自1888年建立研究所開始，從剛開始的幾十位外籍研究員，主要以仿造和模仿爲主的研究模式開始，經過了近30年的不懈努力，現在的研究所已經不能稱爲研究所了。
將近5000人的龐大研究隊伍，遍佈臺灣島上近20多個研究單位，研究項目從農業到工業，從土壤到化工，從鈕釦到飛機母艦數不勝數。而現在那艘漁船，已經基本被拆光了，除了劉芾藏起來的部分涉及個人信息的物品，其餘的都已經通過這些勤勞的研究人員的大腦和雙手，變成了一件件的科學發明和研究成果。
從軍事來說，海軍研究所、陸軍研究所、空軍研究所這3個最大的軍事研究單位在化工研究所、機械研究所、動力研究所、材料研究所等其他科研單位的配合下，用了近30年的時間，從頭到腳的把以前的臺灣現在南海聯邦軍隊武裝起來，從最初的步槍、子彈，到現在的裝甲車和加榴炮；從魚雷艇、潛艇到重巡、飛機母艦；從用木頭做骨架，綢布當蒙皮的飛行器，到全金屬骨架，半金屬機身的單翼飛機，可以說，沒有他們，就沒有臺灣的獨立，也就沒有南海聯邦。
除了這些軍事研究單位，還有更多的保密研究所，隱藏在深山中，在其中工作的研究員們，利用可以拿到的有限的未來材料和物品，利用他們的智慧和勤奮，不停的把各種研究成果拿出來，成爲了那些研究所做出最終產品的堅實後盾。
現在，南海聯邦除了已經被世人所知的神秘潛艇、恐怖魚雷、怪異驅逐艦和重巡、半自動步槍、裝甲車、速射火炮和一身怪異的軍服外，還有農藥、化肥、特種鋼材、磺胺藥品、家用汽車、載重汽車、石油產品、精密機械、柴汽油發動機等產品，以其不可替代的性能，遠銷世界各國。
除了這些明面上的科技產品之外，南海聯邦還成功的研製出大功率燃氣輪機、坦克、高效率電池、合成樹脂、晶體管、燃燒彈、鋁合金、星型發動機、新型抗生素等超出時代的科技或者產品，不過這些都作爲南海聯邦的秘密武器而被秘密保護起來，不僅外界不知情，就連南海聯邦的內部，也只有劉芾和幾位主要的研究負責人知道全部詳細情況。
另外，除了這些東西之外，劉芾還從1900年起，就在秘密研究一種東西，而負責研究這種東西的，是一位德國物理學家和一位法國物理學家，這兩位年輕的物理學家都是大衛在歐洲爲劉芾招募來的。
自從大衛第一次回國，幫助劉芾招募技術人員和技術工人開始，在這30多年的時間裡，大衛從歐美各國，利用金錢、研究經費、家庭關係和解決麻煩等各種手段，爲劉芾招募來了各種各樣的研究或者技術人員。
由於劉芾對這些人才的堅持不懈的追求，以至於有一段時間，大衛自嘲是這個世界上最富有的人販子，具施耐德反應，大衛和陌生人談話時，總是先問別人的專業、任職的單位和待遇，一旦覺得有機可乘，大衛就會拍打着支票本或者開出帶有很強誘惑力的條件，向對方提出跳槽的要求。
而在美國商界和學術界，大衛雖然有着樂善好施的美名，但也有着挖牆腳的惡名，在他名聲最臭的時候，很多美國和歐洲大學，都把大衛視爲惡魔，因爲很多有才華的學生或者教授，在和大衛接觸之後，就會很快辭職並消失。
在大衛招募來的各色研究員中，已經出現了好幾位非常有才華的科學家，他們都有一種或者幾種發明或者研究成果，而且由於豐厚的研究資金和各種新奇的研究課題的吸引，至少有3分之一的研究人員都選擇了加入**籍，並且在這裡安了家。
當然了，也不是所有人都會有機會進入臺灣的研究單位並且接觸到保密項目，只有那些在臺灣安家的研究人員，纔會有機會進入保密單位並接觸到那些未來的物品，而想要進入一個研究專門課題的小組，則必須是加入了臺灣籍並且在臺灣安家的研究人員，並且他們還要經過內務部的審覈和無處不在的監視。
