明末，東南滄目山。
藥師谷，藥師洞。
“歸鴻門滄目舵座下弟子李愚，冒昧擅闖藥師谷，求藥師賜藥，救我舵主。我舵願以萬金酬謝！”
一個身着藍衫的少年站在洞前，雙手抱拳，向着洞口朗聲誦道。
歸鴻門，江湖中最爲神秘的一個刺客組織，相傳起源於戰國末年，由荊柯的門人所創。歷經千年，歸鴻門中英傑輩出，分支遍佈神州大地，觸角從朝堂一直延伸到山野。百姓傳說，歸鴻劍客除惡揚善、扶危助困，堪稱替天行道的隱俠。歷朝歷代的君王有的欲收歸鴻門於麾下，驅爲鷹犬，有的視歸鴻門爲大患，欲除之而後快。
李愚正是歸鴻門中的一位少年英豪。他是個孤兒出身，自幼被歸鴻門滄目分舵的舵主韓智收養爲義子。他三歲起就隨門中師兄習武，由於天資聰穎，加上得到韓智的口授心傳，他迅速成爲歸鴻門年輕一代中的佼佼者。別看他今年只有18歲，卻已在江湖上闖下了諾大的名聲。
明末的神州，可謂內憂外患。北方連年大旱，民不聊生，民變四起；遼東戰事不斷，關寧邊城危若累卵。東南沿海一帶也不太平，趁着明廷無暇東顧，倭寇與漢奸糾結，不斷騷擾城池，禍害百姓。
在此國難當頭之時，韓智率領歸鴻門滄目舵的門衆，奮起抗倭，護衛一方安寧。誰料想，在渝海城的一次抗倭作戰中，韓智被漢奸用毒藥傷害，生命危在旦夕。
渝海城醫館集萃堂的掌櫃神醫羅根生前來問診，認出韓智所中的毒是藥師門中不外傳的秘藥無影毒。據羅根生說，目前江湖中能使這種毒的只有兩個人，一個是他的恩師，也是藥師門的現任掌門範無痕，另一位則是他的師叔田無跡。田無跡因爲不服師兄接任掌門之職，早已叛出師門，前些年即有其賣身倭寇的傳聞，由此次韓智中毒一事來看，這個傳聞並非空穴來風。
羅根生表示，要解無影毒，只有一個辦法，就是前往藥師谷向藥師範無痕求藥。範無痕在藥師谷隱居已有20年之久，藥師谷十里方圓都有範無痕佈下的毒陣，尋常人根本無法進入。
李愚自告奮勇領受了前往藥師谷拜見範無痕求取解藥的重任，他帶上韓智的舵主令牌作爲信物，又籌集了一包金銀財寶作爲禮物，然後便隻身趕赴藥師谷。臨行前，羅根生給他服了一粒藥丸，用於抵禦藥師谷內的毒氣，至於其他的兇險，就只能靠李愚自己去化解了。
一路上，說不盡各種艱難，李愚終於來到了範無痕居住的藥師洞前。
藥師洞大門敞開，裡面沒有一絲聲響。李愚不敢造次，停身站住，向裡面大聲通報。連喊了十幾聲，洞裡都沒有任何反應，聯想到傳說中藥師範無痕亦正亦邪、喜怒無常的性格，李愚牙一咬心一橫，說了聲“得罪”，手中早已有了一把尺許長的短劍，緩步走進了洞口。
幹刺客這一行的，破解各種機關深入險地是經常的事情，李愚既然選擇了來藥師谷求藥，就早已把生死置之度外了。讓他感到驚奇的是，他居然沒有遇到障礙，便順利地走到了藥師洞的石室之中。
石室四四方方，長寬各有兩丈，高有丈許，身處其中，絲毫沒有氣悶的感覺。李愚沒有看到燭火，也沒有看到窗口，洞中卻並不十分黑暗，僅僅如戶外的黃昏相仿。
