軍遭到人民軍和俄國夾擊的消息，有幾次都被日本戰敗的惡夢驚醒過耒。
在戰爭將要重新展開之際，明治天皇也終於沉不住氣了，於是招集大臣們，聽一聽他們對下一步戰爭的意見，當然明治天皇心裡也十分清楚，戰爭進行到了這一步，日本是絕對停不下來的，只能硬着頭皮打下去，要麼打贏上天堂，要麼打輸下地獄，沒有第三條路，而明治天皇招集大臣，其實只是想從大臣們聽到一些日本必勝的理由，好讓自己心裡能稍稍安定一些。
明治天皇首先道：“俄國艦隊已經從金蘭灣出發了，大約在20天以後到達黃海海域，不知我們的海軍準備的怎麼樣了，有沒有勝算？”
山本權兵衛道：“請陛下放心，陛下的艦隊還有將士們都己經做好了充份的準備，只等俄國艦隊到達黃海，必然會給他們迎頭痛擊。天佑日本，我們一定會取得勝利的。”
伊東佑亨也道：“是啊，俄國艦隊是遠道而去，耗時6個多月，航行了2萬6千餘里，軍艦的摩損必然十分嚴重，而人員也身心疲憊，1 0成戰鬥力，最多隻能發揮出5、6成；而聯合艦隊己經修整了半年多的時間，軍艦都己經得到了維修保養，軍艦的性能己完全恢復，而士兵也得到了充份的休息，因此我們是以逸待勞，這一戰必然會擊敗俄國艦隊的。”
明治天皇點了點頭，道：“如此朕就放心了。”
山本權兵衛道：“一但我們擊敗俄國艦隊，俄國將徹底喪失海上的力量，因爲俄國國內也不可能再拼出一支艦隊來，日本將會獲得絕對的制海權，這一場戰爭至少將會立於不敗之地，而最終能不能取勝，就看陸軍的能力了。”
陸軍大臣寺內正義立刻道：“請陛下放心，我們陸軍也有信心，取得勝利。”
其實只是俄國艦隊來了，明治天皇到也並不太在意，畢竟一個遠道而去，一個以逸待勞，孰優孰劣一目瞭然，他最擔心的還是陸地上的戰鬥，畢竟日本要取得這場戰鬥的勝利，最終還是需要在陸地上解決戰鬥。而寺內正義這種口號似的表態，顯然是不能讓明治天皇信服的，因此明治天皇道：“如果俄國和海外華人聯手，我們日本是否還有勝算呢？朕不懷疑士兵的忠勇，但戰爭並非是靠忠勇就可以取勝的。”
這時山縣有朋道：“請陛下放心，俄國的軍隊雖多，但己是久敗之軍，士氣低落，而且武器裝備，後勤供應都有不足，因此並不足爲懼，而海外華人在遼西只有6萬餘軍隊，還不足以改變大局。”
明治天皇皺了皺眉頭，山縣有朋的解釋並不能讓他完全放心，道：“海外華人現在的軍隊雖然不多，但還可以再增加啊，何況海外華人的進攻路線並非是遼西這一條，他們的海軍亦不弱，完全可以以旅順爲攻擊點，在海上再開避一條戰線，而我們的海軍要攔截俄國的艦隊，是沒有辦法給旅順足夠的支持，只能靠陸軍守衛；俄軍雖然不足爲懼，但畢竟兵力龐大，如果俄軍和海外華人聯手，海陸並進，三路夾擊，我們又應該怎樣應對呢？”
山縣有朋的額頭上也不禁滲出汗水，因爲明治天皇的這個問題可並不好回答，畢竟再靠忽悠是不行的。
伊藤博文道：“陛下請儘管放心，海外華人和俄國是不會聯手的，俄國的目標是佔領清國的滿洲地區，而海外華人以華夏後裔自居，護土有責，決不會允許俄國佔領滿洲地區，因此雙方是水火不容，只會各自爲戰，但決不會聯手。”
明治天皇聽了，臉色也稍好了一些，又道：“就算是海外華人和俄國各自爲戰，對我們日本來說仍然是勁敵，也不能輕視啊。”
伊藤博文道：“陛下所言不錯，不過我們日本也不是孤軍奮戰，我們還有英國這個盟友，還有【英日同盟條約】。”
明治天皇怔了一怔，道：“英國？”
這時小村壽太郎道：“是，陛下，英國大使昨天訪問外務省，向我們表示，英國會繼續支持日本將這場戰爭進行下去，而且他們己經向海外華人施壓，要求海外華人不要介入遼東的戰局，如果我們擊敗俄國艦隊，英國也會促使俄國承議戰敗，和我們進行談判。”
聽了小村壽太郎的話之後，明治天皇也不由得精神一振，他之所以對戰爭沒有信心，很大的原因是英法兩國提出調停日俄戰爭，等於是放棄了支持日本，而沒有英國的支持，日本要單獨贏下這場戰爭的難度極大，但如果英國再度支持日本，那麼日本的勝算自然大增，明治天皇自然心中大定，不過他心裡又生出了另一個問題，英國爲什麼又會轉而支持日本呢？會不會又是忽悠日本呢？於是明治天皇道：“這次英國的保證，是否可靠呢？”
伊藤博文道：“陛下大可以放心，這次英國的保證，是絕對可靠的。” 說着，伊藤博文將摩洛哥危機造成的影響和變數等等，都詳細對明治天皇解說了一遍。
明治天皇對世界大局到是十分了解，因此聽了伊藤博文的解釋之後，立刻就明白了其中的道理，這麼看來英國對日本的支持確實是可靠的，而心裡自然也完全安定了下來，臉上也露出了一絲笑容，有些情不自禁道：“好，好，朕終於可以放心了。”
但說完之後，明治天皇才又覺得有些失態了，於是趕忙又崩起臉來，做出一付喜怒不形於色的樣子，又道：“雖然有英國的支持，但要取勝，還有待諸君共同努力，爲皇國振興、國基堅實、國運昌宏盡力。”
在座的大臣們聽了，也都趕忙跪伏於地，舉手扣拜，三呼“天皇萬歲”，而在衆臣的賀拜聲中，明治天皇才離座起身，轉回到後宮去了。