這兩位物理學家都是從法蘭西學院的居里實驗室裡被挖來的青年人，雖然這裡沒有居里夫婦那樣的導師，但是這裡有着世界上都不能比的大規模資金投入和一位神奇的總統。
在十年前，兩個人剛來到臺灣的時候，他們不過是抱着好奇心來這裡看看的，雖然被大衛忽悠的不善，但是當時的科學圈子裡，聖地在歐洲，美國只是正在崛起，而亞洲算是科學研究的荒漠了，更別說一個小島了。
可是在聽說兩個人來自居里實驗室之後，這位總統就親自帶着兩個人蔘觀了幾家化學研究所，在觀看了研究所的規模和研究成果之後，這兩位年輕人就收起了輕視之心。
先不說研究所內大量的歐洲科研人員，只是那些昂貴的研究設備和完美的研究環境，就讓他們覺得這裡不僅比居里實驗室強，還比歐洲所有的研究機構都好。雖然他們不是化學專業，但是當時的科研人員一般都是精通幾種學科的，他們也能看出這些化學研究課題，都是自己沒見過的新東西，不僅沒見過，連聽說都沒有聽說過。
而隨後，這個姓劉的總統又把他們引上了一個欲罷不能的研究之路，因爲這位總統給他們描述了一個異常光明的核物理世界，他們的研究方向也就定了下來，專攻放射性元素鈾的提純，並對它們的原子結構進行進一步探索。
他們的核物理實驗室，以前一直設置在臺灣中部的高山裡，經過近十年的建設，已經從最開始的幾個人發展到了30多人，其中有近一半人，都是華人，他們中間大多數是從歐洲留學後回來的專業人員，雖然還都是一些學生，但是他們有知識、有熱情，唯一缺乏的就是研究環境和研究方向，而這些正是劉芾能提供的。
除了繼續大力發展科研單位，讓南海聯邦走上科技興國的這條快車道之外，還有一些普通的道路，也必須要走，比如說擴軍。
現在的南海聯邦陸軍只有4個常備師，總計11萬人左右，再加上海軍和空軍，也不足20萬人。以前這點軍隊都放在臺灣島上，已經足夠了，可是現在疆土擴大到了110萬平方公里，人口數量也增至2800萬人，這些軍隊就顯得非常少了。
現在第一山地師和第二師的部分駐守的安南三省，而第三師的部分一直駐守在棉蘭老島，在菲律賓加入南海聯邦之後，第一師也將離開臺灣島，進駐到呂宋省和宿務省，這下臺灣島上就剩下了第二師的部分軍隊和一些警察部隊了，整個一個空城計。
1916年10月，隨着國防部的一聲令下，在南海聯邦的10個省中，又開始了新一輪的擴軍。
這次擴軍的目標是陸軍增加4個師共計11萬人，海軍增加3個基地和2個飛機母艦編隊，共計5萬人，空軍增加5個基地和9座軍用機場，共計3萬人。
在南海聯邦的三個主要領土中，安南三省的人口數量最多，尤其原來的越南地區，人口已經過了千萬，是一個理想的兵源地。
不過安南三省和菲律賓三省加入的時間還比較短，而且菲律賓的人口比列嚴重失調。所以這次擴軍還是以臺灣爲主，在總共要招募的19萬人裡，將從臺灣招收近10萬人，剩下的9萬人主要從安南三省招收，菲律賓三省只分配2萬人左右。
由於海軍、空軍都需要有一定文化基礎，所以在臺灣籍的兵源中，大部分都將分配到海軍和空軍中去。而新招收的9萬其他民族新兵，將被分散到現有的3個師中間去，以老帶新，加快這些新兵的成長速度。而爲了保持一定的戰鬥力，第一山地師將分成第一和第二兩個師，全部接收臺灣籍的士兵。
爲了彌補臺灣的人口損失，南海聯邦政府計劃從安南三省向臺灣島移民50萬左右，在這些移民的選擇上，聯邦政府特意選擇了當地的少數民族爲主，並沒有從當地的幾十萬華人中選擇，以免造成華人過於抱團聚居，而減少了和其他民族的交流。只有人爲的把各民族打散居住，才能加快民族的融合速度。