有了黃寬這個流學歸來的醫學博士主持同濟醫學堂的大局，相比而言，曾紀澤要比建立黃浦軍官學堂時輕鬆許多。
程學啓的傷勢已無大礙，但短期內卻只能臥牀休息。太倉之戰的勝利擊退了譚紹光的反攻，與此同時，常熟、福山、崑山等地的太平軍進攻也相繼被擊退，淮軍總算是在常太一帶站穩了腳跟。
曾紀澤趁着戰局稍有穩定的間隙，親自前往太倉，招開了一次前線的非正式軍事會議。在會議上，曾紀澤向每一位在座的淮軍高級將領分發了一份手冊，那是參謀處與黃浦軍官學堂合力編寫的《淮軍紀律典章》。
典章首要內容是強調軍人必須以服從命令爲天職，這是爲了加強他對淮軍的控制。其次則強調了淮軍內部的團結性，手冊中更是寫明：凡聯合作戰之時，不對友軍實施協作、支援者，一律以軍法處置。
在座的都不是白癡，他們很快就明白，曾紀澤的這個會議是針對着程學啓事件而開，矛頭自然是對準了“不對友軍實施協作、支援”的潘鼎新。劉銘傳、張樹聲等見巡撫大人不是針對自己，便是鬆了口氣，各人悄悄的看向潘鼎新。
“咱們的淮軍不是綠營，更不是八旗兵，我絕不容許結幫拉派，狼狽爲奸，相互攻詰這等惡習存在。不管是你們原來是團練也好、髮匪的降兵也罷，又或是販夫走卒，士子書生，只要一加入我淮軍，便沒有任何區別，大家就是兄弟，就是一家人，戰場上就得相互扶持，同生共死。”
曾紀澤拍着桌子訓話，他一向待人溫和，這是他第一次發這麼大的脾氣。直把那些看慣了他親切一面的淮軍將官們震得心中發毛，而那潘鼎新更是嚇得面色慘白，頭低得就差鑽到桌子底下去。
“如今國勢衰落，內憂外患，既是災禍，對我輩而言，又是一種機遇。我曾紀澤辛辛苦苦創立淮軍，別無他念，只想帶領着各位創一番事業，他日同享富貴榮耀。我淮軍能走到今天這一步，實屬不易，咱們已是一條船上的人，一榮俱榮，一損俱損。所以我希望各位眼光都能放長遠一些，拋卻偏見，心中無時無刻都只有‘淮軍’二字，非如此，纔不至於將我們辛苦創立的功業葬送。我言盡於此，還請各位好好想一想吧。”
曾紀澤這一番話情理交融，恩威並施，不光是潘鼎新，在座的衆將都聽得默默無言，臉色頗有愧色。
會議散後，曾紀澤並沒離開，他是在等着潘鼎新來向他認錯。今天當着衆人的面，他沒點名批評潘鼎新，這算是給他留了面子，若他是一個懂得事理輕重的人，理由私下來向他做出檢討。
潘鼎新果然沒有讓曾紀澤失望，不多時，他便帶着一臉的愧色，獨自走進了會議廳，二話不說，撲嗵就跪在了曾紀澤面前，“末將愧對大人的栽培，請大人治末將的罪吧。”
人非聖賢，孰能無過，潘鼎新乃大將之才，更何況已有悔過之意，目的既已達到，曾紀澤又豈會真的去治他的罪。
“琴軒快快請起。”曾紀澤忙起身將潘鼎新扶起，拍着他的肩膀安撫道：“你知錯能改，實在是難能可貴。這件事就這麼過去了，今後不須再提。”
潘鼎新見曾紀澤大人大量，既往不咎，心中愧意反而更濃，紅着臉道：“多謝大人。不知……不知程大人他怎麼樣了？”
曾紀澤道：“方忠的傷勢已無大礙，不過還得休息數月才能完全康復。不過他這人倒是大度，在我面前沒說過你半個字的壞話。”
潘鼎新深嘆了一聲，毅然道：“方忠兄胸懷寬廣，實在令末將汗顏。末將有一事相請，還望大人幫助。”
曾紀澤問他何事，潘鼎新便說要與程學啓結爲兄弟，請曾紀澤從中說和。曾紀澤樂得見他們這些不同來路的淮軍大將能避棄前嫌，當即便答應了潘鼎新所請。
曾紀澤召開軍事整風會議之後，並沒有直接回上海，而是留在了太倉，就近指揮各路淮軍的作戰。藉着挫敗太平軍反攻的餘威，曾紀澤命新調的劉銘傳團立即向楊庫城發起進攻，奪取這一處交通要地。
7月底，劉銘傳部發起了對楊庫城的進攻。
早在譚紹光發起第一次反攻之時，他就十分清楚的認識到淮軍的戰略意圖，一月之前便命護王陳坤書、潮王黃子隆分別調遣太平軍進駐江陰、常熟、無錫的交界地區，防止淮軍進犯無錫、江陰，保障蘇州後路的安全。
反攻失敗後，黃子隆等又率無錫太平軍進至常熟西境，加強對北線的防禦，並派精兵2000留守楊庫。
當日，楊庫一帶起了大霧，劉銘傳一時興起，決定親赴城下察看地形，以決定明天的進攻方略。左右將佐無不大吃一驚，紛紛勸他不要冒險。劉銘傳卻是膽略過人，毫不以爲然，一揮手道：“髮匪不敢在城外駐營，統統縮進了城裡當烏龜，分明就是怕了老子，老子就偏要親自前去瞧瞧這幫龜孫子，看他們敢耐我何。”
劉銘傳不顧衆將勸說，一躍上馬奔出大營，便飛一般望楊庫城去。衛隊長唐樵山見狀，只得率領着一百多親衛隊緊隨而去，保護着劉銘傳直抵楊庫城下。
大霧並不算濃，劉銘傳策馬揚鞭，登上離城七百米遠的一座小土丘，昂首眺望楊庫城頭，回頭向唐樵山道：“樵山呀，你瞧見城頭那些旗幟了嗎，多得是數不清吶，看來城裡的髮匪還真不少。”
唐樵山也翹首以望，隱約可見城上旗幟遍佈，東西兩座炮臺上似乎堆滿了彈藥，他暗吸了一口涼氣，“大人，照這情勢來看，城裡的髮匪至少也有五六行。咱一團人馬纔不過三千，這仗不好打呀。”
劉銘傳哈哈大笑，鞭子輕抽了一下他的腦袋：“枉你白跟了我這麼多年，脖子上這玩意兒還是塊生鏽的鐵疙瘩。”劉銘傳指着楊庫炮臺道：“你想想，哪有人會傻到把彈藥明目張膽的堆在光天化日之下，他們就不怕被一炮擊中，整個炮臺都毀了麼。分明就是彈藥不足，整些假的箱子擱在外頭，故意想讓咱們瞧見。”
劉銘傳接着道：“凡守城布兵，並不是人越多就越好，城牆上的兵員密度越過了一個界限，反而不利於防守。你想那幾十號人扎堆似的蹲在城上，一炮過去就死一大片，最蠢的主將也不會這麼排兵佈陣。”
唐樵山恍然大悟：“大人的意思是說，城上那麼多旗幟都是髮匪故意插上去的，好虛張聲勢，讓咱們以爲他們人馬很多。”
劉銘傳笑哼一聲：“腦袋總算還沒鏽到轉不動的地步。”
“嘿——跟着大人久了，自然就學聰明瞭。”唐樵山得了讚賞搔着頭憨笑。猛然見到楊庫城門大開，有數百人馬衝出城來，徑直往土丘這邊殺來。