紹興和議後，宋金雙方進入短暫的和平期，秦檜的勢力也達到頂峰。秦檜之侄秦熺高中進士，快速提拔爲少保、知樞密院事，秦熺之子秦壎更是高中狀元。很顯然秦檜準備扶植他的兒孫繼續執掌大權，這在宋代很難被人接受。而秦檜又禁止私人修史，限制言論自由，更是違背宋朝祖制，激起公憤。紹興二十年，殿前司小校施全行刺秦檜，差一點兒得手，而被貶斥的張浚、胡銓等人一直在野堅持不懈地彈劾秦檜。紹興二十五年（1155年），秦檜病危，高宗到他家探病，秦檜流着淚奏請立秦熺爲相。父子相繼爲相，這在宋朝並無先例，更不能自己主動提出來，秦檜臨死前提這樣的要求可能是病入膏肓的表現。宋高宗終於抓住一個把柄，下詔加秦檜爲建康郡王，秦熺爲少師，一併致仕，秦熺的兩個兒子也罷爲虛職。當夜，秦檜薨，享年65歲，贈申王，諡忠獻。秦檜任宰相約19年，大權獨攬，一直力主議和，多次葬送大好形勢，而且動機不明，以至於被人認爲是間諜。
《宋史》對其評價是“劫制君父，包藏禍心，倡和誤國，忘仇斁倫。”朱熹子對其評價是“高宗所欲用之人，秦皆擯去之。舉朝無非秦之人，高宗更動不得。”尤其是他殺害民族英雄岳飛，長期以來爲人所憎恨，在民間的形象極差。更重要的是，宋朝設計的臺諫系統本是監督制約權力主體的良好機制，卻被秦檜用做黨同伐異的工具，首開私人黨羽的風氣，雖然宋朝的社會基礎已經不再允許私人門閥的出現，但這畢竟會對官場風氣產生重大影響，之後南宋還出了好幾個秦檜式的大權臣。秦檜死後很久他的餘黨才逐漸被清理，開禧二年（1206年），秦檜被追奪王爵，改諡謬醜，這個諡號確實才更適合他。岳飛由於是被秦檜害死在獄中，沒有獲得正當的追贈和諡號，直到宋孝宗繼位後才追復官職，累贈至太師，諡武穆，後改諡忠武，追封鄂王，明朝又追贈“三界伏魔大帝忠孝妙法天尊嶽聖帝君”，但習慣上仍稱嶽武穆。
岳雲追贈安遠軍承宣使，張憲追贈寧遠軍承宣使，明朝又追贈烈文侯。宋孝宗隆重安葬了岳飛等人的遺體，地址在今杭州市西湖邊的棲霞嶺，也就是嶽王廟，在湯陰、靖江、朱仙鎮等和岳飛相關的地方也都立有嶽王廟。杭州嶽王廟中立有岳飛的彩塑，千百年來受到人們的敬祀，岳飛早已超越了他個人，既是建炎名將們的總代表，更成爲整個中華民族忠義精神的化身。嶽王廟，還有明代民族英雄于謙的祠堂，使這柔美的西湖更添了一份浩然正氣。秦檜、王氏、張俊、万俟禼四人的鐵像則長跪於嶽王面前，千百年來，每位來參拜岳飛的後人，也不忘向這幾個民族敗類淬上一口。正是：“青山有幸埋忠骨，白鐵無辜鑄佞臣。”我突然驚訝地發現，除了中國的岳飛，還有高盧的聖女貞德、凱爾特的威廉*華萊士、日耳曼的華倫斯坦、拜占庭的貝利撒留……歷史上爲何每個民族的英雄都在對外戰爭中讓侵略者聞風喪膽，最終卻要以一種悽慘的方式敗在自己人的手中呢？我不相信所謂的“劣根說”，這或許也是人類社會進步的必然過程吧。