在石室正中有一座臺子，臺子上端端正正地盤腿坐着一位老人，雙手搭在膝上，臉上的神色似笑非笑，一雙眼睛微微閉着，似乎已經入定。在臺子前幾步遠的地方，擺着幾個蒲團，看起來像是用來下跪的。李愚遲疑了一下，走上前去，在正當中的蒲團上跪下來，恭恭敬敬地給臺上的老人磕了幾個頭，然後把韓智中毒的事情從頭到尾說了一遍，最後道：
“李愚懇請藥師前輩賜予無影毒解藥，李愚願以萬金酬謝。”
臺上的老人沒有一點反應。
李愚從自己的背囊中取出一堆珠寶，放在面前，然後再次磕頭，把頭伏在地上，等待着老人的回答。
許久，石室中依舊寂靜無聲，李愚側耳傾聽，驚異地發現只能聽到自己的呼吸聲，老人卻是一點聲響也沒有。李愚心念一動，閃身起來，衝到臺子前，把手伸到了老人的鼻下一摸，不由得傻了眼，原來臺子上的這位老人早已氣絕多時。
這可怎麼辦！
李愚慌了，他四處張望，驀然發現在老人面前有一張摺疊起來的黃紙，他撿起來展開，藉着朦朧的燈光一看，上面寫着四行字：
“入我門來，跪拜謝師；掌門異寶，盡傳愛徒。”
在其下，又有幾行小字，稱看到字條的人既然能夠不懼毒陣進入藥師谷，自然是藥師門傳人，能夠想到前來探望他，必是有孝心的徒弟。他有本門秘傳的“藥師本經”兩冊及藥師門掌門令牌一枚，藏於石壁之中，另有多年積累的藥材藥丸一批，全都傳給最先進入藥師洞的弟子。
還有這樣的好事？
李愚心中暗喜。藥師門的掌門令牌，他並不感興趣，不過想必帶回去交給韓智，韓智應當會有用處。藥師本經顯然是藥師門各種用毒解毒的秘笈，有了秘笈在手，何愁解不了韓智的毒。至於說那些藥材、藥丸之類的，李愚倒不打算動，這是人家藥師門的傳承，還是等真正的藥師弟子去動用吧。
想到此，他開始放心大膽地在石室裡搜索開來，不多時便在一面牆上發現了機關，啓動之後，果然現出了一個壁櫃，裡面藏着不少瓶瓶罐罐，最顯然的地方，有一個外觀古樸的木盒。
李愚拿過木盒，打開一看，裡面有兩冊書和一塊玉牌，書上寫的名字正是藥師本經。李愚合上盒子，正準備關掉壁櫃，忽然看到原來放木盒的地方還有一張字條，顯然是壓在木盒底下的，自己方纔沒有注意。
帶着好奇心，李愚展開了字條。字條上寫着一行字，字體極小，在昏暗的光線中根本無法看清。李愚掏出火鐮和松明點着了火，湊近去看，上面的話卻是極不正經：
“乖徒兒，爲師傳給你掌門之位，你一定樂壞了吧？得了爲師這麼大的好處，是不是該留下陪陪爲師？我知道你心性不定，肯定不願意聽爲師的話，爲師新煉了一種千年醉，能讓你踏踏實實地呆在這裡陪上爲師一千年。藥方和解藥如下……對了，這種藥無色無味，遇火即發，你現在是不是正點着燭火在看呢？”
燭火？李愚擡眼看到自己手中燃燒着的松明，突然想到了什麼，他把松明扔在地上，用腳踏滅，正準備奔出洞去，就覺得渾身無力，整個人歪歪扭扭地倒在了地上。
這個老東西！
這是李愚失去知覺之前最後的念頭。
洞口處，忽然毫無徵兆地發出了一聲巨響，一道沉重的石門從石洞頂上墜下來，把洞口嚴嚴實實地封閉起來，隨後，洞中石室的光線也一下子消失了，整個石室陷入了無邊的黑暗……