崇禎二十年二月，崇禎皇帝一旨令下，明廷開始徹底整改南直隸。
首先裁撤的就是舊有南京六部，明廷將南京吏戶禮工刑兵六部，還有都察院、國子監等一大批與京師相同規格和名號的部院盡數裁撤，並且永不再設。
這道旨意一出，大明自永樂年間施行了兩百餘年的兩京制度，便是徹底被廢除，天下由此而是議論紛紛，不少人驚慌失措，覺得又要大亂。
更有人幸災樂禍，覺得這是崇禎皇帝咎由自取，勢必滅亡，然而無論這些人如何去想，明廷上下在南京的整改行動卻仍是如火如荼。
西廠、神武軍，以及各地戍衛兵馬，幾乎都是全數出動，隨處可見巡衛的兵丁和奉旨拿人的番子、差役，旁人無不是敬而遠之。
在這個期間，就連青皮們也是不敢滋事，因爲官差對他們再也不會留情，這個節骨眼上被抓到了，幾乎都是難逃死亡的命運。
裁撤這些部院之後，數萬官員沒了官身，自然要聯絡各個階層開始鬧事，但西廠動作很快，僅五品以上官員，在三日之內就抓捕了數百人。
嚴重些的抄家滅門甚至被誅族，請的禍及自身，或被充軍戍邊，或被髮爲刑役，打散到各地的陵寢之地做免費的苦力勞工。
對待這些曾經的大佬們，底下人也是不會客氣，根本沒有拿他們當人對待，幾日下來，這些往日嬌生慣養的文士們，便是死了大半。
他們的死活並不會對朝廷接下來的行動起到一絲一毫的影響，南京還只是個開始，這場聲勢浩大的抓捕行動，很快就從南京遍及整個南直隸。
無數老舊官員被當街處斬，抄家滅門，可是緊接着又會親皇黨一系的的新官員走馬上任，穩定局勢，對於這些皇帝親自任命的大員，各地官員也是根本不會有任何不遵不敬。
曹化淳藉着這次行動，幾乎在南直隸每個州府都設立了西廠分署，東廠各地衙署傳令的叫做飛信，主要是飛馬遞信。
西廠也搞出了一套自己的情報系統，他們管傳令的東西叫做天令，叫的好聽，其實就是各種訓練出來極其聽話的信鴿。
各處官員只要見到西廠番子們青色的衣裳，就會嚇得瑟瑟發抖，在崇禎皇帝的刻意縱容之下，西廠威權隨之日漸旺盛。
不過有馬爌、周經武等人帶兵坐鎮城內，南京內外倒是沒出多大的亂子，與往常不同的只是巡邏衙役多了數倍，到處都能見到明甲執銳的兵丁戍衛城防而已。
既然撤了南京六部和各部院衙門，自然要有新的代替，南都留守司衙門便是應運而生，選址就在原本的鎮守太監府邸。
南都留守司下設三個分部，分管南京內外的軍政、民政和稅收，增設了一批如惠民藥局、施粥廠、南都歷事分局、工事分局、火器分局等一批的功能性衙署。
至於這些衙署的官員，先從原本各部院官員中錄有實績者擇優充任，若是不夠，再由京師統一調派。
除此之外，南京城並不會和其餘的府城有任何不同。
同時，明廷取消了南直隸行政區，將舊有南直隸十四個府徹底打散，只保留順天府等三個仍是府的沿革，其餘十一個或降爲直隸州，或降爲散州，地方官員同樣隨之降級。
尤其是曾發生動亂的建武朝廷首都杭州，被直接從府降爲散州。
除了戍衛兵士以外，南京內城的巡衛、鎮守工作此後將全部由周經武統帶的神武軍負責，周經武不僅是南京守備，還被任命爲留守司軍務分部的主事官員。
南直隸其餘州府的處置，用一個字可以概括，那就是拆。
徹底拆了原本南直隸各州府的轄境，北側徐州府降爲直隸徐州，淮安府降爲直隸淮安州，兩處均劃入山東轄內，設知州、守備，由山東三司統一管理。
中都鳳陽府改稱中直隸，革中都，廢中都留守，將一部分原徐州府、淮安府轄境劃入，設鳳陽知府、鳳陽總兵。
南側廬州府、安慶府降爲直隸州，原境劃入湖廣，由於曾生叛亂，杭州從府直接降爲散州，劃入順天府管轄境內，設知州、守備，由京師統一調派。
總而言之，這次明廷的意思很明確，就是徹底要把原本抱成一團的南直隸拆分掉。
光拆分還不夠，原本南直隸各地的州府官員只要是少有實權的，要麼被捉拿法辦，要麼就是被調往他處，取而代之的都是新面孔，鮮少有幾人能留在原任。
明廷規定，南京留守司只管理南京城內的軍政民政，在此之後，南京城並不屬於應天府轄內，不可以插手應天府其餘州縣任何事務。
當然，這次改革還並未完成，若是日後有任何不妥當之處，朝廷都可以隨時修改，反正崇禎的意思斬釘截鐵，就算要重新規劃再多的東西，也不能留着南直隸這顆大毒瘤。
就在整個江南都爲朝廷的新政策而晃動不已的時候，崇禎皇帝卻在守備府正襟危坐的接見一個人。
“草民談遷，參見吾皇萬歲萬萬歲！”
說話間，談遷擡起頭注視着這位剛剛在江南造成腥風血雨的皇帝，卻發現他並沒有自己來之前想象的那樣兇狠暴戾。
正相反，他相貌頗爲溫和，臉上也掛着一絲淡淡的微笑，根本看不出來是裁撤南京六部和取消南直隸的那個鐵腕皇帝。
“朕曾聽聞你在民間多次評價朕的做法，今日見到朕本人，可是有什麼要和朕說的嗎？”
“草民...”談遷根本就不信崇禎皇帝會是表面上這樣溫和的樣子，這次怕不是要怪罪於自己，他想想說道：“陛下給草民的感覺，就如同陽光一般溫和，想來那些民間傳聞，多是虛假的。”
“愛卿會說話，哈哈。”
崇禎皇帝哈哈一笑，似乎對這種馬屁行爲很是受用，過會兒又道：“朕曾聽說你寫了國榷，但無人出版一直擱在家中，前些年又被賊人盜走，是這樣嗎？”
“陛下你連這都知道？”談遷有些震驚，後又感覺自己失態，忙道：“陛下恕罪，草民第一次見到天子，激動難耐，難免失態......”
“不妨，既然這事是真的，朕覺得是被偷走倒是一件好事，舊的不去，新的何來？”說到這裡，崇禎皇帝笑了笑，說道：
“談遷聽旨。”
談遷聞言心下一驚，連忙喊道：“草民接旨！”
“朕有意重修《國榷》，你談遷便是主修官，拿着這道聖旨，各部官員都會全力協助，你可以時常入宮，朕偶爾也會將先帝的一些宮內秘聞告知與你，助你重修。”
“至於官身，想必你也不會太過在意。這樣吧，爲方便起見，朕會給你一道聖旨，准許你調動宮中典籍，若是有人刁難，你就拿着就去京師找李天經，讓他安排你在歷局供職。”
“國榷修成，朕即用皇家報社刊行天下，你會青史留名，全部費用由皇家資助。”