揚州和益州兩邊在互相忌憚又互相加深合作的時候，北方劉備那邊，卻遇上了大麻煩。因爲連續的戰爭，兗州爆發了瘟疫。
這次的瘟疫，並沒有發生在城池中。得益於青州體系多年以來持之以恆的衛生建設。在戰後的衛生防疫措施方面，可以說已經是達到了相當先進的水平。在高溫焚燒以及開水煮洗、撒石灰、傷病隔離等無數手段的配合下，劉備軍隊中，幾乎沒有爆發過大規模的傳染性疫病。
這一次，經過後來調查，卻是一股曹兵，逃竄至一處村落。然後這些人中輕重傷都有，又沒有得到很好的治理，結果就發病了。村中缺少藥材，又被武力封鎖，不能報官。等到有人接連死去的時候，這股潰兵這才慌了神，然後紛紛趁亂逃走。而村中的百姓，也是扶老攜幼，匆匆逃離這處是非之地。
而這些人中間，不免又有攜帶了病菌的人。他們不離開還好，這四散一跑，又把疾病給傳染給他人。於是就此一發不可收拾。
等到驚動了劉備，兗州的疫情已經是延綿了數郡了。劉備得知後，忙忙召人前來商議。經過緊急商討後，便下命令，用軍隊封鎖兗青、兗徐、兗冀等地的通道。控制人羣的遷徙。然後又調撥大量的藥材與物資、人手，進入兗州，進行防疫工作。
兗州的軍隊，提前對各郡進行軍事管制，以免發生騷亂、暴動。這年月，在對瘟疫還沒有比較完整的治療方案的時候，談及瘟疫，那是人人色變。在這種疫病面前，管你是王公貴族還是平民百姓，大家一視同仁，該死的都得死。
原本歷史上建安年間的這一場持續很長時間的瘟疫，奪去了無數百姓的性命。有名的建安七子和竹林七賢中，都有人死於這場大疫。
該來的，還是會來。只要有戰爭，疫病便會避免不了。劉備也是人，他不是神。管不到每一個角落。他只能儘量去推動一些事情的進程。幸好在疫情爆發後，張飛與太史慈等人，就立馬啓動了軍隊防疫工作。
軍隊中的傷病士卒，第一時間被隔離起來進行消毒，然後進行後續治療觀察。而城中的百姓也被官府組織發動起來，進行全城的衛生大掃除。
有着嚴格的戶籍制度，官府對轄下的情況，也基本上是瞭如指掌。在疫病面前，誰也不敢怠慢。就這樣，官府配合軍隊，挨家挨戶的上門，進行檢察和通告。無論是士紳還是普通百姓，都第一時間表示了配合的態度。
除非誰願意自己家裡全家死絕，不然誰敢知情不報？張機和華佗也受劉備之命，組建了龐大的醫療隊伍，率先進入了兗州。
兗州爆發疫情的是陳留、濟北和任城這三郡國。其餘地方，根據各地彙報，暫時還無新的病例發現。
在兗州通向劉備地盤的所有通道都被軍控之後，劉備還是讓張飛給豫州的夏侯惇去了封信，告訴他兗州如今已經爆發瘟疫，讓豫州也做好防備。雖然是兩家勢力各自割據，但好歹明面上曹操還是沒有扯旗造反，都是大漢子民，劉備自然是心有不忍。
在接到張飛的信後，夏侯惇大驚，忙與諸將商議。然後使人去各地探查，並第一時間封鎖兗、豫兩州通道。在這個醫學還比較原始的年代，一場感冒都可能奪人性命，何況是動不動就搞大規模滅絕的瘟疫？
於是，很快，遠在益州的曹操、遠在揚州的孫堅都接到了消息。在瘟疫這種人類公敵面前，無人敢懈怠。外面假裝無事，內裡卻是暗暗調派了人手，嚴防死守。發誓一定要在源頭上斷絕疫情進入自己地盤的途徑。
張機與華佗的到來，讓張飛等人都鬆了一口氣。張機在看過病例後，心中卻不輕鬆。這種病，非常猛烈，人與大型牲口，都能互相交叉感染。而一旦染病，基本上十死無生。而病例表現在全身發熱、急喘，而後呼吸衰竭死亡。
張機心中又悲又痛，這種症狀，與孝靈皇帝年間，在荊州南陽爆發的疫情何其相似。他家中親人與族人，有許多人也被這樣的急病給奪去了寶貴的生命。這也是他棄官而從醫的根本原因。
漢靈帝在位期間，全國爆發大疫五次，疫病如惡魔，無情的奪去了無數無辜百姓的性命。不管是老人、青壯還是幼童，在疫病面前，他們毫無反抗之力，只能絕望的等死。當時無數地方，十室九空，而一戶皆死的人間慘劇，也到處可見。真是家家有位屍之痛，室室有號泣之哀，或闔門而殪，或覆族而喪。
漢桓帝永壽三年天下丁口約有5600餘萬，到八十年後的晉武帝太康元年，天下丁口只有1600餘萬。除去戰亂、災荒、隱戶等原因之外，東漢末年的無數次大瘟疫，毫無疑問佔據了重要原因。
從黃巾起義開始到天下諸侯討董，再到三國鼎立。這期間的所有戰爭，死傷的人再多，也不會有數千萬之巨。古代戰爭不像後世的現代戰爭，動不動就是殲滅戰。這會的軍隊，相對後世而言，戰損率並沒有那麼高。
根據收集起來的幾十餘病例，張機與華佗看過之後，便很快做出了判斷，這是一種傷寒類的疫病。官府必須立即介入干預，不盡快及時控制疫情的話，等它傳播開來，不知道要死多少人。
張飛、黃忠、太史慈等人一聽這病如此嚴重，當時表態，軍隊全力配合，讓張機華佗儘管吩咐。
他們也是經歷過漢靈帝年間大疫的人。雖然之前自己沒有中招，但現在身在疫區，誰知道會發生些什麼事。還是快點把這瘟疫給控制住了纔好。
在兩大當世名醫的主持下，各類藥材源源不斷的被收集起來。而張機與華佗，也正式開始了他們在兗州的醫療工作。大量的病例，將幫助他們源源不斷的刷經驗。爲以後的著作，再一次夯實了堅實的基礎。